Master Infectio 2014-15 Moreau Geissman

PROPOSITION SUJET de MASTER 2014-2015
Rôle des ARN non codants dans la physiopathologie de Staphylococcus aureus
Notre équipe de recherche s’intéresse à la physiopathologie de Staphylococcus aureus. S. aureus
est un pathogène opportuniste de l’homme responsable de diverses infections plus au moins
sévères chez l’homme (infections cutanées, pneumonies, endocardites..). Chez les patients
atteints de mucoviscidose, les infections pulmonaires sont dues à des infections polymicrobiennes dont les principaux agents responsables sont Pseudomonas aeruginosa et
Staphylococcus aureus. Dans ces conditions, il est connu que des facteurs excrétés par P.
aeruginosa affectent la croissance de S. aureus.
Une thématique principale de notre équipe de recherche concerne les petits ARN non codants
et leurs rôles au cours de l’infection bactérienne. Les ARN non codants sont des régulateurs
majeurs de l’expression génique. Chez les bactéries ils interviennent dans des voies de
régulations de la croissance bactérienne, du métabolisme, de la composition membranaire et de
l’expression des facteurs de virulence. Chez S. aureus, environ une centaine d’ARNnc ont été
identifiés dont 11 au sein de notre équipe [1]. Cependant pour la plupart, leur fonction reste
inconnue.
Ayant déjà montré le rôle de plusieurs ARN dans la virulence de S. aureus [2,3], nous avons
d’autres candidats dont des résultats préliminaires obtenus au sein de l’équipe ont montré
également un rôle dans la régulation de l’expression de facteurs de virulence. Parallèlement des
premières données indiquent qu’en cas de co-culture, P. aeruginosa influence l’expression des
petits ARN de S. aureus.
Le projet de master proposé aura pour objectifs d’une part, de confirmer et valider le rôle des
petits ARN de S. aureus dans l’expression des facteurs de virulence et d’autre part, de
rechercher les molécules de P. aeruginosa responsables de la variation d’expression des petits
ARN. Pour étudier cela, nous disposons des différents mutants pour les deux genres bactériens.
L’expression des petits ARN sera analysée par RT-qPCR et l’expression des facteurs de virulence
pourra être révélée par RT-qPCR, western blot ou par des tests phénotypiques.
Le ou la candidat(e) devra être très motivée, développer son sens de l’autonomie en ayant un
sens aigu du travail en équipe. Il ou elle devra avoir une bonne connaissance et un intérêt
particulier pour la biologie bactérienne et les techniques de biologie moléculaire.
Références :
1.
Geissmann T, Chevalier C, Cros M-J, Boisset S, Fechter P et al. (2009) A search for small noncoding RNAs in
Staphylococcus aureus reveals a conserved sequence motif for regulation. Nucl Acids Res 70: 1-19.
2.
Boisset S, Geissmann T, Huntzinger E, Fechter P, Bendridi N et al. (2007) Staphylococcus aureus RNAIII
coordinately represses the synthesis of virulence factors and the transcription regulator Rot by an antisense
mechanism. Genes Dev 21: 1353-1366.
3.
Chevalier C, Boisset S, Romilly C, Masquida B, Fechter P et al. (2010) Staphylococcus aureus RNAIII binds
to two distant regions of coa mRNA to arrest translation and promote mRNA degradation. PLoS Pathog 6:
e1000809.
Laboratoire d’accueil, Responsable et équipe, adresse :
Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI)
INSERM U1111 – CNRS UMR5308 – UCBL1 (Resp : FL Cosset)
Equipe Pathogénie des Staphylocoques (Resp. : Pr François Vandenesch)
Faculté de médecine Laennec –
7 rue Guillaume Paradin –
69008 LYON
Contact :
Geissmann Tom, CR1 et Moreau Karen, PU
Téléphone :
04 78 77 86 57
E-mail : [email protected] ; [email protected]

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