前編:等電点電気泳動 電気泳動とは・・・ ある溶液に一対の電極を入れて直流電流を 流したとき、溶液中の荷電粒子が自分のもつ 電荷と反対の極に向かって移動する現象 1808年 ロシアの物理学者Reussが水中の粘土粒子で発見 1930年代 スウェーデンの化学者Tiseliusが電気泳動装置を考案 それを用いた多くの研究により1948年ノーベル化学賞受賞 電気泳動現象を利用して、電荷・ 分子量・形が異なる分子を分離・ 分析・分取することができる ゲルマトリックス中の分子の移動 - + - + - - + ・プラス電荷分子は陰極へ ・マイナス電荷分子は陽極へ ・分子量が低いほど移動度が大きい ・同じ分子量でも形によって移動度 が異なる 分子ふるい効果 電気泳動の分類 A. 支持体 ・セルロースアセテート膜 ・ゲル アガロースゲル ポリアクリルアミドゲル ・ポリマー入り緩衝液 ・無担体 電気泳動の分類 B. 形態・方法 ・スラブゲル電気泳動 ・サブマリン電気泳動 ・パルスフィールド電気泳動 ・等電点電気泳動 ・キャピラリー電気泳動 ・フリーフロー電気泳動 二次元電気泳動(2D-PAGE) TWO-DIMENSIONAL POLYACRYLAMIDE GEL ELECTROPHORESIS 一次元目:等電点の違いによる分離 二次元目:分子量の違いによる分離 異なった原理に基づいた2種類の電気泳動 を組み合わせることにより、一度に数千種類 ものタンパク質を分離することができる 二次元電気泳動の実験の流れ サンプル調整 一次元目の泳動(IEF) 二次元目の泳動(SDSーPAGE) スポットの検出と泳動結果の解析 等電点電気泳動(IEF = Isoelectric Focusing) 等電点の差によってタンパク質を分離する (isoelectric point : pI) 両性分子の純電荷がゼロになるpH値 溶液のpHにより荷電状態が変化する分子 タンパク質は両性分子の性質を持つ タンパク質を構成するアミノ酸の残基は酸性溶液中では 正の電荷を持ち、塩基性溶液中では負の電荷を持つ - + NH3 + NH3 pH<pI COO NH2 COO- COOH NH3+ - COO COOH NH3+ pH=pI COO- NH2 pH>pI 等電点では純電荷がゼロになる(=電場の力を受けなくなる) ため、タンパク質の分子はその位置に留まる 等電点電気泳動のイメージ Before + 8.8 3.9 7.1 7.1 8.8 8.4 7.1 3.9 3.7 5.3 3.7 5.3 - After + 3.7 3.9 3.7 3.9 pHが低い 7.1 7.1 7.1 5.3 5.3 pH勾配 8.4 8.8 8.8 pHが高い - キャリアアンフォライトを用いたpH勾配 ポリアクリルアミドゲルにさまざまな等電点を持つキャリア アンフォライト(両性担体)混合物を加え電圧をかける ・製品のロット差が大きい ・pH勾配が不安定 ・チューブ状ゲルは壊れやすい 固定化pH勾配(IPG法: Immobilized pH gradient) ポリアクリルアミドゲル作製時に酸性や塩基性の種々の アクリルアミド誘導体(Immobiline)を添加しpH勾配をゲル に共有結合させる ・pH勾配が固定化されている ため正確で安定している ・酸性度・塩基性度が高いタン パク質も分離できる ・ゲルの取り扱いが簡単 Immobilineゲルの構造 (R=弱酸性あるいは弱塩基性緩衝基) 再現性が高い2D-PAGEが 可能になった 各種サケ科の泳動パターン PhastGel IEF 5-8使用 CBB染色 lane 1,2:Atlantic salmon lane 3,4:Pink salmon lane 5,6:Chum salmon lane 7,8:Rainbow trout
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