VASP出力をXCrySDen用に変換するCUIプログラム - Zaq.jp

nitrogen14 v2xsf
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ni t r og en14
Ubuntu/Linuxのお勉強と科学技術計算をメインに…
by たきぞう
v2xsf
第一原理計算
v2xsfはVASPデータをXCrySDenで扱えるように変換してくれるプログラムで、VASP固有のCONTCARやCHGCARなどをxs
f形式に変換してくれる。特にCHGCARなどはXCrySDen上でisosurface表示してくれる。
インス ト ール
webペ ージ より実行フ ァ イル をダウ ンロ ード
実行フ ァ イル は v2xsfV1.02_bin.tar.gzに含まれ ている。
xsfconv_source.tar.gzが ソ ース フ ァ イル 。
tarballの 展開
tar xvzf v2xsfV1.02_bin.tar.gz
./xsfconvert/binの 中に実行フ ァ イル が 格納さ れ ている。
実行フ ァ イル v2xsfを $HOME/binに入れ た。
使い方
基本的な使用方法については、 tarball内の README_vaspに書いてある。
も しくは下記コマ ンドにて表示さ れ る。
v2xsf -wrong
(なぜ wrongか は謎 )
v2xsf_example.tar.gzが 練習用データ と して置いてあるの で、
これ を用いて動作を見てみる。
コマ ンドライン上で下記を実行す ると 、 CHG_Al.xsf.gzが 生成さ れ る。
v2xsf CHG_Al -o CHG_Al.xsf.gz
XCrySDenで読ませるには、下記の コマ ンドラインにて実行可能。
xcrysden --xsf CHG_Al.xsf.gz
も しくはメニューバ ーか ら XCrySDenを起動して読み込ませる。
[2010/03/17 00:27]
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