DNAシーケンス解析ソフトウェア SEQUENCHER 5.4 2016年1月25日リリース！ ☆主な新機能のご紹介☆ ■ FastQCによるクオリティチェック機能 FastQ形式のファイルをクオリティチェックする、 FastQCが新機能として追加されました。 GeneCodes社のHPからダウンロードしてインストールする事で、SEQUENCHERのメニュー上で実行できます。 FastQCでは、ファイルのクオリティを複数の項目でチェックします。チェックした内容は、お客様がご使用の各種ブラウザで表示します。結果はご使用のパソコンに保存されますので、一度チェックした内容は後から閲覧することも可能です。 ☆その他の更新・追加機能☆ NGS解析やRNA-Seqの結果を管理するエクスターナルデータブラウザウィンドウの修正。 SUCCESS・FAILEDなど、処理の実行成否を新規項目で追加し、ボタンバーにソート項目を追加。 次世代解析機能のGSNAP・BWA-MEM用に、リファレンス配列のデータベース作成機能を追加。また、登録した参照配列の他に、ダイアログ内のドロップダウンメニューからデータベースの呼び出しが可能に。 DNA-Seq・RNA-Seqツールのバージョンを更新。RNA-Seqに加えて、GSNAPが64bit OS専用の機能に。 各機能のバグフィックスならびに、アップデート。 DNA-SeqツールやRNA-Seqツールなど、外部ツールのインストールで使用可能な各機能に、デフォルトボタンを追加。 RNA-Seqツールに、CuffquantとCuffnormを追加。ダイアログのメニューを更新し、ステータス表示をできるように修正。 シーケンチャーコネクションのセッションに新ステータスを追加。BLAST検索などで過去に実行済みのセッションは、グレイカラーで実行済みを表示。 Primer-BLASTの機能に、Primer Picker機能を追加。 SEQUENCHERの機能 ■ キャピラリーシーケンサデータ解析 ■ 次世代シーケンサデータ解析 • 様々なファイルフォーマットに対応 • NGSリード配列の各種フォーマットに対応 • ベクター配列、低クオリティ領域のトリミング機能 • コマンドラインツールをGUIから簡単に実行可能 • De novo アセンブルや参照配列をベースとした • Velvetによるde novo アセンブル機能アセンブル • MAQ、GSNAPとBWAによる参照配列へのアライメント • ClustalやMUSCLEによるマルチプルアライメント • マルチプレックスシーケンシングに対応（GSNAP,Velvet） • 参照配列とアセンブル結果のバリアンステーブ • 推奨設定による解析ツールの実行。詳細なパラメータ設によるSNP解析定も可能。 • アセンブル/アライメントデータと波形データを • NGS解析ビューワのTabletによる結果のグラフィカルな表同時に参照、比較示 V5.2の主な新機能 • シーケンス名の分類毎にアセンブルを実行 • SNP を考慮した参照配列へのアライメント • 解析結果のレポート出力機能 • バイサルファイト処理をしたDNA配列のメチル化解析機能 ■ その他の配列解析機能 SEQUENCHERではアセンブルだけではなく、以下の配列解析機能もございます。 • 制限酵素マップ作成機能 • インターネットBlast検索 • GenBankフラットファイルのアノテーションの • 系統樹作成読み込み、利用 • プライマー設計 • アミノ酸翻訳 • シンプルで分かり易い操作性、付属チュートリアルで、 • マルチプルアライメント（Clustal、Muscle）ソフトウェア習熟の時間を削減 <SNP解析画面> <プライマー設計画面> <Blast検索画面> ■動作環境 ■ Macintosh Windows 適用OS Mac OS 10.7以上 Windows 7 以降メモリ 3GB以上 3GB以上 HDD空容量 355MB以上必須 280MB以上必須 SEQUENCHERとは SEQUENCHERは、米国GeneCodes社の製品です。これまで92カ国15,000本以上の販売実績があり、とても使いやすいユーザインターフェイスで、長年に渡り全世界の研究者の皆様にお使い頂いているソフトウェアです。米国では、世界的に有名な公的研究機関、大学、製薬会社、バイオ産業でSEQUENCHERが使われています。 ※標準価格については弊社Webサイトをご覧ください。 ※FastQCの使用には、JAVA6 1．6以上のインストールが必要です。 ※RNA-Seqツール、DNA-Seqツールの一部機能に関しては、64bit OSのみの対応です。 ※左記はSEQUENCHER本体のみの動作環境です。外部ツールの使用には、左記以上のメモリと追加HDD容量が必要となります。必須メモリは８GB。GSNAPの使用には16GB以上を推奨します。追加HDD容量は、Mac320MB、Windows580MB以上必要です。無料体験版をお試し下さい！製品ホームページは、 SEQUENCHER で検索！ SEQUENCHER 体験版や製品のより詳細な情報は日立製作所のＨＰでご覧ください。 ※本カタログ中の会社名、商品名は各社の商標及び登録商標です。※本文中および図中では、TMマーク、®マークは表記しておりません。※製品の仕様は、改良の為、予告なく変更する場合があります。※本製品を輸出される場合には、外国為替及び外国貿易法並びに米国の輸出管理関連法規などの規制をご確認の上、必要な手続きをお取りください。なお、ご不明な場合は、弊社担当営業にお問い合わせください。 ■製品に関するお問い合わせについては下記へご連絡ください。株式会社日立製作所情報・通信システム社情報営業統括本部中島 Email: [email protected] 〒140-8573 東京都品川区南大井六丁目26番2号 TEL：03-5471-2976 FAX：03-5471-4017 ■ご購入後のサポートについて新規ライセンスには1年間の年間保守が含まれており、テクニカルサポートや無償アップグレードサービスを受けることができます。ご購入2年目以降は、有償の年間保守にお申込みの上、継続していただくことで、引き続きサービスを受けることが可能です