Original Article(Clinical haemophilia )‒ Full Translation HLA クラス II 対立遺伝子に対する FVIII 由来ペプチドの in silico 計算 による親和性は,F8 遺伝子にミスセンス変異を有する血友病 A 患者の インヒビター発生を予測する In silico calculated affinity of FVIII- derived peptides for HLA class II alleles predicts inhibitor development in haemophilia A patients with missense mutations in the F8 gene A. D. Pashov, T. Calvez, L. Gilardin, B. Maillère, Y. Repessé, J. Oldenburg, A. Pavlova and S. V. Kaveri and S. Lacroix-Desmazes on behalf of Abirisk Consortium Centre de recherche des Cordeliers, INSERM, UMR S 872; Centre de Recherche des Cordeliers, Université Pierre et Marie CurieParis6, UMR S 872; Centre de Recherche des Cordeliers, Université Paris Descartes, UMR S 872, Paris, France; Department of Immunology, Institute of Microbiology, BAS Sofia, Bulgaria; Inserm et UPMC, UMR S 943, Paris; CEA, iBiTecS, Service d’ Ingé nierie Molé culaire des Proté ines, Labex LERMIT et VRI, Gif Sur Yvette; Laboratoire d’ hé matologie, CHU de Caen, Caen, France; Institute of Experimental Haematology and Transfusion Medicine, University Clinic Bonn, Bonn, Germany; and International Associated Laboratory IMPACT ( INSERM, France– Indian Council of Medical Research, India) , National Institute of Immunohaematology, Mumbai, India 要約:血友病 A( HA )患者の 40% が F8 遺伝子に 来ペプチドの HLA クラス II に対する親和性が,イ ミスセンス変異を持つ。しかしながら,同一変異患 ンヒビター発生と関連付けられるかについて検討 者のすべてが同様の第 VIII 因子( FVIII )インヒビ した。ミスセンス変異が報告された 1456 例と対応 ター発生リスクに曝されてはいない。重症 HA 患者 す る, 主 な 野 生 型 FVIII 由 来 ペ プ チ ド の HLA ク において,ヒト白血球抗原( HLA )ハプロタイプが, ラス II 対立遺伝子 10 種類に対する親和性につい FVIII インヒビター発生の危険因子として同定され た。我々は,内因性 FVIII にミスセンス変異を生じ ると,HLA クラス II に対する変異ペプチドの親和 性が変化することにより,FVIII 特異的 T 細胞寛容 を歪め,補充療法中,対応する野生型 FVIII 由来ペ プチドによる抗 FVIII 免疫応答の誘導リスクが上昇 するという仮説を立てた。本稿では,Haemophilia A Mutation, Structure, Test and Resource データベー ス収載のミスセンス変異に対応する野生型 FVIII 由 て,平均値を予測した。線形回帰分析により,予 Correspondence: Sé bastien Lacroix- Desmazes, INSERM UMRS 872, Team 16, Centre de recherche des Cordeliers, 15 rue de l’Ecole de Médecine, F-75006 Paris, France. Tel.: +33 1 44 27 82 02; fax: +33 1 44 27 81 94; e-mail: [email protected] Haemophilia (2014), 20, 176–184 © 2013 John Wiley & Sons Ltd 4 測されるペプチド親和性の平均値と,変異インヒ ビターの状況との間に有意な関連が確認された( P = 0.006 )。FVIII ドメインの変異部位調整後には, 有意差が消失した。A1-A2-A3-C1 ドメインの解析 では,予測される HLA 結合親和性とインヒビター の状況との間に正の相関が認められたが( 三分位 値の低親和性については,OR = 0.29[ 95% CI: 0.14 ∼ 0.60 ],P = 0.002 ),C2 ドメインに限定し た解析では逆相関が示された( OR = 3.56[ 95% CI:1.10 ∼ 11.52 ],P = 0.03 )。FVIII ペプチドの ミスセンス変異患者の HLA 対立遺伝子への親和性 が FVIII 製剤の免疫原性に重要な役割を果たしてい ることを本研究データは立証するものである。 Key words:第 VIII 因子,免疫原性,MHC クラス II,ミスセンス変異,予測,T 細胞エピトープ HLA クラス II 対立遺伝子に対する FVIII 由来ペプチドの insilico 計算による親和性は,F8 遺伝子にミスセンス変異を有する血友病 A 患者のインヒビター発生を予測する 性の抗 FVIII IgG( 5,6 )および FVIII 反応性 T 細胞( 7–9 ) 緒 言 が循環しても,中和抗イディオタイプ抗体( 10,11 ) 血友病 A( HA )は,凝固因子である第 VIII 因子 および制御性 T 細胞( 12 )により制御される( 関連レ ( FVIII )をコードする遺伝子の変異に起因する,稀 ビュー( 13 ))。従って,「 後天性血友病 」と呼ばれる な X 連鎖劣性遺伝性の出血性疾患である。HA 患 非血友病患者における病原性の抗 FVIII 免疫応答 者は FVIII 活性( FVIII:C )値の残存レベルに基づ は極めて稀な事象であり,発生例は毎年 100 万人 き,その血漿と正常な血漿との比較により識別され 当たり 5 人にも達しない( 14 )。一方,CRM 陰性 HA る( 1 )。即ち,重症表現型を呈する患者の FVIII:C は 患者の免疫系は,FVIII に対する教育を受けていな 検出不能レベル(< 1% )であるのに対し,中等症お い。