大阪大学基礎工学部情報科学科4年 吉田 拓真 背景 ｜メタゲノム分類 リードがランダムに取り出される 微生物種ごとに分類したい ｜単純ベイズ分類器 リードを最も由来している可能性（スコア）が高い微生物に分類する －従来手法 －提案手法 微生物ゲノムを分割せず分類 リードのスコアが微生物ゲノムの大き さに依存しがち 微生物ゲノムを分割してから分類 ある程度微生物ゲノムの大きさに依存 しなくなった 2つの手法はどのように違うか？ 比較 ｜多次元尺度構成法 多次元空間上の点を，各点の距離関係をある程度保持したまま平面上にプロットする |手順 従来手法と 提案手法の 差分 1. 従来手法と提案手法において，ある メタゲノム環境での分類リード割合 を，微生物ごとに計算 2. 分類リード割合を距離として多次元 尺度構成法を適用 ゲノムサイズ小 ○：グループ1 △：グループ2 ＋：グループ3 ×：グループ4 ゲノムサイズ大 ｜結果・考察 提案手法と従来手法の差分では，両 手法のもとの図の特徴（形，外れ値）が そのまま現れた． 両手法は相当に異なる手法だと言え そうである． 提案手法 従来手法 ※多次元尺度構成法関連図表はjupiter上のshiny-serverでも公開中http://192.168.1.86:3838/t-yosida/mds_view/ 今後の課題 ｜比較結果の疑問点の解明 多次元尺度構成法の図において2直線上に各点がプロットされている → 何によるものなのかの特定
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