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遺伝子工学
受託
微生物
遺伝子工学
受託
解析受託
Microbiomics Service
糞便や土壌*,唾液など,各種試料に存在する微生物叢
(Microbiome,マイクロバイオーム)の遺伝子解析を
行い,系統分類,同定を行う受託サービスです。
解析受託
次世代シークエンシングによる
微生物相解析受託サービス
NGS を用いた微生物叢の
メタゲノム解析受託サービス
製品ページ番号:45963 メーカー:ZYR
微生物
遺伝子工学
フナコシニュース 2015 年 4 月 15 日号(No.586)
funakoshi news
製品ページ番号:7853 メーカー:JBI
次世代シークエンサーを用いて大量の細菌 16S rRNA 遺
伝子配列を解析し,試料中に存在する細菌数や種類を詳
細に解析する受託サービスです。
※秘密保持契約にも対応致します。詳細は,当社受託・特注品業
務担当までお問い合わせ下さい。
*糞便,土壌試料の場合,あらかじめ DNA を抽出する必要があ
ります。
●
●
次 世 代 シ ー ク エ ン サ ー を 用 い て 微 生 物 叢 の Taxonomic
Profiling およびショットガンシークエンシングを行います。
●
が下がります。
●
次世代シークエンサーを用いた微生物相解析の特長
活性汚泥 1mlに
存在する微生物
ングを行い,微生物叢の分類,同定を行います。高感度な解析
微生物の
数
により,希少なバクテリアや古細菌の属を同定できます。
Shotgun Sequencing:
10億個
ショットガンシークエンシング法により微生物叢のゲノム解析
を行い,配列を決定します。最先端のバイオインフォマティク
ス解析により,微生物の種を同定できます。
●
DNA 抽出からデータ解析まで,全工程に対応します。
Taxonomic Profiling:
16S rRNA 遺伝子の可変領域(V3,V4 領域)のシークエンシ
●
複数検体の同時解析が可能です。多検体の解析にかかるコスト
1億個
1,000万個
100万個
論文に使用可能なデータ形式で,解析結果を納品します(下記
10万個
参照)。
1万個
1,000個
Cheese
Human
Stool
Chinchilla
Stool
100個
Sludge
Soil
10個
1個
微生物の
構成比
100%
従来技術
新技術
キャピラリーシークエンサー
次世代シークエンサー
100遺伝子/解析
10%
1%
構成比1%以下の微生物は
検出困難
0.1%
0.01%
0.001%
10,000,000遺伝子/解析
23
構成比0.0001%の微生物も
検出!
0.0001%
0.00001%
0.000001%
0.0000001%
1. DNA 抽出
2. 16S rRNA 遺伝子の定量
3. PCR 増幅
4. シークエンス解析(Illumina 社 MiSeq 使用)
本サービスの 16S rRNA 遺伝子のシークエンシング結果から作成した,5 種類の試料に
おける微生物叢の組成(属)解析。
5. データ解析
1-68(Tissierellaceae)
Prevotella
Peptoniphilus
塩基配列データ,
相同性検索結果
(ヒートマップ)
,
菌群組成グラフ
●
Campylobacter
多様性解析結果(α多様性)
Enterobacteria
Actinobaculum
Achromobacter
Porphyromonas
Varibaculum
詳細は,当社受託・特注品業務担当までお問い合わせ下さい。
ph2
Other
本サービスによりヒト糞便試料中に存在する主要な微生物属を同定した。
詳細は,当社受託・特注品業務担当までお問い合わせ下さい。
お問い合わせ先:
〈受託〉TEL:03-5684-1645 / FAX:03-5684-6539 / e-mail:[email protected]
本誌に掲載されている製品はすべて研究用です
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Dialister