そのため,抗イディオタイプ B 細胞のクロー よび軽症の HA 患者の場合,残存する血漿 FVIII:C ンおよび制御性 T 細胞は産生されないと考えられ, はそれぞれ 1 ∼ 5% (注:欄外参照) , 5 ∼ 40% である。 患者が治療用 FVIII に対し同種免疫をもつリスクは 重症 HA 患者のうち,交差反応性物質( CRM )陽性 高く,そのリスクは経験的に 15 ∼ 50% の間であ である患者群では循環血中に変異 FVIII 分子がみら ると推測されている( 15 )。興味深いことに,HA 患 れる一方,CRM 陰性である患者群では変異分子が 者の約 40% に相当する( 16 )ミスセンス変異を有す みられないという事実は,HA 患者集団の不均一性 る CRM 陽性患者は,中間的状況に当たり,その免 をより一層増大させている。こうした表現型の不均 疫系は「 ほぼ正常 」な FVIII に対する教育を受けて 一性は,FVIII の不活化をもたらす多種多様な遺伝 いる。治療用の野生型 FVIII が投与されると,議論 子異常に起因している。これには,大小の欠失,ナ の的となっているハプロタイプの差を例外とすれ ンセンス変異を生じる一塩基置換,スプライス部位 ば( 17,18 ),ミスセンス変異を担う内因性 FVIII のペ のミスセンス変異または変化,イントロン 1 または プチドが FVIII 製剤分子のペプチドに対応していれ イントロン 22 の逆位,ヌクレオチドの欠失/挿入 ば,制御性抗体および制御性 T 細胞に直面しない。 (2) などが挙げられる 。 FVIII 製 剤 補 充 療 法 は,HA 患 者 の 出 血 性 エ ピ ソードを抑制する治療選択肢である。残念ながら, HA 症例の 5 ∼ 40% において,FVIII 注射製剤に 対 し,IgG ア イ ソ タ イ プ で あ る 抗 FVIII 抗 体( イ 従って,CRM 陽性患者は,FVIII 製剤に対し部分 的に寛容であり,FVIII インヒビター発生リスクが 低く,5 ∼ 10% の範囲であると報告されている。 遺伝と環境の両方からなる複数の危険因子は, り,生活の質を悪化させ,治療費の大幅な増加をも FVIII インヒビターの発生と関連している。遺伝 的 危 険 因 子 に は,HA の 重 症 度, よ り 具 体 的 に は FVIII 障害の原因となる遺伝子異常型( 19 )が挙 げられ,また可能性として患者の内因性 FVIII と 治療用の外因性 FVIII 分子とのハプロタイプミス たらす( 4 )。 マッチ( 17,18 ),免疫応答の制御に関与する遺伝子( す ンヒビター)を産生する同種免疫応答が発生する。 そのため本治療は困難をきたす( 3 )。FVIII インヒ ビターの発生により,患者の臨床管理は困難にな 個体の免疫系が FVIII を判断する方法は,内因性 なわち,TNFα,IL-10,CTLA-4 )プロモーター多 の FVIII 分子の存在自体および性質により指示され 型の存在( 20–23 ),ヒト白血球抗原( HLA )系の一部 る。従って T 細胞および B 細胞が個体発生過程で の主要組織適合遺伝子複合体( MHC )クラス II ハ それぞれ胸腺,骨髄で受ける教育によって指示され プロタイプ( 23–26 )などがある。 ることとなる。健康な個体の場合,FVIII は免疫系 ミスセンス変異患者の場合,一部のミスセンス に提示され, 免疫系によって認識される。その結果, 変異は,インヒビター発生について他のミスセン 一部の非血友病個体では,自然抗体である自己反応 ス変異と比較した場合,4 倍の高リスクと関連付け られている( 16,27 )。しかしながら,補充療法後,同 注 )原著では 2 ∼ 5%となっていますが以下の資料をもとに変更しました。 ・インヒビターのない血友病患者に対するガイドライン( 2013 年改訂版) ・インヒビター保有先天性血友病患者に対するガイドライン( 2013 年改訂版) じような変異を有する患者のすべてが FVIII インヒ ビターを発生するわけではない。例えば,Eckhardt 5 Full Translation: A. D. Pashov, et al. ら に よ る 研 究 は,Arg593Cys 変 異 患 者 52 例 中 8 ( 27 ) 例がインヒビターを発生することを見出した 。 スコドン生成例を除去した( 585 例 )。抗原発現確 認例( すなわち,FVIII:Ag および/または FVIII:C 興 味 深 い こ と に,HLA-DRB1*01,DRB1*11, が 陽 性,1129 例 )を 解 析 対 象 と し て 保 持 し た。 DRB1*15 など特定の HLA クラス II ハプロタイプ インヒビターの状況と FVIII 変異との関連の有無に が,同様のミスセンス変異を共有するインヒビター ついて,「 いいえ」と「 はい 」以外の回答例を除去し ( 28 ) 陽性患者コホートに高頻度に認められている 。 た( 571 例 )。サイレント変異例を除去した( 3 例 )。 総合すると,こうした知見から,患者の MHC クラ B ドメイン変異例を除去した( 3 例―インヒビター ス II 分子と,外因性の治療用 FVIII 由来ペプチド との関連性がないため) 。こうして得られた計 1456 との結合親和性の重要性が指摘される。本研究で 例は,FVIII 分子の各種変異 500 例,変異部位の は,in silico 予測により,HLA クラス II 対立遺伝 差異 383 例であるとみなした( Table 2 )。変異の約 子に対する治療用 FVIII 由来ペプチドの親和性が, 64%( 321 / 500 )は単独例,30%( 149 / 500 )は 2 ∼ ミスセンス変異をもつ HA 患者の FVIII インヒビ ター発生と関連付けられるかどうかについて検討 した。 方 法 血友病 A に関連する FVIII 変異の HAMSTeRS データベース Haemophilia A Mutation, Structure, Test and Resource( HAMSTeRS )は,HA の原因となる遺伝 子異常のパブリックドメイン中最大のリポジトリ ( 29 ) 。今回の解析実施時 である( http://hadb.org.uk/ ) 点では計 3783 例が登録され,3747 例が FVIII 塩基 。 配列のエクソンにおける点変異であった ( Table 1 ) 解析例を以下の手順でさらに絞りこんだ。ナンセン 6 HLA クラス II 対立遺伝子に対する FVIII 由来ペプチドの insilico 計算による親和性は,F8 遺伝子にミスセンス変異を有する血友病 A 患者のインヒビター発生を予測する 10 例,6%( 30 / 500 )は 10 例以上である。最も 代表的な変異は R593C( 75 例),R2150H( 50 例 ), R2159C( 40 例 ),R531C( 34 例)であった。一部 の解析では,重症度( 重症/中等症/軽症 HA )の 情報が入手できなかった 115 例を除き,変異例を 重症度によりさらに 3 クラスに細分した。 