平成18年度 財団法人静岡総合研究機構学術教育研究推進事業費補助金 実 施 事 業 の 概 要 区分：一般研究 学会開催 静岡県ＳＯＥ（○で囲む） 東海大学 海洋学部 職名 事業名： 助教授 氏名 石 川 智 士 駿河湾におけるサクラエビの遺伝的多様性の評価と産地判別遺伝子マーカーの作出 事業の概要と成果： 【目的】駿河湾の特産品として有名なサクラエビの持 続的利用を念頭に，駿河湾産サクラエビの遺伝的多様 性の評価を試みた。同時に，台湾に生息するサクラエ ビについても遺伝解析を行い，駿河湾のサクラエビと の遺伝的差異の検討を行った。 【方法】2006年５月と10月に駿河湾で漁獲されたサク ラエビ各32個体と2006年11月に台湾南部海域で漁獲さ れたサクラエビ32個体の合計96個体について，ミトコ ンドリアDNAのND2領域からtRNAトリプトファン領域に およぶ852塩基を決定し，比較検討をおこなった。 図１．サクラエビの分布域と標本採集地域 緑色の範囲が分布域・赤丸が採集地域 ND2 001 TGACCTCAAGCAATTACATTAATAACAGTTCAAAAAATTGCCCCTATATC 050 051 ACTCATTTCTTATACAATTTCTTACTCCTCTTCTTTTTTAATAACAGGCT 100 101 CTATTTTACTATCAGCCTTGGTTGGAGCGATTGGAGGATTAAACCAAACA 150 Table 1 Sampling locations, season and number of individuals. Lot 1 Lot 2 Lot 3 Sampling location 151 TTTTTACGAAAAATTATAGCTTACTCATCAATTAATCACATATCCTGAAT 200 201 GCTTTCAGCCATTATACTTAGTGAAAGAAGATGAATAGTTTATTTTATAA 250 251 TTTACTCTATTGTGTCTAGTTCTTTAGCTTTTTTATTTTACAGACACCAA 300 Date No.Inds Head of Mouth of Offing from Suruga Bay, Suruga Bay, Donggang, Japan Japan Taiwan May, 2006 Oct. 2006 Nov. 2006 32 inds 32 inds 32 inds 301 TCATTCCACATTTCTCACATTATAAACCACTCTTCTCACTCTCAAACTGT 350 351 AAAAATTCTTACATTTATTTCCCTCTTATCTCTAGGAGGTTTACCTCCAT 400 Table 2 Three variable position in ND2 region observed. 401 TTACTGGATTTATTGCTAAGTGATTTATTATCCAAGAACTAGCTTTTAAC 450 Sequence No. 468 588 Position 3rd 3rd Common A A Suruga-A ・ ・ Taiwan-1 G ・ Taiwan-2 G ・ 451 CAAATATTCATTACCTTATTAGTTCTTTTATCTAGGGCTTTACTAACTCT 500 501 TTTTTATTATTTACGAATCGCAATAACATCGATGATATTGTCAAGTCCAA 550 551 AAAGGAAATGAATAAAATCAAATAAGTTTAACAGATCATTTATTACTCCT 600 664 2nd A G ・ ・ Lot1 Lot2 Lot3 Suruga Suruga Taiwan 32 0 0 0 31 1 0 0 28 0 3 1 Total 91 1 3 1 601 TTTTTAATTTTTATTAACTCAGCAGGAATTTTTACACCATCAATTATCGC 650 non coding region tRNA-Trp 651 TTTAATTATTTAAAGTTTAATTTTAACTAACTTTTTAAAGCTTTAAGTTA 700 701 TTTAAACTTACAGCCTTCAAAGTTGTCAAAAGAGGTTATAATCCCCTAAG 750 non coding region tRNA-Cys 751 CTTTAAATACCTCTCATTGTATTTATATTAAGCTTTGGCGCTACAGCGCA 800 801 TCTTCAGAATTGCAGTCTGATGTCTTATTTTTACACTACAAAGCCTAATG 850 851 AA Fig.２ 決定した塩基配列。赤矢印は置換した部 位を示す 【結果】決定した塩基配列にはＮＤ２領域の部分配列（664pb）と，tRNAのトリプトファン（68bp）とシ ステイン（79bp）の全領域，それにノンコーディングと思われる領域（41bp）が含まれていた。変異は3 箇所認められ，すべてＮＤ２領域の第３部位であった。これら変異によって，解析した全96個体は4ハプ ロタイプに分けられた。ただし91個体は，採集された場所と時期に関わらず同一ハプロタイプであった。 それ以外のハプロタイプは，台湾の３個体，台湾の１個体，駿河湾の秋群の１個体にそれぞれ認められ た。 【考察】従来のクルマエビ属の遺伝解析結果から省みて，ミトコンドリアDNAの塩基配列は，サクラエビ が属するクルマエビ属で特に変異が少ないということではない。したがって，今回の結果から，サクラエ ビは日本と台湾に局所的な分布をしているが，ミトコンドリアレベルでは遺伝的に極めて類似しており， なおかつ，その多様性が極めて低いことが分かった。今後は本種の遺伝的多様性を正確に評価するために は，核DNAの解析を進める必要がある。今後は，AFLP分析やマイクロサテライト分析を用いて，ミトコン ドリアDNA分析で認められた本種の極めて低い遺伝的多様性が，核DNAにおいても認めら得るかどうかを判 断し，核DNAを対象とした遺伝子マーカーの作出をすすめる。 尚，今回の成果は，平成１９年度 日本水産学会大会において発表した(発表番号 1314)。
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