Post Source Decay： PSDとは？ポストソース分解（Post Source Decay; PSD）は、MALDI-TOF-MS で、レーザー照射後に生成したイオンが、イオン源の加速電場を出た後のDrift Space（無電場領域）で、イオン自身の過剰な内部エネルギーまたは残留ガスとの衝突によって励起分解する現象である。イオン源 + + + + + + Drift Space + + PSDイオン + PSDでは、リフレクターモードで測定する理由 PSDが起きたとして・・・ + + + + + + + + + + + + Drift Space 飛んでいる間に分解していくので、各イオンの運動エネルギーはバラバラ。（イオン化したときに、全てのイオンが同じ場所で、同じ速度で飛んでいる訳ではない。）このまま、例えば、リニアモードで測定すると、同じ質量のイオンでも、バラバラに検出器に到達するので、分解能が悪くなる。分解能を上げるため、イオンの運動エネルギーのバラツキの補正をする必要がある。たくさんの電極を並べて、電場勾配をつくるイオン反射器を使うと、イオンの運動エネルギーのバラツキを打ち消すことができる。 + + 高圧電源運動エネルギーが大きいイオンは速いので、反射器に先に到着して、反射電場に逆らって奥まで入り込み、遠回りしてはね返る。運動エネルギーが小さいイオンは遅く到着するが、奥まで入れず近道をしてはね返る。はね返ってきたイオンを検出することで、運動エネルギーのバラツキを揃える事ができるので、同じ質量電荷比を持つイオンを揃えて検出でき、分解能が上がる。よって、PSDでは、イオン反射器を備えたリフレクターモードで解析を行う。 De novo sequencingとは？ De novo sequencingとは、ペプチドのMS/MSスペクトルから、数学的演算によりアミノ酸配列を算出する技術のことをいう。De novo はラテン語で、「初めから、新たに」を意味する。各アミノ酸のペプチド結合部分で順次切断された（y or b イオン）一連のプロダクトイオンピークが検出されたスペクトルが得られれば、ピーク間の質量差がアミノ酸残基質量に相当するので、演算により推定アミノ酸配列を決定できる可能性が高くなる。例えば、右のようなペプチドを考えてみる・・Q N A G F イオン化した・・ Q N A G F y5 y4 y3 y2 y1 このように表されるはず y2 y1 F G y4 A y3 N Q y5 ・・ m/z よって、ピーク間の質量差より元のアミノ酸配列を決定できる。（De novo sequencing） De novo sequencingの注意点解析する際、1残基アミノ酸、測定時に生じるその誘導体、2残基アミノ酸などのモノアイソトピック質量で、質量が非常に近接したものを考慮する必要がある。例えば、ピーク間の質量差が147.0だった場合、この質量差に相当するアミノ酸残基はF（Phenylalanine）であるという予想がされがちであるが、実際は、147.068であればFであるが、147.035であればMet-O（Methionineの酸化物）となる。これを識別するためには、小数点以下の桁数をより多く読み取れる高質量精度（Q-TOF型の質量分析装置による）のスペクトルを得ることが必要となる。モノアイソトピック質量 1残基アミノ酸同士 Lys（K）＝128.0949 Gln（Q）＝128.0585 ⊿＝0.0364 1残基アミノ酸と2残基アミノ酸 Trp（W）＝186.0793 AD（GE）＝186.0640 ⊿＝0.0153 etc・・・・ PSD（MS/MS解析）でDe novo sequencing リフレクターイオン化検出器特定イオンの選択 + + + + + + + + + + + + イオン化していない分解産物は反射しない励起分解 m1 m2 m3 m/z m1 PSDイオン m/z m1 PSDイオンの中からｙ or ｂイオンを探し、ｙ１、ｙ２、ｙ３、・・・・・と各々のピークの差から順々に並べると、元のm1のアミノ酸配列を決定することができる。ただし、一般にPSDスペクトルには、通常の生成イオンの他に脱アンモニアや、脱H2Oなどの分解物のピークも観測され、分解が進みすぎて解析が困難になることも多いと言われている。 m/z