当日配布資料(2.61MB)

天然型より高性能なmiRNAと
DNAからなるmiRNA阻害剤LidNA
大阪市立大学大学院工学研究科 准教授 立花 亮
世界初のDNAからなる
miRNA阻害剤LidNA
・LNAと同等以上の阻害活性
ヘテロLong siRNA
・siRNAと同等の活性
・免疫応答を引き起こさない
キメラLong miRNA/siRNA
・天然型miRNAの
4倍以上の活性
ヘテロLong siRNA
・siRNAと同等の活性
・免疫応答を引き起こさない
Ida, et al. J. Biosci. Bioeng.117: 401-406(2014)
0.8
siPol
HsiPol
1m
2m
3m
4m
5m
6m
7m
8m
9m
10m
11m
12m
13m
14m
15m
16m
17m
18m
19m
20m
21m
22m
23m
24m
25m
control
Normalized DsRed/GFP ratio
ミスマッチ位置の最適化
1
5 nM
25
1
x
0.6
0.4
0.2
0
mismatch position
Normalized DsRed/GFP ratio
5 nM
6 nt
1
3’
0.8
0.8
0.6
0.6
0.4
0.4
0.2
0.2
0
0
siPol
HsiPol_7m
GGAGGA
GGTGGT
AACAAC
AAGAAG
CCACCA
CCTCCT
TTCTTC
TTGTTG
control
1
siPol
HsiPol_7m
AGGAGG
TGGTGG
CAACAA
GAAGAA
ACCACC
TCCTCC
CTTCTT
GTTGTT
control
延長配列は5’側にG-rich配列がよい
5 nM
6 nt
5’
ヘテロLong siRNAはsiRNAと同等の活性がある
6
9
12
9-21塩基の
延長がよい
15
18
21
control
0
0.2
0.4
0.6
0.8
Normalized DsRed/GFP ratio
1
siRNAと違い、免疫応答を引き起こさない
IFNβ
60
12
50
10
40
OAS1
7
6
5
8
30
4
20
3
6
4
2
10
0
mock
1
mock
0
mock
poly (I:C)
2
0
9
8
poly (I:C)
Fold activation/GAPDH
14
IP-10
poly (I:C)
16
キメラLong miRNA/siRNA
・天然型miRNAの
4倍以上の活性
組み合わせが必要
ミスマッチの位置
G-rich配列による延長
延長配列のDNA化
Control
50 pM
天然型
miR-143
0
0.2
0.4
0.6
0.8
Normalized DsRed/GFP ratio
1
天然型miRNAより4〜7倍活性が高い
Normalized DsRed/GFP ratio
1
0.8
0.6
0.4
0.2
0
20 10
0 0
5
0
2
5
1
0
20 10 5
0 0
0
2
5
10
pM
2.5
MIAPaCa-2
2.5
HeLaS3
2
1.5
1.5
1
0.5
0.5
0
0
Control
1
Control
cell viability
2
5’– augagauucaacagucaacTT -3’
3’– TTuacucuaaguugucaguug –5’
この構造を
siRNAにも応用
pri-miR-21
pre-miR-21
18
ga
a
a
a
u
5’- uagcuuauc gacug uguug cugu
a
3’- ugucggguag-cugaccacaac-ggua c cu
u
36
mature miR-21
5’- uagcuuaucagacugauguuga -3’
MIA PaCa-2
0.8
0.8
0.6
0.6
0.4
0.4
0.2
0.2
Control
0
0
Control
cell viability
1
HeLa-S3
天然型のmiRNA あるいは 従来型のsiRNAで
活性を見落としていたもの
低い活性のため、開発を断念したもの
活性がはっきりと見える可能性がある。
世界初のDNAからなる
miRNA阻害剤LidNA
・LNAと同等以上の阻害活性
DNAなのに
なぜ阻害活性がある?
単純なDNA相補鎖はmiRNAを
全く阻害しないことが知られていた。
しかし・・・
二本鎖部位が
miRNA阻害活性に必要
miRNA結合部位(MBD)
プロトタイプLidNA
二本鎖部位
二本鎖部位があることで
結合力は約2,000倍向上、LNAより強力
LidNA-type probe
semi-LidNA-type probe single strand probe
miRNA binding domain
probe-type
LidNA-type
semi-LidNA-type
single strand
LNA
2’-O-MeRNA
ka (M-1s-1)
9.2 x 104
1.4 x 104
1.9 x 102
5.0 x 102
3.3 x 102
kd (s-1)
5.0 x 10-5
9.6 x 10-5
1.9 x 10-4
2.4 x 10-6
1.2 x 10-5
Tachibana, et al. FEBS Lett. 586: 1529-1532 (2012)
KD value
0.54 nM
7.1 nM
1.0 µM
4.9 nM
35 nM
約2,000倍
LNAより
高い親和性
Normalized DsRed2/GFP ratio
様々なmiRNAに対する
LidNAを設計できる
1.2
25 nM
1
0.8
0.6
0.4
0.2
0
LidNA
+-- +-- +-- +-- +-- +--
15 nM
let-7a
5 nM
miR-21
15 nM
miR-22
10 nM
miR-34a
10 nM
miR-34c
10 nM
miR-122
Normalized DsRed2/GFP ratio
7
6
5
4
3
2
1
0
2 days
5 days
10 days
MIAPaCa-2 miR-21 target
2
30 nM
1.8
MOCK
Cell viability
1.6
1.4
control
1.2
1
0.8
0.6
0.4
0.2
0
0
1
2
3
4
Time after LidNAs transfection (d)
miRNA阻害剤LidNA
用途
核酸医薬
再生医療のための細胞作製
ヘテロLong siRNA
キメラLong miRNA/siRNA
業界
製薬関連企業
バイオテクノロジー企業
[email protected]
お問い合わせ先
公立大学法人大阪市立大学
産学連携コーディネーター 渡邉 敏郎
TEL 06-6605 - 3469
FAX 06-6605 - 3552
e-mail [email protected]
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