38 タンパク質相互作用予測システム [技術の概要] [技術の利用例] • タンパク質が他の分子と相互作用するかどうか、どの部位と相互作用するかを配列情報のみから予測する。また、さまざまな分子との相互作用を総合的に予測することができる。構造既知の場合は、構造情報を利用して、より高い精度で予測することができる。 • 利用者が指定する任意のリガンド分子に対して、その結合部位を予測する。データの収集、機械学習、パラメータの最適化を自動化し、複数の学習手法が選択できる。相互作用部位予測 protein or other molecule 相互作用予測 protein or other molecule protein • • • • タンパク質-タンパク質タンパク質-糖レクチン分類タンパク質-脂質相互作用データベース物理的な相互作用解析タンパク質-リ糖鎖結合ガンド複合体タンパク質タンパク質-リガンド結合部位（構造比較・分類） • • • • • protein タンパク質-タンパク質タンパク質-糖タンパク質-脂質タンパク質-金属タンパク質-核酸複合体構造の精密化 protein protein protein or other molecule protein • タンパク質-タンパク質糖、脂質、タンパク質、核酸タンパク質相互作用予測タンパク質の構造糖、脂質、金属、タンパク質、核酸タンパク質相互作用部位予測ドッキング予測ツールの自動生成データ収集、手法選択、最適化タンパク質相互作用予測 αグルコース、プリンヌクレオチド、金属イオンなどに適用し、従来よりも高い精度で予測予測結果のAUC値 • タンパク質-タンパク質相互作用 0.926 • タンパク質-糖相互作用 0.869（非酸性糖は0.901） • タンパク質-脂質相互作用 0.980（機能分類）タンパク質の機能や他の分子との相互作用部位を比較的短時間で予測することができるので、実験による解析のヒントを与え、多数のタンパク質を対象とした予測に利用できる。総合的な予測ツールとしてWeb上に公開する。連絡先 [名前] 清水謙多郎、寺田透、角越和也 → • 物理的な相互作用解析、リガンド＋タンパク質の配列 [所属] 東京大学ドッキング予測＋タンパク質の配列 [E-mail] [email protected]