Xtra Pure RNA Agencourt ® RNAClean ® XP System Enzymatic Purification System Agencourt RNAClean XP は cDNA 合成や in vitro 転写反応な どの酵素反応において生成される核酸の精製試薬キットです。 本キットは、SPRI®(Solid Phase Reversible Immobilization) 磁性ビーズ技術を使用し、Eberwine 法にもとづく cDNA および cRNAの精製法に対応しています。この SPRI技術を使用することに より、有機溶媒、吸引ろ過および遠心が不要となります。また、 本キットにより、遺伝子発現解析に求められるような高純度の核酸 が得られます。 Key Features cDNA、cRNA ともに精製可能 Superior Quality マイクロアレイによる解析においては、cRNA 精製の工程が、ヌクレ アーゼフリーであること、短いサイズから長いサイズの in vitro 転写 産物がバイアスがかかることなく回収されることが求められます。 RNAClean XP は確実に RNase を除去するとともに、短いサイズ から長いサイズにいたるまでの in vitro 転写産物を回収します。 Agilent 社 Bioanalyzer による解析の結果、RNAClean XP は 他社キットと同様の精製結果を示しました(Figure 2.および Figure 3.)。さらに Table 1.に示したとおり、RNAdvance XP は、RNA を 高収量で回収することが可能です。 A RNAClean XP - in vitro転写 B 他社キット - in vitro転写 水溶液中に溶出として回収 塩類、未反応のプライマーおよびdNTPを確実に除去 遠心やフィルトレーションのステップが不要 工程が単純化されており、Biomek® シリーズを用いた自動化 への対応が容易 High Yield Figure 1.では、一般的に用いられているカラム法に基づく他社 カラム法キットとの比較検討を行いました。RNAClean XP は標準 的なカラム法に比べ、cRNA を安定的に高収量で回収することが 可能です。 RNAClean XP 回収率(µg) 他社カラム法キット in vitro 転写反応 NuGEN 増幅法 Figure 2. in vitro 転写産物の cRNA を A)RNAClean XP、B)カラム ベースの他社カラム法キットで、それぞれ精製し、Agilent 社 Bioanalyzer で 解析した結果。 C RNAClean XP - NuGEN D 他社カラム法キット - NuGEN Figure 1. in vitro転写反応により得た cRNA(in vitro 転写反応)、および NuGEN社 RNA amplification system V2 による増幅後のin vitro 転写 産物をRNAClean XP および他社カラム法キットを用いて精製した。 Table 1. 精製後の RNA 平均濃度 RNAClean XP - in vitro 転写 他社キット - in vitro 転写 RNAClean XP - NuGEN 他社キット - NuGEN RNA 濃度(ng/L) 575 528 288 267 Figure 3. NuGEN 社 RNA amplification system V2 による増幅後、 in vitro 転写により合成した cRNA を A)RNAClean XP、B)カラムベース の他社カラム法キットで、それぞれ精製し、Agilent 社 Bioanalyzer で解析 した結果。 Versatile and Economical RNAClean XPにより精製された RNAは、様々なIVT ラベリングキット に使用することが可能です(リストは Table 2.をご参照ください)。また、 人体および環境に有害となる有機溶剤を使用しておらず、また遠心、 真空フィルトレーションの操作ステップが無いため、自動化にも適し ます。 Table 2. 各 IVT ラベリングキットにおける RNAclean XP の使用量および精製可能サンプル数 1 サンプルの精製に必要な RNAClean XP 容量(µL) RNAClean XP 1 キット (40mL)で精製可能な サンプル数 NanoAmp RT-IVT Labeling Kit 252 159 T7 labeling 342 117 Ovation RNA Amplification System V2 288 139 TargetAmp Nano-g Biotin-aRNA Labeling Kit for the Illumina System 72 556 IVT ラベリングキット TargetAmp 2-Round Biotin-aRNA Amplification Kit 3.0 216 185 Low RNA Input Linear Amplification Kit 180 222 Amino Allyl MessageAmpⅡaRNA Amplification Kit 360 111 TotalPrep RNA Amplification Kit 360 111 MessageAmpⅡ 360 111 SuperScript Indirect RNA Amplification System 342 117 BioArray Single Round RNA Amplification and Biotin Labeling System 342 117 Kit Components z Agencourt RNAClean XP Reagent 製品名 サンプル対応数 製品番号 RNAClean XP - 40 mL 116 サンプル分 A63987 RNAClean XP - 450 mL 1,463 サンプル分 A66513 関連する製品名(キット初回使用時に購入が必要) 製品番号 SPRI Plate 96R Ring Magnet Plate (96 ウエルプレート用) A32782 SPRI Plate 384 Magnet Plate (384 ウエルプレート用) A29165 Beckman Coulter、Beckman Coulter ロゴ、Agencourt、RNAClean および SPRI は、Beckman Coulter, Inc の商標です。
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