野生型 FVIII の塩基配列 野 生 型 ヒ ト FVIII の 塩 基 配 列 は, 複 数 の ウ ェ ブ サ イ ト( http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/ AAA52484. 1, http: / / www. uniprot. org/ uniprot/ P00451 )から FASTA フォーマットで入手可能で ある。 る 15 アミノ酸長のペプチドに自動分割し 2337 本 とした。HLA クラス II 対立遺伝子のうち,欧州で 最も多くみられる対立遺伝子について,IEDB ウェ ブサイトに提示されている中から 10 種類( HLA DR- B1* 0101, 0301, 0401, 0701, 0901, 1101, 1201,1301,1501,1502 )を選択した。予測結果 を表にし,15 アミノ酸長のペプチドと 10 種類の HLA 対立遺伝子との各組み合わせを 1 行に記す ( Table 3 )。従って,作業ファイルには,0 ∼ 100 の 範 囲 の 予 測 パ ー セ ン タ イ ル 順 位 が 23370 件 ( 2337×10 )記載された。 統計解析 デ ー タ 解 析 対 象 は,3 ク ラ ス に お け る HA の IEDB Analysis Resource 「 Immune Epitope Database( IEDB ) Analysis Resource 」ウェブサイトから,各種ペプチドと多 数の HLA クラス II 分子との結合状況が予測され る( 30 )。 本 サ イ ト で は,5 種 類 の ア ル ゴ リ ズ ム ( NN-align( 31 ),SMM-align( 32 ),コンビナトリアル ,ARB[ average relative ライブラリー[ CombLib ] binding ]マ ト リ ッ ク ス( 33 ),netMHCIIpan( 34 ), Sturniolo 法( 35 ))と 1 種類のメタアルゴリズム( コ 重 症 度,FVIII の 重 鎖( B ド メ イ ン を 除 く )ま た は 軽 鎖 の 変 異 部 位,FVIII ド メ イ ン( A1-A2-A3- ス法は,3 種類以上の方法により結合が予測可能で C1-C2-a1-a2-a3 統合領域 )の変異部位の 3 因子と した。最終的に,インヒビターの誘発( Table 4 ) と,HAMSTeRS データベース登録患者毎の内因 性 FVIII 変異ペプチドに対応する,野生型外因性 FVIII ペプチドに予測される無差別性との相関につ いて検討することを目的とした。点変異毎に,15 アミノ酸長のフレーム 15 本に変化が生じる( 例え ば,R593 に つ い て は Table 3 参 照 )。 各 対 立 遺 伝 子については,影響を受ける 15 アミノ酸長のペプ ある場合,いつでも適用される。コンセンサス法 チド中最も可能性が高い( パーセンタイル順位が は,パブリックドメインで入手可能な他の方法に比 最小の )エピトープのみを考慮した。免疫原性は, べ,無差別の MHC クラス II エピトープの検出に 10 種類の対立遺伝子のパーセンタイル順位最小値 ンセンサス法( 36 ))が提供されている。コンセンサ ( 37 ) 優れた結果を示すことが報告されている 。対立 遺伝子によっては,コンセンサス法の予測因子の一 から平均値を採ることで予測した。この統合尺度 を「 結合スコア 」と呼ぶ( Table 3 )。「 結合スコア 」 部を入手不能であることから,コンセンサス法は は,あるペプチドと 10 種類の HLA-DR 対立遺伝 適用できない。今回の例では,IEDB の推奨方針に 子の予測親和性の平均値を表すものである。その より,次の効率順で利用可能な方法から選択する。 ため,ペプチドに対する「 結合無差別性( binding コ ン セ ン サ ス 法 > NetMHCIIpan > NN-align > promiscuity )」と呼ばれることもある。 Stata ソフトウェア( version 12, StataCorp LP 社 , 米国 , テキサス州 College Station )を用いてロジス ティック回帰分析を実施した。HAMSTeRS データ SMM-align > CombLib。すなわち,本研究では,個々 の対象対立遺伝子について IEDB 推奨法を使用す 「パーセンタイル順位」 る。結果は 0 ∼ 100 の範囲の に置き換えられ,0 の場合には所定の HLA 対立遺 伝子との結合親和性が高く,100 の場合には結合親 和性が低いことを表す。 FVIII 分子の全配列( 2351 アミノ酸 )を,隣接す ベースの情報例は統計単位で表し,従属変数はイ ンヒビターの状況とした。また独立変数は,HA の ,変異部位( ポリペプチド鎖およ 重症度( 3 クラス) びドメイン ) ,「 結合スコア 」 ( 本ソフトウェアによ 7 Full Translation: A. D. Pashov, et al. り自動的に三分位に分割 )とした。本研究は,2011 年 10 ∼ 11 月に利用可能であった HAMSTeRS デー タベースを用いて実施した。本研究のため,最新の データベース( 2012 年 12 月 )を用いて再度分析を 実施し,両解析結果とも同一の結果が得られた。 結 果 FVIII 分子のミスセンス変異の分布 最初に点変異患者を HAMSTeRS データベース でスクリーニングした。コード配列のミスセンス変 異が,FVIII:Ag および FVIII:C の検出と関連付け ,ならびに患者にインヒ られる例( CRM 陽性患者) ビター発生が報告されている例を選択した( Table 1 )。今回の選択基準では,FVIII の A1a1A2a2 およ び a3C1C2 ドメインのミスセンス変異を有した適格 例を 1456 例同定した。このうち FVIII のアミノ酸 変異部位が 383 例,異なるアミノ酸への置換が 500 例を占めた( Table 2 )。これは FVIII 分子の 907 ア ミノ酸長の B ドメインにおいて少数報告されてい るミスセンス変異について,B ドメインは FVIII 活 性に役割を果たさないという事実を示している。そ のため,B ドメインは解析対象としなかった。既報( 2 ) では,F8 遺伝子点変異の約半分( 53% )が,FVIII 分子の重鎖によるものである。今回の選択基準を用 8 HLA クラス II 対立遺伝子に対する FVIII 由来ペプチドの insilico 計算による親和性は,F8 遺伝子にミスセンス変異を有する血友病 A 患者のインヒビター発生を予測する いたところ,F8 遺伝子ミスセンス変異が,A1 およ 結合スコアは,HAMSTeRS データベースに報告さ び A2 ドメインに同様の割合( 54% )で認められた。 れた,ミスセンス変異に対応する野生型ペプチド毎 各ドメイン長の補正後では,今回選択したミスセン に作成した。予測される親和性の平均値,すなわち ス変異の発生範囲は,A1,A2,A3 ドメイン( 30.0 10 種類の HLA-DR 対立遺伝子に対する無差別性を ± 1.6% )の方が C1,C2 ドメイン( 22.9 ± 3.0% )よ 表す各ペプチドの結合スコアを用いて,次に対応す 。 