新製品情報化学データ可視化・解析ソフトウェア CIMPL：SureChEMBLデータベース検索機能 CIMPLは、ライブラリー解析、構造活性相関（SAR）解析、データベース/Webサービスアクセスの機能により、メディシナルケミストの創薬研究を支援するソフトウェアです。新バージョン2.0545がリリースされ、 SureChEMBLデータベース検索機能が新規に搭載されましたので、その機能を紹介します。 ■ SureChEMBLデータベースについてネぺジルの1置換体のみを収集したところ、15分子が登録ら抽出して開発したデータベースです。に置換基が導入された分子が特許に登録されていました。 SureChEMBLデータベースは化学構造データを特許かされていました。図 2のドネぺジルの基本骨格の R1 ～ R7 位英国の出版社マクミランの一部門であるDigital Science の製品の1つSureChem のデータを、欧州分子生物学研究所（EMBL）の一部門である欧州バイオインフォマティクス研究所（EBI）とともにパブリックドメインで公開したものです。 SureChEMBL には1500 万を超える化学構造・化合物特許情報データが登録されています。オープン化されたことにより、開発した薬や化合物が今までにない全く新し図2　ドネぺジルの分子構造（ドネぺジルはR1=H, R 2=CH3, R 3=CH3, R 4 =H, R 5=H, R 6 =H, R7=H） R1 には 2 種、R 2 に 3 種、R 3 に 2 種、R 4 に 3 種、R 5 に 2 種、いものであるかどうかを、誰でも自由に調べることができ R 6 に 2 種、R7 に1種の置換体が登録されていました。そのるようになりました 1）2）。いくつかの概要を以下に示します。 ■ SureChEMBLデータベース検索機能 CIMPL は今回新たに SureChEMBLのデータベース（2015 年3月19日まで）を内蔵しました。ローカルのデータベース ◆R1=FあるいはCl R1 にフッ素原子あるいは塩素原子が導入された分子構造が WO-2014008629-A1に登録されていました（図 3）。この置換は活性向上を目的として行われていました 5）。に対して検索することで、分子構造を外部に出さずに、複数（EP、JP、US、WO）の特許情報が一度に検索できます。 SureChEMBLデータベース検索では、部分構造検索、フィンガープリントを用いた類似構造検索が行えます。検索結果としては、分子構造を表す S M I L E S 、 SureChEMBL ID 番号、特許番号（EP、JP、US、WO）の表が出力されます。SMILES は CIMPL の機能により分子構造に変換することができます。特許番号をダブルクリックすると SureChEMBLへのリンクが起動し、詳細情報の閲覧や PDF ファイルのダウンロードが行えます（図 1）。図3　WO-2014008629-A1フロントページ 5）（C=O）OCH2CH3 ◆R 4 = ドネぺジルの新規合成法の特許（EP-1386607-A1）に前駆体構造として登録されていました（図 4）。2 つのフラグメントのカップリング反応により前駆体を合成し、加水分解と脱炭酸反応により、最終生成物を得ています 6）。リンクを起動 SMILES から分子構造へ変換図1　SureChEMBLデータベース検索画面と結果の表示図4　EP-1386607-A1フロントページ 6） ■ 応用事例紹介：ドネぺジルの部分構造検索 ■ まとめリン（ACh）の加水分解酵素であるアセチルコリンエステベース検索が行え、データベース構築の手間を省くことがラーゼ（AChE）を可逆的に阻害することにより、ACh の分できます。解を抑制し濃度を高め、アルツハイマー型認知症の進行 1）https://www.surechembl.org/ ドネペジル塩酸塩（商品名アリセプト）は、アセチルコ 3）を遅らせる薬です。 CIMPLを導入するだけで、すぐに SureChEMBLデータ 2）http://www.ebi.ac.uk/about/news/press-releases/ 応用事例としてドネぺジルをクエリとして部分構造検索を行った結果を紹介します。 SureChEMBL 3）http://www.aricept.jp/about/behavior.html まず、ドネぺジルをクエリとして部分構造検索を行ったところ、85 件のヒットがありました。このデータセットから分 4）子構造を構築し、Matched Molecular Pair 解析を行い、ド 4）Hussain, J. et al., J. Chem. Inf. Model. 2010, 50 , 339. 5）https://www.surechembl.org/document/WO2014008629-A1 6）https://www.surechembl.org/document/EP-1386607-A1 3