仕様書 【PDF:98KB】

合成時解読法(SBS)小型シーケン
サー用シーケンス試薬(600 サイクル)
(単価契約)
仕 様 書
※ 本 仕 様 書 は 、 予 告な し に 修 正 又 は 訂 正す る 場 合 が あ り ま す。
そ の 際 は 、 当 機 構 ホ ー ム ペ ー ジ 上 に て 仕様 書 の 修 正 又 は 正 誤表 等 を
公 示 い た し ま す の で 、 必 ず ご 確 認 下 さ い。
独立行政法人 製品評価技術 基盤機構
1.目的
独立行政法人製品評価技術基盤機構(以下「当機構」という。)バイオテクノロジー
センター(以下「バイオセンター」という。)では、「産業界のニーズを踏まえ、産業
上有用な遺伝子情報等を収集、整理し、提供する」、「産業界のニーズに基づき、企業
や公設試験所機関等との共同事業を実施する」等の業務を行っている。
これらの業務を実施する上において、微生物のゲノム情報が必要とされるため、バイ
オ セ ン タ ー で は 、 マ ル チ 処 理 小 型 シ ー ケ ン サ ー ( 以 下 「 MiSeq シ ス テ ム 」 と い う 。 )
を導入し、活用しているところである。
MiSeq システムを使用するためには、クラスター形成とペアエンドシーケンスを可
能とし、平均リード長 600 塩基程度を確保しつつ、簡易で短時間に処理できるSBS
小型シーケ ンサー 用シ ーケンス試 薬を使 用す る必要があ る。こ のS BS小型シ ーケン
サー用シー ケンス 試薬 は長期保存 が利か ず、 随時必要量 を確保 する ことが不可 欠であ
る。よって、本単価契約を締結するものである。
なお、新規(de novo)微生物の解析に適した 600 サイクル用を調達するものとす
る。
2.契約期間
平成28年4月1日~平成29年3月31日
3.予定数量
24ラン分
4.仕様
本試薬は、バイオ セン ター保有のイルミ ナ株 式会社製「MiSeq システム(H23 年度
導入)」に使用できるもので、以下の仕様を満たしていること。
なお、本仕様書で言う「1ラン分」とは、同機器において 1 回のシーケンス解析に
必要な試薬のことである。
(1) 解読塩基数
MiSeq システムにおい て、本試薬を使ってメ ーカー標準プロトコル によりゲノム
解析(ペアエンドシーケンス)を行ったとき、DNA 試料の解読長が、両末端 300 bp
/リードずつ以上の解読が可能であること。
(2) 解析データの再現性
上記(1)によりゲノム解析を行ったときの解析結果は、クオリティー30(99.9%の
正確さ)以上の塩基が 70%以上の良好なシーケンスデータが得られること。
(3) 試薬の反応量及び反応時間
1ランで 12.0Gbp 以上のデータを出力し、3日間以内に終了できる反応量及び反
応時間であること。
(4) 組成
クラスター形成用ミッ クス試薬とペアエンド 用シーケンス試薬から 構成され、前
者は DNA 合成酵素、プライマー等を組成とし、後者は dNTP を基質として含有し、
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DNA 合成酵素、蛍光物質、保護基等を組成とするキットであること。
(5) 梱包
梱包は、1ラン分を1単位とすること。
(6) 品質保持期間
上記(1)の品質保持期間が、納品後2ヶ月以上あること。但し、品質保持のために
維持すべき保存温度は、常温から-80℃までの範囲内とする。
5.発注
必要量を随時発注するものとする。
なお、発注方法等については当機構バイオセンター産業連携推進課職員(以下「担
当職員」という。)と協議の上決定する。
6.納期
納期は、原則、発注から 1 ヶ月以内(土、日、祝日、年末年始(12 月 29 日~1 月 3
日)及び当機構創立記念日(毎年 5 月 1 日)を除く。)とする。また、品質不良によ
る代替品についても同様とする。なお、1回あたりの発注量が大規模の場合は、担当
職員と協議の上納期を決定する。
7.納入場所
東京都渋谷区西原2-49-10
当機構
別館3階
試薬保管室
(別3南330)
8.その他
(1) 本契約における予定数量は、現在の見込み数量であり、この数量を保証するもの
ではない。予定数量に変動があった場合においても契約単価にて納入すること。
(2) 輸送用梱包材は回収すること。
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