合成時解読法(ＳＢＳ)用少量 DNA サンプル調製試薬(単価契約) 仕様書 ※ 本仕様書は、予告なしに修正又は訂正する場合があります。その際は、当機構ホームページ上にて仕様書の修正又は正誤表等を公示いたしますので、必ずご確認下さい。独立行政法人製品評価技術基盤機構１．目的独立行政法人製品評価技術基盤機構（以下「当機構」という。）バイオテクノロジーセンター（以下「バイオセンター」という。）では、「産業界のニーズを踏まえ、産業上有用な遺伝子情報等を収集、整理し、提供する」、「産業界のニーズに基づき、企業や公設試験所機関等との共同事業を実施する」等の業務を行っている。これらの業務では、高速解析ゲノムシーケンサーやマルチ処理小型シーケンサーを活用して、環境中から抽出した DNA 試料を解析することによって、菌叢と挿入遺伝子の挙動をモニタリングする必要がある。また、RNA 試料の網羅的解析によって、発現の有無および発現量を推定する必要がある。当該装置は、合成時解読法（SBS：Sequencing by Syntheses）により大量の塩基配列の解読を行うものであるが、前段階のサンプル調製において、断片化した DNA 試料の、①フラグメント末端の平滑化、②3'末端アデニン付加、 ③アダプタ添加・精製、④PCR 増幅・精製、の４工程を行っている。この反応に使用するサンプル調製試薬は長期保存が利かず、随時必要量を確保することが不可欠である。よって、本単価契約を締結するものである。２．契約期間平成２８年４月１日～平成２９年３月３１日３．予定数量１２個（２８８サンプル分）４．仕様本試薬は、バイオセンター保有のイルミナ株式会社製「HiSeq 1000 システム」及び「MiSeq システム」に使用できるもので、以下の仕様を満たしていること。 (1) サンプル DNA の量本試薬を使って微生物の合成時解読法用サンプルを調製するときに必要となるサンプル DNA 量は、100ng～200ng の範囲内であること。 (2) 両端の平滑化、3'末端アデニン付加、アダプタ添加、PCR 反応フラグメント末端の平滑化や、3'末端へのアデニンの付加、アダプタのライゲーション、PCR 反応によるサンプル DNA の増幅などは、サーマルサイクラーへ PCR チューブをセットして行うが、これらの反応に必要な DNA ポリメラーゼや、DNA ライゲース、反応用バッファー等を組成とするキットが付属していること。また、各反応用試薬は一部を除き簡便化のためマスターミックスの状態であること。 (3) アダプタインデックスの種類 1 フローセルあたり HiSeq 1000 システムの場合で最大 192 種類（1 レーンあたり 24 種類）が利用可能な数のアダプタインデックスを提供すること。なお、1 キットのみで同数を提供できない場合、複数のキットの組合せを行っても良いものとする。 (4) 平均フラグメント長断片化された DNA サンプル（平均長 200bp）に対し、100bp ペアエンドシーケンスを行う場合、本試薬を使ったサンプル調製の結果、必要とする平均フラグメント長 300bp -1- 以上の有効な DNA 断片（アダプタが両端に付加されたもの）が得られること。 (5) 梱包梱包は、２４サンプル分を１単位とすること。 (6) 品質保持期間キットを構成する各試薬の品質保持期間が、納品後２ヶ月以上あること。但し、品質保持のために維持すべき保存温度は、常温から-80℃までの範囲内とする。５．発注必要量を随時発注するものとする。なお、発注方法等については当機構バイオセンター産業連携推進課職員（以下「担当職員」という。）と協議の上、決定する。６．納期納期は、原則、発注から 1 ヶ月以内（土、日、祝日、年末年始（12 月 29 日～1 月 3 日）及び当機構創立記念日（毎年 5 月 1 日）を除く。）とする。また、品質不良による代替品についても同様とする。なお、１回あたりの発注量が大規模の場合は、担当職員と協議の上、納期を決定する。７．納入場所東京都渋谷区西原２－４９－１０当機構別館３階試薬保管室（別３南３３０）８．その他 (1) 本契約における予定数量は、現在の見込み数量であり、この数量を保証するものではない。予定数量に変動があった場合においても契約単価にて納入すること。 (2) 輸送用梱包材は回収すること。 -2-