合成時解読法(ＳＢＳ)用シーケンス 試薬(200 サイクル)(単価契約) 仕 様 書 ※ 本仕様 書 は 、予告 な しに修 正又は訂正する場合 があります。 そ の際は 、当 機構ホ ー ムペー ジ上にて仕様書の修 正又は正誤表等を 公 示いた しま すので 、 必ずご 確認下さい。 独立行政法人製品評価技術基盤機構 １．目的 独立行政法人製品評価技術基盤機構（以下「当機構」という。）バイオテクノロジー センター（以下「バイオセンター」という。）では、「産業界のニーズを踏まえ、産業 上有用な遺伝子情報等を収集、整理し、提供する」、「産業界のニーズに基づき、企業 や公設試験所機関等との共同事業を実施する」等の業務を行っている。 これらの業務では、高速解析ゲノムシーケンサーを活用して、環境中から抽出した DNA 試料を解析することによって、菌叢と挿入遺伝子の挙動をモニタリングする必要がある。 また、RNA 試料の網羅的解析によって、発現の有無及び発現量を推定する必要がある。 当該装置は、合成時解読法（SBS：Sequencing by Syntheses）によりシーケンス試薬を 送液して、伸長反応と蛍光の読み取りステップを繰り返し、大量の塩基配列の解読を行 うものである。この反応に使用するシーケンス試薬は長期保存が利かず、随時必要量を 確保することが不可欠である。よって、本単価契約を締結するものである。 なお、新規（de novo）微生物の解析に適した 200 サイクル用を調達するものとする。 ２．契約期間 平成２８年４月１日～平成２９年３月３１日 ３．予定数量 ４ラン分 ４．仕様 本試薬は、 バイオ セン ター保有の イルミ ナ株 式会社製「HiSeq 1000 システム 」に使 用できるもので、以下の仕様を満たしていること。 なお、本仕様書でいう「１ラン分」とは、同装置において 1 回のシーケンス解析に必 要な試薬のことである。 (1) 解読塩基数 HiSeq 1000 システムにおいて、本試薬を使ってメーカー標準プロトコルによりゲノ ム解析（ペアエンドシーケンス）を行ったとき、DNA 試料の１リードあたりの解読長 が、両末端 100bp ずつ以上であること。 (2) 解析データの再現性 上記(1)によりゲノム解析を行ったときの解析結果は、クオリティー30（99.9％の正 確さ）以上の塩基が 80％以上の良好なシーケンスデータが得られること。 (3) 試薬の反応量及び反応時間 １ランで 200Gbp 以上のデータを出力し、９日間以内に終了できる反応量及び反応時 間であること。 (4) 組成 dNTP を基質として含有し、DNA 合成酵素、蛍光物質、保護基等を組成とするキット であること。 (5) 梱包 1 梱包は、１ラン分を１単位とすること。 (6) 品質保持期間 上記(1)の品質保持期間が、納品後２ヶ月以上あること。但し、品質保持のために維 持すべき保存温度は、常温から-80℃までの範囲内とする。 ５．発注 必要量を随時発注するものとする。 なお、発注方法等については当機構バイオセンター産業連携推進課職員（以下「担当 職員」という。）と協議の上、決定する。 ６．納期 納期は、原則、発注から 1 ヶ月以内（土、日、祝日、年末年始（12 月 29 日～1 月 3 日）及び当機構創立記念日（毎年 5 月 1 日）を除く。）とする。また、品質不良による 代替品についても同様とする。 なお、１回あたりの発注量が大規模の場合は、担当職員と協議の上、納期を決定する。 ７．納入場所 東京都渋谷区西原２－４９－１０ 当機構 別館３階 試薬保管室（別館３南３３０） ８．その他 (1) 本契約における予定数量は、現在の見込み数量であり、この数量を保証するもので はない。予定数量に変動があった場合においても契約単価にて納入すること。 (2) 輸送用梱包材は回収すること。 2
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