りも大きかった( P = 0.038 ) る変異について,HAMSTeRS に報告されていると おり,インヒビター陽性か陰性のいずれかの状況と HAMSTeRS データベースにおけるインヒビター の存在と関連付けられる因子 ミスセンス変異患者の 6.52% においてインヒビ ターの存在が報告された( 95% CI:5.31 ∼ 7.92% ) 。ミスセンス変異患者間の HA の重症度 ( Table 4 ) は,インヒビターの存在と有意な関連を示さなかっ た( P = 0.163 )のに対して,インヒビター発生頻 度は各ドメインの変異部位と統計的に有意な関連 , A2[ 7.79% ],A3[ 4.71% ], を示した( A1[ 2.02% ] a1a2a3[ 0.89% ],C1[ 10.33% ],C2[ 12% ],P < 0.001 ) 。しかしながら,FVIII の軽鎖,重鎖の変 異部位とは関連を示さなかった( P = 0.087 )。 関連付けた。 各ペプチドと 10 種類の HLA クラス II 対立遺伝 子との結合スコアは,インヒビターの存在と有意な 関連を示した( Table 5 )。すなわち,結合スコアの 平均値は,インヒビター陰性例の場合 10.01( 9.54 ∼ 10.48 ),インヒビター陽性例の場合 7.36( 6.32 ∼ 8.40 )であった( P = 0.002 )。ここで注目すべきは, この有意な関連性が HA の重症度の調整後( P = 0.002 ),および HA を引き起こすミスセンス変異 を担う FVIII ポリペプチド鎖の調整後( P = 0.004 ) とも持続したことである。これに対し,ミスセン ス変異を担う性質がある FVIII ドメインの調整後に は,有意な関連性が消失した。 予測結合スコアとインヒビターの存在との 関連性 HAMSTeRS データベースから選択された変異ペ プチドに対応する野生型 FVIII ペプチドについて, それぞれ結合スコアを予測した。R593 における一 例 を Table 3 に 示 す。R593 を 網 羅 す る 15 ア ミ ノ 酸長の各ペプチドについて,解析対象の 10 種類の HLA-DR 対立遺伝子毎に IEDB を用いてパーセンタ イル順位を予測し,15×10 のマトリックスを作成し た。HLA-DR 毎に,15 アミノ酸長 15 本のペプチド 。 のパーセンタイル順位最小値を選択した ( Table 3 ) 次に,この 10 種類のパーセンタイル順位最小値 から,10 種類の HLA-DR 対立遺伝子の平均値を 算出した。これを「 結合スコア」と呼ぶ( Table 3 )。 次に,結合スコアを自動的に三分位に分割するこ とにより,カテゴリー変数に変換した。その結果は Table 5 と一致し,結合スコアが最小のペプチド( 予 測される親和性の平均値が最も高いペプチド )に変 異を認める場合,インヒビターの割合は有意に高 くなった( P = 0.006,Table 6 )。重症度,個々の FVIII ドメインの部位,FVIII の重鎖/軽鎖の部位 によるインヒビターの割合について二変量解析を P 値はそれぞれ 0.168,< 0.001,0.086 行ったところ, であった( Table 4 と一致 ) 。インヒビターの割合 と結合スコアとの関連性は,HA の重症度およびミ スセンス変異を担うポリペプチド鎖の調整後,多 変量解析においてなお統計的に有意であった( P = 0.0013 )。これに対し,個々のドメイン調整後の多 9 Full Translation: A. D. Pashov, et al. 変量解析では,統計的有意性が消失した( Table 6, P = 0.113 ) 。よって,本解析におけるそれぞれの ドメインの重要性についてより詳細に検討した。 A1,A2,A3,C1 の統合ドメインの重要性と, C2 ドメインの重要性を分けて検討した。A1,A2, A3,C1 ドメインを解析したところ,変異ペプチ ドがインヒビター陽性である状況と,対応する野 生型 FVIII ペプチドの結合スコアとの間に,統計 的に有意な関連性が認められた( Table 7,それぞ 。同様に,C2 ドメイン単独で解析す れ P = 0.002 ) ると,予測結合スコアと,各ペプチドと関連付け られるインヒビターの状況との間に有意な関連性 。なお,C1 および A ファ が示された( P = 0.03 ) ミリードメインでは,この関連性については,イ ンヒビター関連変異に対応するペプチドに対し低 た。しかしながら,C2 ドメインの場合,結合スコ 結合スコア( 予測される親和性の平均値が高値 )で アとインヒビターの状況との OR は逆相関を示した あるという当初の仮説と一致した( 予測される親和 ( 予測される親和性の平均値が低い[ 結合スコアの 性の平均値が低い[ 結合スコアの三分位が高い ]場 三分位が高い ]場合,OR = 3.56[ 95%CI = 1.10 ∼ 合,OR = 0.29[ 95%CI = 0.14 ∼ 0.60 ])と な っ 11.52 ])。この結果から,C2 ドメインの変異ペプ 10 HLA クラス II 対立遺伝子に対する FVIII 由来ペプチドの insilico 計算による親和性は,F8 遺伝子にミスセンス変異を有する血友病 A 患者のインヒビター発生を予測する チドに対応する野生型 FVIII ペプチドは,本解析対 解析とは異なり( 2 ),本研究例のインヒビターの状 象の HLA-DR 対立遺伝子全セットとの結合親和性 況は HA の重症度と関連付けられないことが示さ が高くなく,無差別性を示す度合いが低いものであ れた。こうした結果が得られるのは,今回の解析対 ると示唆される。従って,FVIII 分子の残りのエピ 象患者が,血漿により測定される FVIII の残存活性 トープとは異なり,C2 ドメインの変異では,イン に関わりなく,すべて CRM 陽性であり,対象患者 ヒビター誘発リスクの最大化と,無差別性の低いエ の免疫系が,内因性の変異 FVIII に対する教育を受 ピトープの減少とが関連付けられた。 けているためだと考えられる。今回の解析は,本研 究例のインヒビターの状況が,FVIII 重鎖または軽 鎖の選択的な変異部位と関連付けられないことも 考 察 示している( 2 )。 今回のデータが示すとおり,ミスセンス変異をも 本研究の仮説どおり,今回の結果には,HLA に つ HA 患者においては,複数の HLA クラス II 対立 対する野生型 FVIII ペプチドの予測親和性の平均値 遺伝子に対する FVIII 由来ペプチドの予測親和性の (無差別性)と,解析対象の対応する各変異ペプチ 平均値は,FVIII インヒビターの発生と関連付けら ドに対するインヒビターの状況との間には,統計的 れる。FVIII 分子の大きさから,結合アッセイを用 に有意な関連が認められた。ここで注意すべきは, いて今回の in silico 予測を確認することは不可能で HAMSTeRS データベース収載の各患者の HLA ハ ( 38 ) 。ここで重要なのは,IEDB のコンセン プロタイプ自体は入手できないことである。