5V817 - BMC

Intitulé de l’UE : ROLES MULTIPLES DE L'ARN : ARNOMIQUE (COURS PASTEUR)
Code de l’UE : 5V817
Responsables de l’UE :
Secrétariat :
Yannick ANDEOL, Professeur
Mel : [email protected]
Marie-Christine MAUREL, Professeur
Mel : [email protected]
Carine JOSEPH
Tél. : 01 44 27 35 35
Mel : [email protected]
1. Descriptif de l’UE
Volumes horaires globaux (CM, TD, TP, stage, autre) : 60 h (10 h Conférences + 10 h TD + 40 h
TP)
Nombre de crédits de l’UE : 6 ECTS
Mention et Spécialité de master où l’UE est proposée : Mention "Biologie Moléculaire & Cellulaire", spécialité "Génétique"
Semestre où l’enseignement est proposé : Semestre 3 du Master
Effectifs prévus : 18 à 20
2. Présentation pédagogique de l’UE
a) Objectifs de l'Unité d'Enseignement
La biologie moléculaire, en mettant en évidence l’extraordinaire diversité aussi bien structurale que
fonctionnelle des molécules d’ARN dans la cellule vivante, souligne l’existence d’un monde ARN
contemporain que renforce la découverte récente de l’ARN interférence et des nombreux petits et
longs ARN non-codants (piARN, miARN, …), l’identification de nombreux types de ribozymes,
les virus à ARN ou les viroïdes.
Le cours "Rôles multiples de l'ARN : ARNomique" a pour but d'explorer les différents rôles que les
molécules d'ARN sont capables de jouer dans le contrôle de l’expression des gènes et d'analyser
leurs régulations. Plusieurs conférences permettront d'aborder les différents rôles de l'ARN d'un
point de vue fondamental. La partie pratique a pour objectif d'étudier certaines étapes de la maturation des ARN messagers tels que l’export du compartiment nucléaire ou leur stabilité chez Saccharomyces cerevisiae. Dans ce but, la quantification des ARN cytoplasmiques et nucléaires dans les
conditions sauvages ou mutantes sera réalisée à échelle génomique. Les travaux pratiques consisteront à purifier des complexes ribonucléoprotéiques, extraire les ARN associés, hybrider les ARN
extraits à des sondes ADN immobilisées sur des puces, analyser les données des puces après crible
et valider les résultats obtenus par des méthodes classiques telles que Northern Blot (analyse
d’ARN poly(A)+) et qRT-PCR.
b) Thèmes abordés
Cet enseignement effectué à l’Institut Pasteur a pour but d’aborder différentes thématiques liées au
métabolisme des ARN (transcription, transport, interactions ARN/protéines, stabilité/dégradation).
Les travaux pratiques consisteront à :
• purifier des complexes ribonucléoprotéiques,
• extraire les ARN associés à ces complexes,
• hybrider les ARN extraits à des sondes ADN en utilisant une méthode d’hybridation sur
puces,
• analyser les données d’hybridation sur puces (bioinformatique),
• valider les résultats des données obtenues par des méthodes classiques (Northern blot
d’ARN polyadénylés et qRT-PCR).
c) Organisation pédagogique
Nombreuses conférences prévues en anglais.
d) Prérequis
Aucun pré-requis n’est exigé pour suivre cette unité d’enseignement. Le candidat doit être titulaire
d’une 1ère année de master de biologie, chimie ou physique ou d’un diplôme équivalent Ce cours
est également ouvert aux médecins, pharmaciens, vétérinaires ou ingénieurs souhaitant approfondir
leurs connaissances en biochimie-biologie moléculaire et génétique.
3. Equipe pédagogique
Animateurs de l’équipe : Yannick Andéol, Gwénael Badis-Bréard et Marie-Christine Maurel.
Cours Magistraux / Travaux Dirigés : conférenciers français et étrangers.
Travaux Pratiques : Yannick Andéol, Gwénael Badis-Bréard, Frédérique Devaux, Mathilde Garcia,
Isabelle Lequeutre, Marie-Christine Maurel et Claire Torchet.