構 シクロデキストリンの数が制御された ロタキサン-DNAオリゴマーの合成 研究概要・成果 端 科 学 載 技 ・加 術 推 工 進 等 機 は バイオインスパイアード・ハイブリッド材料研究会 ○石野愛（院生）、園田卓也（学部生）、葛谷明紀（化学生命工学部 化学・物質工学科 准教授）、大矢裕一（教授） Introduction Previously reported rotaxanes cyclodextrine (CyD) 原料 OH O HO OH O HO OH O HO O OH O O HO OH O HO OH OH OH O OH OH O OH 26 mer DNA ト分子 内包可能 を トッパーの塩基数 減 すと目的物の収率が向上 目的物の収率が低い ・末端修飾可能 を ン 構築 ら ス 今 でにない新規なロ ・酵素分解可能 を サ キ タ ま DNA 原料 を 様々な OH O ス ゲ HO O O DNAの持つ機能 生かせない A. Kuzuya, T. Ohnishi, and M. Komiyama, Chem. Lett. 37, 996-997 (2008). A. Kuzuya, T. Ohnishi, T. Yamazaki, M. Komiyama, Chem. Asian J. 5, 2177-2180 (2010). Concept of this work よ を 未反応物 容易に取 除くことが可能 59 19 .039 Inte ns . [a .u.] 0.6 0.4 20.0 30.0 Retention Time [min] 40.0 50.0 0.2 [3]ロ 0.0 [2]ロ 2000 3000 8 7000 8000 4944.107 x10 4 2.5 4944.453 2.0 40000 1.5 4 1.0 20000 2 0.5 0 10.0 20.0 30.0 Retention Time [min] 40.0 50.0 0.0 0 2000 3000 4000 5000 6000 7000 8000 2000 90 00 3000 4000 5000 6000 7000 8000 9000 m/z m/z linear gradient：acetonitrile in 50 mM ammonium acetate from 2.5% to 26.5% in 33 min, and then 50% in 17 min 染色: SYBR GOLD Synthesis of DRD Summary x10 4 9777.907 Inte ns. [a .u.] 300000 4903.178 。 Intensity [µV] 0.50 サ キ タ 0.25 ササ キキ タタれ ら る を 10 mer DNA 用いて片末端に ン DNA リゴマー 有す ロ ン の合成 行った結果， [2]ロ ンが得 た。 お び[3]ロ を 100000 す を 9792.4) 0.75 0 0.00 20.0 30.0 40.0 Retention Time [min] 50.0 60.0 2000 3000 4000 5000 6000 7000 8000 9000 10000 11000 m /z x10 4 アカ 6 8838.645 ミノ基末端HY10Reg6c12と ルボ ル基末端HY10RCOOH CyD 存在下で混合す ことで， ン 両末端にDNA 有す ロ (DRD) の構築に成功した。 8819.6) を ( を 3 ゲ 4441.185 10000 2 リル ミド ル 1 サ キ タ るる 4 シ キ 5 20000 8838.645 10.0 Inte ns . [a .u.] 0.0 ア 20%変性ポリ in TBE buffer 9777.907 ( 1.00 200000 よ ま ン 理論値：4944.8 9000 6 リル ミド ル ク ア じ 6000 60000 0.0 M: 10bp ladder Lane 1: 原料 (10 mer DNA) Lane 2: 反応物 禁 5000 x10 4 4944.107 _001 - CH10 Inte ns . [a .u.] gel reference wavelength 494 nm オ ※ 4000 m/z eg6c12rotaxane ン 理論値: 5919.7 4 94 4 .4 5 3 10.0 Inte ns . [a .u.] Intensity [µV] 写 ・転 20%変性ポリ in TBE buffer ア 複 5919.039 20000 0.0 ゲ 断 1.0 M 1 2 無 x10 4 0 Intensity 大 学 先 西 関 _002 - CH10 10000 ク ア gel reference wavelength 494 nm 30000 0.8 Carbonate Buffer 応用分野、実用化可能分野 る eg6c12rotaxane 2 1.25 28% NH3aq / methylamine を M M 1 M: 10bp ladder Lane 1: 原料 (10 mer DNA) Lane 2: 反応物 28% NH3aq / methylamine α-CyD Synthesis of rotaxane サ サ キ キ タ タ OH サ キ タ O DMSO ま ま HO カ EDC, sulfo-NHS O O る O HO を Carbonate Buffer CPG ラム上でDNA 合成 ロ ン合成に用い →その る れ →収率の向上が期待さ TCA / DCM 10% Diethylamine / Acetonitrile α-CyD ら を へ る 反応の進行具合 確認しなが 随時試薬 追加・交換でき 液相合成していたが固相合成 変更す Intensity [µV] サ キ タ 本研究では… り る られ ら を 固相合成のメリット DNAの塩基数 減 すことなく効率 く ロ ンが得 合成系の確立 0 染色: SYBR GOLD 0 0.0 10.0 20.0 30.0 Retention Time [min] 40.0 50.0 2000 3000 4000 5000 6000 7000 8000 9000 10000 11000 m /z 多段階多色発光する蛍光プローブおよび分子モーターの開発 問合せ先： 関西大学 化学生命工学部 ・谷明紀 TEL：06-6368-0829 E-mail：[email protected] 関人ORDIST 先 端 科 学 技 術 推 進 機 構 社会連携部 産学官連携センター、知財センター
© Copyright 2024 ExpyDoc
![平成 27 年 5 月 14 日 [神戸大学大学院農学研究科] 李智博准教授が](http://s1.expydoc.com/store/data/006070707_1-3e6fd1585bf925076db6363e411c729d-250x500.png)