そのた サス法の予測検出力の検証が実際の結合データに め,今回の方法では,公開されている野生型 FVIII 先立って実施され,所定の親和性の閾値に対する分 の塩基配列を用いて得られるペプチドを対象に, 類が行われていることである。この場合,親和性の 閾値 1 μM についてプロットした受信者動作特性曲 HLA クラス II 対立遺伝子に対する in silico 予測に よる親和性と,FVIII 変異およびインヒビターの状 線の曲線下面積は約 0.8 であった( 36,39 )。注目すべ 況に関する経験的な臨床データとを単に人為的に関 きは,in vitro において HLA 対立遺伝子との結合 連付けている。従って,今回得られた統計的に有意 を認めるすべてのペプチドが,in vivo において必 な関連性は,HA 患者が外因性 FVIII に寛容である あった ( 36 ) ずしも T 細胞応答を誘導しないことである 。 場合,ペプチドと HLA の相互作用とそれに伴う各 各ミスセンス変異が FVIII インヒビター発生リス 種 T 細胞の形成が重要な役割を果たしていることを クに及ぼす影響を具体的に研究するため,また HA 示すものである。今回の結果は,各個体の HLA ハ 患者における不完全長 FVIII 分子産生例,または T プロタイプに関し,野生型 FVIII 由来ペプチドによ 細胞個体発生中の胸腺における不完全長 FVIII 分子 るインヒビター発生に対し予測される親和性の平均 提示例と考えられる例を対象とすることにより,生 値(すなわち無差別性)の確定に道を開くものであ じ得る不均一性を最小化するため,完全長 FVIII が る。これにより,臨床試験では,CRM 陽性患者の 産生されないと関連付けられるミスセンス変異を 免疫系の状況,HA を引き起こすミスセンス変異, 本解析から除外した。よって,今回の解析では,収 HLA-DR ハプロタイプが同定され,対応する野生型 載例 1456 例に対応する,異なる型の変異 500 例に ペプチドの in silico 予測による親和性が適合する。 付随する異なる変異アミノ酸 383 例に焦点を当て こうした関連性は,これまでの研究でも in silico た( Table 2 )。重要なのは,こうした選択例を用い において示唆されてきたが( 41,42 ),今回の研究では, た場合,FVIII 分子の様々なドメインにおけるミス 変異が位置付けられているドメインを多変量解析 センス変異の分布と,インヒビター関連の変異の分 により調整後,この統計的有意差が消失することを ( 19,40 ) の分布と本質的に類似することで 明らかにした。本稿の仮説どおり,A1,A2,A3, ある。さらに今回の解析からは,ミスセンス変異患 C1 ドメインの変異部位のみを対象にした解析では, 者集団においては,HA 患者集団全体を対象とする 変異ペプチドがインヒビター陽性である状況と,低 布が,既報 11 Full Translation: A. D. Pashov, et al. 結合スコア( HLA クラス II に対応する野生型ペプ 少なくとも 1 つに対応することが認められている チドに予測される親和性の平均値が高値 )との間に ( データは示されていない ) 。例えば,W2229C 変 統計的に有意な関連性を認めた。反対に,C2 ドメ 異は,2 種類の HLA-DR 対立遺伝子( DRB1*0301, イン単独で変異部位の解析を行ったところ,変異ペ DRB1*1101 )のみ高結合親和性を示すと予測され プチドがインヒビター陽性である状況は,HLA ク る領域に生じるが,インヒビター陽性である状況に ラス II 対立遺伝子に対し,野生型ペプチドの無差 関連付けられるのは対象例の 32% である。加えて, 別性のレベルが低い方が高頻度にみられることを 複 数 の「 高 リ ス ク 」F8 遺 伝 子 型 が FVIII の C2 ド 示した。 メインに位置付けられている( W2229C,P2300L, にわたる親和性の平均値( 結合スコア )を分析し ( 18,45 ) N2286K ) 。しかしながら,C2 ドメインの疎 水性が FVIII 分子のそれ以外のドメインに比べ上昇 た結果,FVIII 分子における無差別または免疫優 している( 46 )ことが今回認められた差異の原因なの 性の T 細胞エピトープの存在が明らかとなった。 か,あるいは C2 ドメインがフォン・ヴィレブラン van Haren らは,本研究対象の対立遺伝子に一致 する HLA ハプロタイプを持つ健康供血者 4 名の 単球由来樹状細胞から,FVIII 由来ペプチドを分 離している( 43 )。同定されたペプチドは,FVIII 分 ド因子( 47 )または活性化膜のリン脂質に結合する際 今 回 10 種 類 の HLA ク ラ ス II 対 立 遺 伝 子 全 体 子のすべてのドメインから生じたものである。本 に果たす役割がそうであるのかは,未だ解明されて いないままである。 謝 辞 知見とは対照的に,Steinitz らによる最近の研究で 本研究は国立保健医学研究所( INSERM ),フラ は,免疫優性のペプチドが,C2 ドメインを除くす ンス国立科学研究センター,ピエール・エ・マリー・ べての FVIII 分子のドメインに存在することが示さ キュリー大学( パリ VI 大学 ),Partenariats Hubert ( 44 ) FVIII に関する免疫処置により抗 C2 抗体が生じて も,C2 ドメインのエピトープに反応する T 細胞ハ イブリドーマはみられなかった。C2 の変異ペプチ Curien( Programme RILA 2011,25250XM ),フラ ンス国立研究機構( ANR-07-MRAR-028-01 )の支 援を受け,CSL-Behring S.A. 社( フランス , パリ ) および助成契約番号( 115303 )の下で画期的新薬 構想合弁事業( Innovative Medicines Initiative Joint Undertaking )から助成を受けた。助成内容は,欧 州連合第 7 次フレームワーク計画( FP7 / 2007 ∼ 2013 年 )からの出資,および EFPIA 加盟企業の同 ドに対応する野生型ペプチドと,残りのドメインの 種の出資からなるものである( より詳細な情報につ 変異部位に対応する野生型ペプチドにより得られ 。LG は いては,www.abirisk.eu を参照されたい ) た今回の結果の不一致は,上記知見に一致するも INSERM( フランス , パリ )の客員研究員であった。 れている 。Steinitz らのグループは,A1,A2, B,A3,C1 ドメイン由来ペプチドに対し増殖す る FVIII 欠乏 E17 HLA-DRB1*1501 トランスジェ ニックマウスから,CD4 + T 細胞ハイブリドーマ を作製することが出来たのである。しかしながら, のである。さらに,免疫原性を定義する複数の因 子は,FVIII 分子の様々なドメインに等しい影響を 及ぼさないことが示唆される。