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HLAタイピング用プライマーセット
GS GType HLA Primer Set
GS Gtype HLA Primer Setは、454ゲノムシークエンサー専用の
HLAタイピング用プライマーセットです。
454の特長であるクローナルシークエンスにより、
従来のSequence Based Typing(SBT)法で問題となっていた
ambiguity* が解消され、正確にハプロタイプ測定ができるようになりました。
1ランでClassⅠ, ClassⅡを測定でき、2種類のプライマーセットを使い分けることで、
Medium Resolution、High Resolutionのタイピングが行えます。
時間短縮
サンプル調製から最短3日でタイピング結果が得られます。
高 精 度
テンプレートDNAのクローナルな
シークエンスによりambiguityを低減します。
スループット向上
マルチプレックスアッセイにより、
1ランで多検体処理が可能です。
解析サポート
シークエンス結果は市販の
HLA解析ソフトによるタイピングに利用できます。
*HLA領域は多型性に富み、従来の測定法ではヘテロ接合体の
判別が困難です。そのためambiguity(多義性、不確かさ)が生
じ、アレルの正確な区別が難しくなっています。
Resolution
Primer Set
ClassⅠ
ClassⅡ
High Resolution(MR + HR)
Medium Resolution
MR Primer Set
HR Primer Set
最大処理検体数
Resolution
Medium Resolution
High Resolution
GS FLX
80
40
GS Junior
10
5
HLA-A exon 2, 3
HLA-A exon 4
HLA-B exon 2, 3
HLA-B exon 4
表2 シークエンスプラットフォームと最大処理検体数
HLA-C exon 2, 3
HLA-C exon 4
マルチプレックス反応によって1ランで処理可能な検体数を示します。
DQB1 exon 2
DQB1
exon 3
DRB 1,3,4,5 exon 2
DPB1
exon 2
DQA1
exon 2
表1 プライマーセットのターゲットエクソン
MR、HR各セットのプレートにはリスト中のプライマーがあらかじめ乾燥状態でセットさ
れています。
MRプレートの使用で、Medium Resolutionのエクソン
(青色)
が、MRプレートとHR
プレートを組 合せて使 用するとリスト中の全てのエクソンのシークエンスによる
HighResolution HLAタイピングが可能です。
DRB遺伝子座はジェネリックプライマーにより重複遺伝子ファミリーの複数の遺伝子
(DRB1,3,4,5)
がシークエンスできるよう設計されています。
GS FL XとGS Juniorの両機種で利用できます。検体数にあわせて最適な機種を
ご選択ください。
従来法との比較
従来の方法(SBT法)でアレルの区別を困難にする大きな問題
っていた時間と労力の浪費を抑えながら、迅速で明確なHLAハ
となっていたambiguityを454テクノロジーによって低減し、
プロタイピングが可能になりました。
アレル判定精度を大きく向上させました。今まで再測定にかか
従来法(一般的なSBT法)
サンプル
DNA精製
クラス別の
プライマー
による
PCR増幅
キャピラリー
シークエンス
再測定
2∼3回
アレル特異的
PCR
シークエンス等
HLA GType Primer Set + 454シークエンス法
サンプル
DNA精製
PCR増幅
タイピング
ソフトによる
解析
HLAタイプ
決定
Ambiguity
による
アレル判別不能
dy!
Spee
454
シークエンス
タイピング
ソフトによる
解析
HLAタイプ
決定
HLAタイピング解析
シークエンスによる配列情報からのHLAタイプ判別は、Assign™
−ATF(Conexio Genomics)等のシークエンス解析ソフトウェア
が利用できます。ソフトウェアは、IMGT HLAシークエンスデータ
ベースと照合し自動的にHLAタイプを判別します。
*HLAタイピングソフトウェアについてはお問合せください。
ゼロ・ミスマッチなHLA-Bタイピング結果
(B*15:10:01/B*38:01:01)
製 品 名
製品番号
GS GType HLA MR Primer Set
5 872 529
GS GType HLA HR Primer Set
5 872 537
包装単位
希望販売価格
(税抜)
1セット
乾燥状態のプライマー(10サンプル分) 各120,000円
がセットされたプレート4枚セット
本製品は研究用試薬です。
診断目的に利用することはできません。
For life science research use only.
Not for use in diagnostic procedures
454, 454 SEQUENCING, GS FLX, GS JUNIOR, and
GTYPE are trademarks of Roche.
All other product names and trademarks are the
property of their respective owners.
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