HLAタイピング用プライマーセット GS GType HLA Primer Set GS Gtype HLA Primer Setは、454ゲノムシークエンサー専用の HLAタイピング用プライマーセットです。 454の特長であるクローナルシークエンスにより、 従来のSequence Based Typing(SBT)法で問題となっていた ambiguity* が解消され、正確にハプロタイプ測定ができるようになりました。 1ランでClassⅠ, ClassⅡを測定でき、2種類のプライマーセットを使い分けることで、 Medium Resolution、High Resolutionのタイピングが行えます。 時間短縮 サンプル調製から最短3日でタイピング結果が得られます。 高 精 度 テンプレートDNAのクローナルな シークエンスによりambiguityを低減します。 スループット向上 マルチプレックスアッセイにより、 1ランで多検体処理が可能です。 解析サポート シークエンス結果は市販の HLA解析ソフトによるタイピングに利用できます。 *HLA領域は多型性に富み、従来の測定法ではヘテロ接合体の 判別が困難です。そのためambiguity(多義性、不確かさ)が生 じ、アレルの正確な区別が難しくなっています。 Resolution Primer Set ClassⅠ ClassⅡ High Resolution(MR + HR) Medium Resolution MR Primer Set HR Primer Set 最大処理検体数 Resolution Medium Resolution High Resolution GS FLX 80 40 GS Junior 10 5 HLA-A exon 2, 3 HLA-A exon 4 HLA-B exon 2, 3 HLA-B exon 4 表2 シークエンスプラットフォームと最大処理検体数 HLA-C exon 2, 3 HLA-C exon 4 マルチプレックス反応によって1ランで処理可能な検体数を示します。 DQB1 exon 2 DQB1 exon 3 DRB 1,3,4,5 exon 2 DPB1 exon 2 DQA1 exon 2 表1 プライマーセットのターゲットエクソン MR、HR各セットのプレートにはリスト中のプライマーがあらかじめ乾燥状態でセットさ れています。 MRプレートの使用で、Medium Resolutionのエクソン (青色) が、MRプレートとHR プレートを組 合せて使 用するとリスト中の全てのエクソンのシークエンスによる HighResolution HLAタイピングが可能です。 DRB遺伝子座はジェネリックプライマーにより重複遺伝子ファミリーの複数の遺伝子 (DRB1,3,4,5) がシークエンスできるよう設計されています。 GS FL XとGS Juniorの両機種で利用できます。検体数にあわせて最適な機種を ご選択ください。 従来法との比較 従来の方法(SBT法)でアレルの区別を困難にする大きな問題 っていた時間と労力の浪費を抑えながら、迅速で明確なHLAハ となっていたambiguityを454テクノロジーによって低減し、 プロタイピングが可能になりました。 アレル判定精度を大きく向上させました。今まで再測定にかか 従来法(一般的なSBT法) サンプル DNA精製 クラス別の プライマー による PCR増幅 キャピラリー シークエンス 再測定 2∼3回 アレル特異的 PCR シークエンス等 HLA GType Primer Set + 454シークエンス法 サンプル DNA精製 PCR増幅 タイピング ソフトによる 解析 HLAタイプ 決定 Ambiguity による アレル判別不能 dy! Spee 454 シークエンス タイピング ソフトによる 解析 HLAタイプ 決定 HLAタイピング解析 シークエンスによる配列情報からのHLAタイプ判別は、Assign™ −ATF(Conexio Genomics)等のシークエンス解析ソフトウェア が利用できます。ソフトウェアは、IMGT HLAシークエンスデータ ベースと照合し自動的にHLAタイプを判別します。 *HLAタイピングソフトウェアについてはお問合せください。 ゼロ・ミスマッチなHLA-Bタイピング結果 (B*15:10:01/B*38:01:01) 製 品 名 製品番号 GS GType HLA MR Primer Set 5 872 529 GS GType HLA HR Primer Set 5 872 537 包装単位 希望販売価格 (税抜) 1セット 乾燥状態のプライマー(10サンプル分) 各120,000円 がセットされたプレート4枚セット 本製品は研究用試薬です。 診断目的に利用することはできません。 For life science research use only. Not for use in diagnostic procedures 454, 454 SEQUENCING, GS FLX, GS JUNIOR, and GTYPE are trademarks of Roche. All other product names and trademarks are the property of their respective owners. ⓒ 2011 Roche Diagnostics. All rights reserved. 1106C30-1 AS事業部(研究用試薬・機器) 〒105-0014 東京都港区芝2丁目6番1号 TEL.03-5443-5287 FAX.03-5443-7098 E - M a i l:[email protected] U R L:http://www.roche-biochem.jp
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