重要なことは,高 結合スコア( 複数の対立遺伝子に対し予測される親 和性の平均値が低値 )であっても,その野生型ペプ チドが,分離された一部の HLA 対立遺伝子の優れ 各著者の貢献度 ADP,TC,SVK,SLD は本研究をデザインし, 本稿を執筆した。ADP,TC,LG,YR,SLD は本 研究を実施した。ADP,TC,LG,BM,JO,AP, SLD は本データを解析した。 たエピトープでないという意味ではないことであ る。それどころか,C2 ドメインの変異部位はすべ て,きわめて低い結合スコア( 特定の対立遺伝子に 対しきわめて高い親和性 )をもつ野生型ペプチドの 12 開 示 著者らは,対立または偏りがあると認められる利 害関係がないことを表明している。 HLA クラス II 対立遺伝子に対する FVIII 由来ペプチドの insilico 計算による親和性は,F8 遺伝子にミスセンス変異を有する血友病 A 患者のインヒビター発生を予測する References 14 Collins PW, Hirsch S, Baglin TP et al. Acquired hemophilia A in the United King1 Mannucci PM, Tuddenham EG. The hemodom: a 2-year national surveillance study philias–from royal genes to gene therapy. N by the United Kingdom Haemophilia CenEngl J Med 2001; 344: 1773–9. tre Doctors’ Organisation. Blood 2007; 2 Graw J, Brackmann HH, Oldenburg J, Sch109: 1870–7. neppenheim R, Spannagl M, Schwaab R. 15 Gouw SC, van den Berg HM, Oldenburg J Haemophilia A: from mutation analysis to et al. F8 gene mutation type and inhibitor new therapies. Nat Rev Genet 2005; 6: development in patients with severe hemo488–501. philia A: systematic review and meta-analy3 Ehrenforth S, Kreuz W, Scharrer I et al. sis. Blood 2012; 119: 2922–34. Incidence of development of factor VIII and 16 Schwaab R, Brackmann H-H, Meyer C factor IX inhibitors in haemophiliacs. Lanet al. Haemophilia A: mutation type detercet 1992; 339: 594–8. mines risk of inhibitor formation. Thromb 4 Gringeri A, Mantovani LG, Scalone L, Haemost 1995; 74: 1402–6. Mannucci PM. Cost of care and quality of 17 Viel KR, Ameri A, Abshire TC et al. Inhibilife for patients with hemophilia complitors of factor VIII in black patients with cated by inhibitors: the COCIS Study hemophilia. N Engl J Med 2009; 360: Group. Blood 2003; 102: 2358–63. 1618–27. 5 Algiman M, Dietrich G, Nydegger U, Boiel18 Schwarz J, Astermark J, Menius ED et al. dieu D, Sultan Y, Kazatchkine MD. Natural F8 haplotype and inhibitor risk: results antibodies to factor VIII (anti-hemophilic from the Hemophilia Inhibitor Genetics y g p factor) in healthy individuals. Proc Natl Study (HIGS) Combined Cohort. Haemos. Acad Sci USA 1992; 89: 3795–9. philia 2013; 19: 113–8. 6 Moreau A, Lacroix-Desmazes S, Stieltjes N 19 Oldenburg J, El-Maarri O. New insight et al. Antibodies to the FVIII light chain into the molecular basis of hemophilia A. that neutralize FVIII procoagulant activity, Int J Hematol 2006; 83: 96–102. are present in the plasma of non-responder 20 Astermark J, Oldenburg J, Carlson J et al. patients with severe hemophilia A and Polymorphisms in the TNFA gene and the healthy blood donors. Blood 2000; 95: risk of inhibitor development in patients 3435–41. with hemophilia A. Blood 2006; 108: 3739–45. 7 Reding MT, Okita DK, Diethelm-Okita 21 Astermark J, Oldenburg J, Pavlova A, BernBM, Anderson TA, Conti-Fine BM. Human CD4+ T-cell epitope repertoire on the C2 torp E, Lefvert AK. Polymorphisms in the domain of coagulation factor VIII. J IL10 but not in the IL1beta and IL4 genes Thromb Haemost 2003; 1: 1777–84. are associated with inhibitor development 8 Reding MT, Okita DK, Diethelm-Okita in patients with hemophilia A. Blood 2006; 107: 3167–72. BM, Anderson TA, Conti-Fine BM. Epi22 Astermark J, Wang X, Oldenburg J, Berntope