人獣共通感染 E型肝炎ウイルス (HEV)検出システム 2008年12月の段階で、DNA data bankに登録されているE型肝炎ウイルス のORF2遺伝子全てを解析し、HEVのウイルス遺伝子をRealtimeRT-PCRで 特異的に検出できるprimer set (HEV Universal RealtimeRT-PCR primer)、 Genotype 3およびGenotype 4 を特異的に検出できるprimer set (HEV Genotype3/4 detection primer)を考案、設計しました。 Avian AvianHEV 3c E116-YKH98C swX07-E1 swMN06-C1056 Osh205 Genotype3 HE-JA04-1911 swJ12-4 swJ8-5 swMN06-A1288 E088-STM04C Arkell HE-JA10 JMY-Haw JKN-Sap HEV-US1 HEV-US2 3b HEV検出システム swMeng pSHEV-3 wbJYG1 pSHEV-2 pSHEV-1 swJ570 E097-OSA05C JRA1 JBOAR1-Hyo04 JMO-Hyo03L JJT-Kan JSO-Hyo03L JDEER-Hyo03L JTH-Hyo03L JYO-Hyo03L swDQ swGX40 HEVN2 JYI-ChiSai01C Ch-S-1 3a HEVN1 wbJSG1 wbJTS1 JE03-1760F p5B JE03-1760F p13-3 JMNG-Oki02C p5 JE03-1760F JE03-1760F JE03-1760F 114-A549 p10JE03-1760F p0 wt 118d-Alex JKO-ChiSai98C swGX32 T1 HEV Universal RealtimeRT-PCR primer set ↓ HEV Genotype3/4 detection primer set Mex-14 swCH25 IND-SW-00-01 I1 Genotype2 swCH31 C4 E067-SIJ05C C1 SAR-55 SH-SW-zs1 pSK-HEV-2 P1 C5 C3 E087-SAP04C CCC220 HE-JA28 HE-JA36 HE-JA41 HE-JA37 HE-JA19 HE-JF4 JSW-Sap95 JKK-Sap JTS-Sap02 JYW-Sap02 HE-JF5 HE-JA2 JAK-Sai HE-JF3 HE-JI4 HE-JA1 swJ13-1 JSN-Sap-FH02C JSN-Sap-FH JYN-Sap01C JSF-Tot03C JYN-Nii02L HE-JK4 Morocco Genotype4 HPESVP B1I3 I4 P2 India TK15-92l T3 Genotype1 0.1 substitutions/site HEV遺伝子ORF2塩基配列による分子系統樹 (Genoype1~4が明確に分離できます) 0.1 左図の、発現しているHEV遺伝子を全て 検出でき、さらにGenotype3および Genotype4の遺伝子を特異的に検出・同 定できます。
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