Ion Total RNA-Seq Kit v2 Ion RNA-Seq により マイクロアレイでは困難な トランスクリプトームの多様性を解明 Ion Total RNA-Seq Kit v2 には、Ion Personal Genemo Machine（PGM ™）システム 上でのストランド特異的な RNA シーケンシングに使用するための、cDNA ライブラリ作成 small RNA または mRNA 発現解析用 ライブラリ作成キット に必要な構成品がすべて含まれています。弊社が独自に開発した反応副産物の合成を阻 害する技術を利用することにより、small RNA 用ライブラリ作成ワークフローから、電気 泳動ゲルによるサイズセレクションのステップが不必要になりました。また、簡便で、自動 化が容易なマグネチックビーズを利用した精製ステップにより、microRNA を含む small RNA 解析用および遺伝子発現プロファイリング用のライブラリを、わずか 6 時間で作成 することが可能となっています。 Ion Total RNA-Seq Kit v2 は、迅速で幅広いスケール に対応可能な Ion RNA-Seq ソリューションの重要な製品であり、転写産物および発現変 動のより高感度な検出や、新規転写産物および融合転写産物の発見、さらにはアイソフォー ムの同定も可能となるため、従来のマイクロアレイに代わる方法を必要としている研究者 にとって理想的な方法です。 microRNA を含む small RNA 解析用、ま たはシーケンシングによる遺伝子発現プロ ファイリング用のライブラリの作成が可能 より迅速なワークフロー 自動化が容易なマグネチックビーズを利用 することにより効率的かつ迅速な精製が可 能なことに加え、small RNA ライブラリ用 の煩雑な電気泳動ゲルによるサイズセレク ションが不要で、わずか 6 時間でライブラ リが作成可能 Ion Total RNA-Seq Kit v2 ライブラリタイプ microRNAを含むsmall RNA ホールトランスクリプトーム RNAインプット量 • 100 ng トータルRNA中の 5 ng miRNA • 100 ng トータルRNAから単離 された1 ng polyA RNA • 1 ng 精製 miRNA • 100 ng トータルRNAから単離 された25 ng rRNA除去済RNA 約6時間 時間 ストランド情報の維持 クリーンアップ技術 可能 マグネチックビーズを利用したクリーンアップで、 電気泳動ゲルによるサイ ズセレクションまたはフィルターカラム不要 バーコード対応 マルチプレックス用のIon Xpress™ RNA-Seq Barcode 1-16 Kitに対応 Ion 318™ Chipの容量 バーコード化されたsmall RNAラ イブラリ3サンプル分* Ion Community サイトで以下の情報を 公開中 • Ion PGM システムによる small RNA 解 析および遺伝子発現プロファイリングの アプリケーションノート • ビデオ • マニュアル • データセット ホールトランスクリプトーム1サン プル分** *ヒト胎盤RNAから作成したライブラリ1サンプルあたり、50万リード以上が一般的にmiRBaseにマッピングされる **出発材料としてpolyA RNAを使用した場合、HeLa細胞のホールトランスクリプトームのライブラリにおいて、一般 的に200万リード以上がRefSeqエクソンにマッピングされる 詳細は当社ウェブサイト lifetechnologies.com/ionrnaseq をご覧ください。 RNA-SeqKit2_0712.indd 1 12/07/12 15:55 ストランド情報の保持 ニーズに応じて選べるリード数およびリード長 ® 独自に開発した Ambion テクノロジーにより、ライブラリのスト ランド情報が保持されるように、アダプターが方向性を保ってライ ゲーションされます。この結果、リードは染色体鎖に対して転写方 向にマッピングされ、転写産物の構造や発現量の解明および新規 の転写領域の探索に役立ちます。 Ion 314 ™、Ion 316 ™、Ion 318 ™ chip によりアプリケーションに 応じてリード数を選択することが可能で、Ion Xpress ™ RNA-Seq Barcode 1-16 Kit を用いることにより、最大 16 サンプルを 1 枚 のチップ上で同時にランすることが可能です。さらに、必要に応じ て最適な Ion PGM ™システムのリード長 （35、 100 または 200 塩基） を選択することも可能です。 最適な RNA 精製キットで性能を最大化 迅速に結果を取得 ® Dynabeads mRNA DIRECT ™ Micro Kit は、トータル RNA か ら mRNA を単離するためのキットで、rRNA のコンタミネーショ Ion Total RNA-Seq Kit v2 と Ion Xpress ™ Barcode 1-16 Kit を用いると、ライブラリ作成を含めたすべての工程をわずか 6 時間以内に完了できます（図 1） 。 作成したライブラリを用い て、Ion OneTouch ™ システムによりテンプレートを調製し、Ion PGM ™ システムでシーケンシングを行います。 データ処理は Torrent Suite Software を用いて行い、処理されたデータは様々 な解析ソフ トウェアに対応可能な、スタンダードフォーマットのファ 組 織 および 細 胞 から small RNA を 単 離して Ion Total RNAイルとして出力されます。 Seq Kit v2 を用いて small RNA ライブラリを構築する場合は、 mirVana ™ miRNA Isolation Kit が最適です。 ンを極小化できるよう最適化されています。このキットにより精製 した polyA RNA を、Ion Total RNA-Seq Kit v2 を用いたホール トランスクリプトームライブラリの構築に使用した場合、リードの rRNA へのマッピング数が 10 分の 1 に減少し、対応する RefSeq エクソンへのマッピング数が増加しました。 ライブラリ作製 テンプレート調製 シーケンシング データ解析 6 4 2 1 時間 時間 Ion Total RNA-Seq Kit v2 時間 Ion OneTouch™ システム 図 1．Ion RNA-Seq のワークフロー Ion 318 ™ chip お よ び バ ー コ ード 化 さ れ た small RNA ライブラリを用いたワークフロー 時間 Ion PGM™ システム に基づいた操作時間を示しています。シーケン シングによる遺伝子発現解析のためのワークフ ローにおいて、100 塩基リード長の場合は、ラ イブラリ作成およびテンプレート調製に要する時 間は変わりませんが、シーケンシングおよびデー タ解析にはそれぞれ 2.5 時間および 2 時間を要 します。 Torrent Suite Ordering information 製品名 製品番号 Ion Total RNA-Seq Kit v2 4475936 関連製品 Ion Xpress™ RNA-Seq Barcode 1-16 Kit 4475485 mirVana™ miRNA Isolation Kit AM1560 ERCC RNA Spike-In コントロールミックス 4456740 公式 Facebook ページもチェック ! facebook.com/LifeTechnologiesJapan 取扱店 記載の社名および製品名は弊社または各社の商標または登録商標です。 研究用にのみ使用できます。ヒトおよび動物の治療または診断には使用できません。 The trademarks mentioned herein are the property of Life Technologies Corporation or their respective owners. © 2012, Life Technologies Japan Ltd. All rights reserved. Printed in Japan, 07/2012,ION042-A1207OB 販売条件：www.lifetechnologies.com/TC ライフテクノロジーズジャパン株式会社 本社：〒108-0023 東京都港区芝浦 4-2-8 TEL.03（6832）9300 FAX. 03（6832）9580 大阪：〒564-0052 大阪府吹田市広芝町 10-28 TEL.06（6389）1201 FAX. 06（6389）1206 www.lifetechnologies.com RNA-SeqKit2_0712.indd 2 12/07/12 15:55
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