repertoire of human CD4(+) T cells torp E, Lefvert AK. Polymorphisms in the on the A3 domain of coagulation factor VIII. J Thromb Haemost 2004; 2: 1385– CTLA-4 gene and inhibitor development in 94. patients with severe hemophilia A. J 9 Reding MT, Wu H, Krampf M et al. CD4+ Thromb Haemost 2007; 5: 263–5. T cell response to factor VIII in hemophilia 23 Pavlova A, Delev D, Lacroix-Desmazes S et al. Impact of polymorphisms of the major A, acquired hemophilia, and healthy subhistocompatibility complex class II, interleujects. Thromb Haemost 1999; 82: 509–15. 10 Rossi F, Dietrich G, Kazatchkine MD. kin-10, tumor necrosis factor-alpha and Anti-idiotypes against autoantibodies in cytotoxic T-lymphocyte antigen-4 genes on normal immunoglobulins: evidence for netinhibitor development in severe hemophilia work regulation of human autoimmune A. J Thromb Haemost 2009; 7: 2006–15. responses. Immunol Rev 1989; 110: 135– 24 Oldenburg J, Picard JK, Schwaab R, Brack49. mann HH, Tuddenham EG, Simpson E. 11 Rossi F, Sultan Y, Kazatchkine MD. HLA genotype of patients with severe haeAnti-idiotypes against autoantibodies and mophilia A due to intron 22 inversion with alloantibodies to factor VIII:C (anti-haemoand without inhibitors of factor VIII. philic factor) are present in therapeutic Thromb Haemost 1997; 77: 238–42. polyspecific normal immunoglobulins. Clin 25 Hay CR, Ollier W, Pepper L et al. HLA class Exp Immunol 1988; 74: 311–6. II profile: a weak determinant of factor VIII 12 Kamate C, Lenting PJ, van den Berg HM, inhibitor development in severe haemophilia Mutis T. Depletion of CD4(+)CD25(high) A. UKHCDO Inhibitor Working Party. regulatory T cells may enhance or uncover Thromb Haemost 1997; 77: 234–7. factor VIII-specific T cell responses in 26 Astermark J, Donfield SM, Gomperts ED healthy individuals. J Thromb Haemost et al. The polygenic nature of inhibitors in 2007; 5: 611–3. hemophilia A: results from the Hemophilia 13 Lacroix-Desmazes S, Navarrete AM, Andre Inhibitor Genetics Study (HIGS) Combined S, Bayry J, Kaveri SV, Dasgupta S. DynamCohort. Blood 2013; 121: 1446–54. ics of factor VIII interactions determine its 27 Eckhardt CL, Menke LA, van Ommen CH immunologic fate in hemophilia A. Blood et al. Intensive peri-operative use of factor 2008; 112: 240–9. VIII and the Arg593–>Cys mutation are 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 risk factors for inhibitor development in mild/moderate hemophilia A. J Thromb Haemost 2009; 7: 930–7. Bril WS, MacLean PE, Kaijen PH et al. HLA class II genotype and factor VIII inhibitors in mild haemophilia A patients with an Arg593 to Cys mutation. Haemophilia 2004; 10: 509–14. Kemball-Cook G, Tuddenham EG, Wacey AI. The factor VIII structure and mutation resource site: HAMSTeRS version 4. Nucleic Acids Res 1998; 26: 216–9. Vita R, Zarebski L, Greenbaum JA et al. The immune epitope database 2.0. Nucleic Acids Res 2010; 38: D854–62. Nielsen M, Lund O. NN-align. An artificial neural network-based alignment algorithm for MHC class II peptide binding prediction. BMC Bioinformatics 2009; 10: 296. Nielsen M, Lundegaard C, Blicher T et al. NetMHCpan, a method for