合成時解読法(ＳＢＳ)用クラスター形成試薬(ペアエンド)(単価契約) 仕様書 ※ 本仕様書は、予告なしに修正又は訂正する場合があります。その際は、当機構ホームページ上にて仕様書の修正又は正誤表等を公示いたしますので、必ずご確認下さい。独立行政法人製品評価技術基盤機構１．目的独立行政法人製品評価技術基盤機構（以下「当機構」という。）バイオテクノロジーセンター（以下「バイオセンター」という。）では、「産業界のニーズを踏まえ、産業上有用な遺伝子情報等を収集、整理し、提供する」、「産業界のニーズに基づき、企業や公設試験所機関等との共同事業を実施する」等の業務を行っている。これらの業務では、高速解析ゲノムシーケンサーを活用して、環境中から抽出した DNA 試料を解析することによって、菌叢と挿入遺伝子の挙動をモニタリングする必要がある。また、RNA 試料の網羅的解析によって、発現の有無および発現量を推定する必要がある。当該装置は、合成時解読法（SBS：Sequencing by Syntheses）により大量の塩基配列の解読を行うものであるが、そのテンプレート調製において、DNA 結合素子（以下、「フローセル」という。）に DNA 断片を固定させ、付属の合成機で約 1000 倍まで増幅させるクラスター形成を行っている。この反応に使用する高密度クラスター形成試薬は長期保存が利かず、随時必要量を確保することが不可欠である。よって、本単価契約を締結するものである。なお、新規（de novo）微生物の解析に適したペアエンド用を調達するものとする。２．契約期間平成２８年４月１日～平成２９年３月３１日３．予定数量４ラン分４．仕様本試薬は、バイオセンター保有のイルミナ株式会社製「HiSeq 1000 システム」及びクラスター合成機「cBot Cluster Generation システム」に使用できるもので、以下の仕様を満たしていること。なお、本仕様書で言う「１ラン分」とは、同装置において 1 回のシーケンス解析に必要な試薬のことである。 (1) １フローセルあたりのクラスター数及び総解読塩基数 HiSeq 1000 システムにおいて、本試薬を使ったテンプレート調製によりゲノム解析（ペアエンドシーケンス）を行ったとき、１フローセルあたり 10 億個以上の有効なクラスター数が得られること。このとき、総解読塩基数が 200Gbp 以上であること。 (2) 増幅時間本試薬を用い、クラスター合成機によって増幅するとき、フローセルに固定された DNA 断片のブリッジ増幅（一本鎖 DNA のブリッジ構造での伸長反応等）を繰り返し、5 時間以内に処理して、 HiSeq 1000 システムで検出可能な十分な増幅量を得られること。 (3) 組成クラスター形成用ミックス試薬として、DNA 合成酵素、プライマー等を組成とする 1 キットであること。 (4) 梱包梱包は、１ラン（１フローセル）分を１単位とすること。 (5) 品質保持期間キットを構成する各試薬の品質保持期間が、納品後２ヶ月以上あること。但し、品質保持のために維持すべき保存温度は、常温から-80℃までの範囲内とする。５．発注必要量を随時発注するものとする。なお、発注方法等については当機構バイオセンター産業連携推進課職員（以下「担当職員」という。）と協議の上、決定する。６．納期納期は、原則、発注から１ヶ月以内（土、日、祝日、年末年始（12 月 29 日～1 月 3 日）及び当機構創立記念日（毎年 5 月 1 日）を除く。）とする。また、品質不良による代替品についても同様とする。なお、１回あたりの発注量が大規模の場合は、担当職員と協議の上、納期を決定する。７．納入場所東京都渋谷区西原２－４９－１０当機構別館３階試薬保管室（別３南３３０）８．その他 (1) 本契約における予定数量は、現在の見込み数量であり、この数量を保証するものではない。予定数量に変動があった場合においても契約単価にて納入すること。 (2) 輸送用梱包材は回収すること。 2