医用画像処理学(2) 基本概念(2) (教科書pp.15-37) 有村秀孝 画像の座標系 2003年ノーベル賞(MRI) ノーベル生理学・医学賞 x Z y The Nobel Assembly at Karolinska Institutet has awarded the Nobel Prize in Physiology or Medicine jointly to Paul Lauterbur and Peter Mansfield for their discoveries concerning "magnetic resonance imaging". These discoveries made it possible to develop modern magnetic resonance imaging, MRI, which represents a breakthrough in medical diagnostics and research. Worldwide, more than 60 million investigations with MRI are performed each year. 画像の座標系と2次元配列との対応 ピクセルサイズがどのようにして決まるか? 横方向のピクセル数:2048 PixelSize 96mm / 2048 46.875m ピクセルサイズがどのようにして決まるか? 横方向のピクセル数:2048 PixelSize 177mm / 2048 86.426m x PixelSize AS / N or AL / N x: X線焦点 x 人体 As AL X線画像検出器 ピクセル数=N 医用画像データの例 画像 画素サイズ 深さビット マトリックスサイズ X線写真 50 - 150 m 10-12 2048x2048 CT 0.1 – 1.0 mm 12 512 x 512 MRI 0.5 – 2 mm 12 SPECT 2.0 弱 mm 8 US 0.2 – 0.3 mm 8 256x256 - 512x512 128 x 128 – 512 x 512 512 x 512 ピクセル値ヒストグラム (gray level histogram) 横軸に画素値(ピクセル値)、縦軸にそれぞれの画素値に対応する画素の数 をとったグラフ 画素値(ピクセル値) (1)下の図の画像のピクセル値のヒストグラムを描きなさい。ただし、横 軸、縦軸の名前(レジェンドと言います)、目盛を書くこと。 (2)この画像を保存するためには、最低何ビット必要ですか。 (3)ピクセル値が5の座標を答えなさい。 1 1 1 1 1 2 3 1 1 3 5 2 1 2 2 2 5000 -1106 -980 -854 -728 -602 -476 -350 -224 -98 28 154 280 406 532 658 784 910 1036 1162 1288 ピクセル値ヒストグラム (gray level histogram) バックグランド 肺野 脂肪 筋肉 3000 度数 1000 骨 -1000 CT値 ヒストグラムの性質 入力画像のヒストグラムと画像表示 縦軸は輝度値 ピクセル値ヒストグラム 胸部単純X線写真 筋肉、 脂肪 背景(空気) 肺野 頭部三次元MR画像 のヒストグラム 灰白質 仮の脳実質領域内のカウント 8000 白質 6000 脳脊髄液 4000 2000 脂肪領域 0 0 1000 ボクセル値 (平成20年度卒研生中村君作成) MRI T1強調画像 MRI T2強調画像 MRI プロトン強調画像 MRI FLAIR強調画像 ピクセル値と輝度の諧調変換 同じピクセル値 の差でも諧調変 換によって、輝度 の差を大きくする ことができる。 ΔC2 輝度 ΔC1 ΔP ピクセル値 ΔC1 < ΔC2 ピクセル値プロファイル(1次元画像) ヒストグラムと2値化処理 人体を1(白)、背景(人体以外 の空気)をゼロ(黒)として2値 化 連結成分とラベリング 連結成分:2値画像で、連結した1画素の領域 ラベリング(ラベル付け):連結成分ごとに番号を付けること。 3つの連結成分 2値化処理とラベリング 元画像 2値画像 ラベリング画像 点処理 入力画像の注目画素のピクセル値を使って計算を行い、その結果を同じ座標 の出力画像のピクセル値とする。例:諧調変換、2値化処理など 注目画素:処理の対象となっている画素 局所処理 入力画像の注目画素とその近傍のピクセル値を使って計算を行い、その結果を同じ座 標の出力画像のピクセル値とする。 畳込み積分と線形システム 関数f(x)とh(x)との畳込み積分(convolution) f ( x) h( x) f ( )h( x )d τ:x方向の移動量 線形システムの条件 線形システム g ( x) L[ f ( x)] 加法性:L[a1 f 1( x) a2 f 2( x)] a1g1( x) a2 g 2( x) f(x) 定常性:L[ f ( x )] g ( x ) PSF g(x) h(x) 線形システム応答を畳込み積分で表現 g ( x) f ( x) h( x) FT G() F () H () ここで、f(x)としてインパルス(δ関数)を入力すると、出力はG(ω)=H(ω)となり、 システム伝達関数(周波数応答関数) H(ω)が求められる。画像の分野では、 H(ωはMTF(modulation transfer function)と呼ばれ、h(x)は点広がり関数 (point spread function)と呼ばれる。 局所処理の具体的な方法 畳込み積分処理、空間フィルター処理、微分フィルターなど。 画像処理におけるフィルタ処理(畳込み積分) 出力画像g h1 h2 h3 h4 h5 h6 h7 h8 h9 フィルタh 9 f h fihi g g i 1 f1 f2 f3 f4 f5 f6 f7 f8 f9 Prewittフィルタ(x方向) 平均化フィルタ 1/9 1/9 1/9 -1 0 1 1/9 1/9 1/9 -1 0 1 1/9 1/9 1/9 -1 0 1 入力画像f Sobelフィルタ(x方向) Laplacianフィルタ(二階微分) 1 1 1 0 1 0 -1 0 1 1 -8 1 1 -4 1 -2 0 2 1 1 1 0 1 0 -1 0 1 8近傍 4近傍 局所フィルタ処理の例 1/9 1/9 1/9 0 1 0 1/9 1/9 1/9 1 -4 1 1/9 1/9 1/9 0 1 0 平均化フィルター(ノイズ低減) ラプラシアンフィルター (2次微分フィルターで、エッジ強調) ImageJ: Process/Filters/Convolve 平均化フィルタ処理の例 1/9 1/9 1/9 1/9 1/9 1/9 1/9 1/9 1/9 ラプラシアンフィルタ処理の例 0 1 0 1 -4 1 0 1 0 例:フーリエ変換 細線化処理(2次元)の例 2値化画像 細線化処理画像 Classification of Small Candidates based on Local Structure(細線化処理(3次元)の例) Short branch : High likelihood of aneurysm VOI with Small candidates Distance-transformed image Skeleton image Searching for short branch Skeleton image Non-short-branch Short-branch type Bifurcation type Single-vessel type 領域拡張法による肺野と気管の抽出 肺野と気管の抽出 領域拡張法による気管の抽 出 細線化処理による気管の 中心線抽出(構造解析) 肺野はリスク臓器.気管の構造解析により, 肺野の機能への影響を推定する. (九州大学福田麻里子氏作成) 37 Determination of Search Region for Initial Candidates Original image Dot-enhanced image Segmented main vessels Dilation of segmented vessels (search region) Search region in dotenhanced image Search region in original image
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