Esercitazione_24

Chimica Organica – Acidi Nucleici 1. Disegnare la struttura completa del dinucleotide AG del DNA, fosforilato sia in 5’ che in 3’. 2. (a) rappresentare la struttura del dinucleotide del DNA CT. (a) quale sequenza di basi sull’altro filamento di DNA è complementare a questa? (c) rappresenta i legami idrogeno che intercorrono tra una coppia di basi (a tua scelta). 3. a) Rappresenta la struttura del trinucleotide del DNA: -‐TAC-‐ fosforilato sia all’estremità 5’ che 3’. b) quale è la corrispondente sequenza di basi sul filamento complementare? c) mostra in un caso a tua scelta l’appaiamento mediante i legami idrogeno tra due basi complementari. 4. Illustra la struttura del D-‐deossiribosio secondo la rappresentazione di Fischer, le strutture α e β che si formano mediante la sua reazione di ciclizzazione, e la struttura del suo nucleotide con la timina, fosforilato nella posizione 3’. 5. Illustrare la struttura a catena aperta secondo la rappresentazione di Fischer del D-‐ribosio, la sua reazione di ciclizzazione e la struttura del suo β-‐N-‐glicoside formato con l’uracile. 6. Disegna la struttura del dinucleotide AG del DNA fosforilato sia all’estremità 5’ che 3’. 7. Scrivere la struttura del nucleoside citidina. 8. Rappresenta la struttura del nucleotide dAMP ed i legami idrogeno che intercorrono tra la base presente su questo nucleotide e la base complementare sul tratto di filamento corrispondente. 9. Scrivere le strutture dei seguenti dinucleotidi derivati dal DNA, fosforilati sull’estremità 5’, ed in un caso a tua scelta mostra l'accoppiamento con le basi corrispondenti: a) A-‐T b) C-‐A 10. Sapendo che su un filamento di DNA la sequenza delle basi da 5’ a 3’ è: -‐A-‐G-‐G-‐C-‐T-‐C-‐ a) quale sarà la sequenza del filamento complementare? b) in un caso a tua scelta rappresenta in dettaglio la struttura dei legami idrogeno intercorrenti tra due basi complementari 11. Scrivi la struttura del dinucleotide AT del DNA, fosforilato sia sull’estremità 5’ che 3' e rappresenta l'accoppiamento con le basi corrispondenti. 12. Scrivi la struttura del dinucleotide U-‐G dell'RNA, fosforilato sia sull’estremità 5’ che 3'. 13. Disegnare la struttura per ciascuno dei seguenti casi: a. dCDP c. dUMP e. guanosina trifosfato b. dTTP d. UDP f. adenosina monofosfato 14. Indicare come ciascun gruppo funzionale nelle cinque basi eterocicliche negli acidi nucleici funzionano da accettori di legame idrogeno (A), donatori di legame idrogeno (D), oppure da entrambi (D/A).

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