quantitative predictions of peptide binding to any HLAA and -B locus protein of known sequence. PLoS ONE 2007; 2: e796. Bui HH, Sidney J, Peters B et al. Automated generation and evaluation of specific MHC binding predictive tools: ARB matrix applications. Immunogenetics 2005; 57: 304–14. Nielsen M, Lundegaard C, Blicher T et al. Quantitative predictions of peptide binding to any HLA-DR molecule of known sequence: NetMHCIIpan. PLoS Comput Biol 2008; 4: e1000107. Sturniolo T, Bono E, Ding J et al. Generation of tissue-specific and promiscuous HLA ligand databases using DNA microarrays and virtual HLA class II matrices. Nat Biotechnol 1999; 17: 555–61. Wang P, Sidney J, Dow C, Mothe B, Sette A, Peters B. A systematic assessment of MHC class II peptide binding predictions and evaluation of a consensus approach. PLoS Comput Biol 2008; 4: e1000048. Lin HH, Zhang GL, Tongchusak S, Reinherz EL, Brusic V. Evaluation of MHC-II peptide binding prediction servers: applications for vaccine research. BMC Bioinformatics 2008; 9(Suppl. 12): S22. Delluc S, Ravot G, Maillere B. Quantification of the preexisting CD4 T-cell repertoire specific for human erythropoietin reveals its immunogenicity potential. Blood 2010; 116: 4542–5. Wang P, Sidney J, Kim Y et al. Peptide binding predictions for HLA DR, DP and DQ molecules. BMC Bioinformatics 2010; 11: 568. Green PM, Bagnall RD, Waseem NH, Giannelli F. Haemophilia A mutations in the UK: results of screening one-third of the population. Br J Haematol 2008; 143: 115–28. Yanover C, Jain N, Pierce G, Howard TE, Sauna ZE. Pharmacogenetics and the immunogenicity of protein therapeutics. Nat Biotechnol 2011; 29: 870–3. Pashov AD, Kaveri SV, Lacroix-Desmazes S. Missense Mutations Disrupting Promiscuous Class II Self-Epitopes are Associated 13 Full Translation: A. D. Pashov, et al. with Development of Inhibitory Antibodies to Factor VIII. Philadelphia, PA: Immunogenicity Summit, 2010. 43 van Haren SD, Herczenik E, ten Brinke A, Mertens K, Voorberg J, Meijer AB. HLADR-presented peptide repertoires derived from human monocyte-derived dendritic cells pulsed with blood coagulation factor VIII. Mol Cell Proteomics 2011; 10: M110. 002246. doi: 10.1016/j.blre.2011.10.001. 44 Steinitz KN, van Helden PM, Binder B 14 et al. CD4+ T-cell epitopes associated with antibody responses after intravenously and subcutaneously applied human FVIII in humanized hemophilic E17 HLA-DRB1* 1501 mice. Blood 2012; 119: 4073–82. 45 Astermark J, Donfield SM, Gomperts ED et al. The polygenic nature of inhibitors in hemophilia A: results from the Hemophilia Inhibitor Genetics Study (HIGS) Combined Cohort. Blood 2013; 121: 1446–54. 46 Dimitrov JD, Roumenina LT, Plantier JL et al. A human FVIII inhibitor modulates FVIII surface electrostatics at a VWF-binding site distant from its epitope. J Thromb Haemost 2010; 8: 1524–31. 47 Vlot AJ, Koppelman SJ, Meijers JCM et al. Kinetics of factor VIII-von Willebrand factor association. Blood 1996; 87: 1809–16. 48 Lenting PJ, van Mourik JA, Mertens K. The life cycle of coagulation factor VIII in view of its structure and function. Blood 1998; 92: 3983–96.
© Copyright 2024 ExpyDoc