Agencourt® AMPure® XP

Xtra Performance
Post-PCR Cleanup
Agencourt ® AMPure ® XP
PCR Purification System
精度の高い DNA シークエンシングや SNP ジェノタイピングを行うため
3.00
には、シグナル：ノイズ比を下げる要因となる、残存dNTP や塩、プラ
イマーやプライマーダイマーなどの共雑物を PCR 反応産物から効率
場合、酵素反応を阻害します。
Agencourt AMPure XP は SPRI® （Solid Phase Reversible
Immobilization）磁性ビーズを使用することで、効果的に DNA の
2.50
OD260/230
OD260/230
良く取り除く必要があります。また、精製後の DNA に塩が残留した
AMPure XP
Q社カラム法
E社カラム法
G社酵素法
2.00
1.50
1.00
精製を行います。SPRI 磁性ビーズは Biomek® を用いた自動化の
ために開発された試薬です。このため、マニュアル法だけでなく、
Biomek による自動化に最適で、96 および 384 ウエルフォーマットに
0.50
0.00
200bp
対応します。
800bp
10kb
アンプリコンサイズ
アンプリコンサイズ
Key Features
フリーの dNTP や PCR プライマー、プライマーダイマー、塩を効率
Figure 1A. 精製した PCR 反応産物の OD 値の比較
AMPure XP を用いて精製した PCR 反応産物は精製度が高く、しかも、
AMPure XP による精製は、再現性が高いことが分かります。
的に除去
100 塩基以上の DNA 断片を高回収
二本鎖および一本鎖どちらの DNA 断片にも対応
M
1
2
3
4
5
6
7
8
M
精製した DNA の安定性が高い
遠心やろ過の必要がなく、マニュアル法に加えて Biomek による
自動化にも最適
精製後の DNA は、シークエンスやジェノタイピング、クローニング
などに使用可能
既存製品に比べ、DNA 精製のための所要時間が短い
プライマーダイマー
Pure PCR Products
AMPure XP は①SPRI 磁性ビーズで PCR 反応産物をトラップ、
②DNA が結合した SPRI 磁性ビーズを洗浄し、dNTP・PCR プラ
イマー・プライマーダイマー・塩を除去、③SPRI 磁性ビーズから DNA
Figure 1B. 精製後の DNA を電気泳動した結果
レーン 1 および 2：AMPure XP、3 および 4：Q 社カラム法、5 および 6：E
社カラム法、7 および 8：G 社酵素法、M：サイズマーカー
を溶出、の操作ステップにより PCR 反応産物を精製します。このた
High Recovery
め、共雑物のキャリーオーバーが少なく、得られる DNA は高純度で
AMPure XP は 100 塩基以上の DNA 断片を高回収します。また、
す。Figure 1A.では 260 nm と低分子化合物に吸収のある 230
他法に比べて短いサイズから長いサイズの断片まで高回収できると
nm で、精製した PCR 反応産物の OD 値を他法と比較しました。
ともに、高い再現性を有します（Figure 2A.）。さらに、PCR 反応
Figure 1B.は、精製後の DNA を電気泳動した結果です。
産物などの二本鎖 DNA だけでなく、一本鎖 DNA にも対応します
AMPure XP は効率的にプライマーダイマーを除去することが分かり
（Figure 2B.）。
ます。
30
25
DNA 量（ng/uL）
DNA量
(ng/uL)
Stable PCR Products
AMPure XP
Q社カラム法
E社カラム法
精製後の DNA の保存が可能であれば、実験スケジュールがフレキ
シブルです。AMPure XP で精製した DNA は純度が高いため、
20
4℃で7日間保存した後でも分解が見られませんでした（Figure 3.）。
15
M
10
1
2
3
4
5
6
7
8
M
5
0
200bp
800bp
10kb
アンプリコンサイズ
アンプリコンサイズ
Figure 2A. 回収した DNA 濃度の比較（AMPure XP と他法）
分解が見られる
200、800、10,000 塩基の PCR 反応産物を AMPure XP および他法で
精製後、回収した DNA 濃度を吸光度の測定により算出しました。
Figure 3. 精製した DNA を 4℃で 7 日間保存後に電気泳動した結果
30.00
レーン 1 および 2：AMPure XP、3 および 4：Q 社カラム法、5 および 6：E 社
カラム法、7 および 8：G 社酵素法。レーン 5 から 8 では、7 日後に DNA の
分解が見られました。
200 bp
800 bp
DNA量量（ng/uL）
(ng/uL)
DNA
25.00
10 kb
20.00
Fast Post-PCR cleanup
15.00
AMPure XP には、これまで以上に磁力に対するレスポンスを高め
た SPRI 磁性ビーズを使用しています。AMPure XP は他法に比
10.00
較して処理速度が速いため、短時間のうちに DNA を精製できます
5.00
（Figure 4.）。
0.00
100
一本鎖
DNA
一本鎖DNA
9696サンプル処理の所要時間（分）
サンプル処理の所要時間（分）
二本鎖 DNA
二本鎖DNA
Figure 2B. 回収した DNA 濃度の比較（一本鎖と二本鎖 DNA）
200、800、10,000 塩基の二本鎖 DNA および一本鎖 DNA を AMPure
XP で精製後、回収した DNA 濃度を吸光度の測定により算出しました。
Kit Components
z AMPure XP reagent
80
60
40
20
0
AMPure XP
AMPure
Q Q社カラム法
社カラム法
EE社カラム法
社カラム法
GG社酵素法
社酵素法
Figure 4. 96 サンプルにおける PCR 反応産物の精製時間の比較
製品名
Agencourt AMPure XP Kit – 5 mL
サンプル対応数*
139
Agencourt AMPure XP Kit – 60 mL
1,666
Agencourt AMPure XP Kit – 450 mL
12,500
製品番号
/
278
/
3,333
A63881
/ 25,000
A63882
*それぞれ 20μL、もしくは 10μL の反応系により増幅した PCR 反応産物を精製した場合。
Beckman Coulter、Beckman Coulter ロゴ、Agencourt、AMPure、Biomek および SPRI は、Beckman Coulter, Inc の商標です。
A63880

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