T4 DNA Ligase Cat No. CH-0801 【目的・用途】 【使用方法 1】 本酵素は二本鎖ヌクレオチドの隣接した 5 リン酸末端と 3'ヒドロキシル末端 とのホスホジエステル結合の形成を触媒します。二本鎖 DNA、二本鎖 RNA、 下記試薬をピペッティングにより穏やかに混合し、スピンダウンします。 DNA/RNA ハイブリッドの平滑末端および粘着末端を結合でき、ニックの修 復も可能です。一本鎖ヌクレオチドには作用しません。 【特徴】 1)高効率 粘着末端の結合 1)反応溶液の調製 (20uL の場合) 容量 終濃度 Linear vector DNA 試薬 X uL 20-100 ng Insert DNA Y uL 10×Ligation Buffer 2)粘着末端の結合は 22℃、10 分で終了 3)平滑末端の結合は 22℃、1 時間で終了 T4 DNA Ligase(5U/uL) 超純水 Insert : vector 1:1-5:1※ 2 uL 1× 0.2 uL 1U/20uL up to 20 uL ※ モル比 2)22℃、10 分間インキュベートします。 【キット内容】 内容 容量 T4 DNA Ligase (5U/uL) 20 uL (100U) 10×Ligation Buffer 250 uL 50% PEG Solution 150 uL 3)65℃、10 分間または 70℃、5 分間インキュベートし、T4 DNA Ligase を失活させます。 4)1-2uL の反応溶液を 50uL のコンピテントセルに加え、形質転換します。 【使用方法 2】 【保存方法】 平滑末端の結合 1)反応溶液の調製 (20uL の場合) -20℃ 下記試薬をピペッティングにより穏やかに混合し、スピンダウンします。 試薬 【組成】 終濃度 X uL 20-100 ng Insert DNA Y uL T4 DNA Ligase 保存バッファー 20 mM Tris-HCl, 50 mM KCl, 0.1 mM EDTA, 1 mM DTT, 50 % glycerol (pH 7.5 at 25℃) 容量 Linear vector DNA 10×Ligation Buffer 400 mM Tris-HCl, 100 mM MgCl2, 100 mM DTT, 5 mM ATP (pH 7.8 at 25℃) Insert : vector 1:1-5:1※ 10×Ligation Buffer 2 uL 1× T4 DNA Ligase(5U/uL) 1 uL 5 U/20uL 2 uL 5% 50% PEG Solution 超純水 up to 20 uL ※ モル比 【由来】 2)22℃、1 時間インキュベートします。 Escherichia coli carrying the plasmids that enable highly expression of T4 DNA Ligase gene 3)65℃、10 分間または 70℃、5 分間インキュベートし、T4 DNA Ligase を失活させます。 4)1-2uL の反応溶液を 50uL のコンピテントセルに加え、形質転換します。 【ユニットの定義】 37℃、20 分間で 1 nmol の[32PPi]を Norit 活性炭吸着性物質に変換する T4 DNA Ligase 活性を 1 Weiss Unit とする(1)。 本酵素 1U(Weiss Unit) は 200 cohesive end ligation units (CEU )に相当します。 ※ 【使用方法 3】 下記試薬をピペッティングにより穏やかに混合し、スピンダウンします。 反応液組成:66 mM Tris-HCl (pH 7.6), 6.6 mM MgCl2, 10 mM DTT, 66 uM ATP, 3.3 uM [32PPi] ※1 CEU はλDNA-Hind III 分解物を 16℃で 30 分間に 50%以上ライゲーショ ンさせる酵素活性です。 【使用上の注意】 T4 DNA Ligase の終濃度は推奨容量を超えないようにしてください。過剰 量の T4 DNA Ligase は結合効率の低下の原因となります。 PEG を加えることにより、平滑末端の結合効率を大幅に改善できます。 平滑末端の結合には終濃度 5%となるように反応系に加えます。 形質転換に使用する Ligase 反応済みのプラスミドは細胞の容量の 10%を DNA の閉環 1)反応溶液の調製 (50uL の場合) 試薬 Linear vector DNA 容量 終濃度 X uL 5-50 ng 10×Ligation Buffer 5 uL 1× T4 DNA Ligase(5U/uL) 1 uL 5 U/20uL 超純水 up to 50 uL 2)粘着末端の場合は 22℃、10 分間、平滑末端の場合は 22℃、1 時間 インキュベートします。 3)65℃、10 分間または 70℃、5 分間インキュベートし、T4 DNA Ligase を失活させます。 4)1-2uL の反応溶液を 50uL のコンピテントセルに加え、形質転換します。 超えない量を使用して下さい。(50uL のコンピテントセルには 5uL 以下の 【参考文献】 ライゲーションサンプルを加えます。) (1) Weiss, B., et al., Enzymatic breakage and joining of deoxyribonucleic T4 DNA Ligase には glycerol が含まれているため、ピペットチップの外壁 に接着しやすくなっています。容量を正確に量り取るため、T4 DNA Ligase 溶液を採取する際にはピペットチップを溶液深く入れないでくだ さい。 acid, J. Biol. Chem., 243, 4543-4555, 1968.
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