FuzeSeq™抗体

FuzeSeq™ 抗体
多様な抗体レパートリーの最適化
次世代シークエンシング
ファージディスプレイは、多様な自然および合成ライブ
ラリから特定の標的に対する親和性を有する抗体を検
出します。サンガー法シークエンシングは、抗体のダウ
ンストリーム解析および構造解析のためのファージディ
スプレイライブラリのスクリーニングに欠かせません。
しかし、サンガー法シークエンシングは出力が限られ
るため、どの抗体レパートリーに対しても低解像度の
スナップショットしか提供できません。
次世代シークエンシング( NGS )は、複 雑なシステム
の特性化には非常に適していますが、サイズの大きな
アンプリコンの処理能力は限られています。GENEWIZ
は、ファージディスプレイ抗体ライブラリの次世代シー
クエンシングを改良する独自の方法を開発しました。こ
の方法は、従来のNGSによるアンプリコンのサイズ制限
を克服し、高分解能の抗体レパートリーデータの提供を
可能にします。
FuzeSeq™抗体シークエンシングはファージディスプレイの
インサート技術を改良し、Illuminaで読み取り可能な塩基
長の範囲内で、抗体の重鎖可変領域および軽鎖可変領域
ペアのシークエンシングを可能としました。FuzeSeq™は、
サンガー法シークエンシングと比べて100万倍のカバレッジ
で抗体ライブラリをシークエンシングし、多様なライブラリ
からの検出が困難なエピトープに対して高い親和性を有す
る抗体の検出を可能にします。さらに、FuzeSeq™によって
シークエンス前のライブラリの質と多様性を確保すること
ができます。また、従来のシークエンシング法ではパンニン
グを複数ラウンド繰り返す必要があることから生じていた
特有の増幅バイアスを制限します。
特徴とメリット
従来のNGS
従来のNGS
シークエンシング
バイオパニングのラウンドを
最小化することによって、
対
VHおよび VL領域ペアを分析し、
高品質かつ多量のデータを作成
VL
VH
VH
VL
抗体のワークフローを効率化
頻度の低い
サンガー法シークエンシングに
補性決定領域(CDR)の
比べて抗体ライブラリのより深い
検出が可能
カバレッジが可能
包括的なバイオインフォマティクスソリューションを
提供しています
GENEWIZ国内お問い合わせ窓口:
技術的なご質問はジーンウィズ・ジャパン プロジェクトマネージメントチームまでご相談ください。
専門科学者による専任チームがお客様のプロジェクトのご相談を承ります。
www.genewiz.jp/public/index.aspx
従来のNGSの
インサート長の
限界を克服
ジーンウィズ・ジャパンプロジェクト
マネージメントチーム
[email protected]
FuzeSeq™ 抗体
FuzeSeq™は、より短いインサートを生成する
ための独自の方法を使用し、NGSのデータの
質と出力を大幅に向上しました。
Fuze
VH
C
VL
VL
VH
VH
C
C
データの質
および
出力の向上
VL
短い
インサート
C
従来のNGS
VH
C
VL
インビトロ セレクション
および/またはナイーブ
抗体ライブラリ
VL
VH
長い
インサート
VH
重鎖可変領域
VL
軽鎖可変領域
C
定常領域
FuzeSeq™ 抗体リンカー配列
FuzeSeq™
抗体
RAWデータの量
データの質
フィルター後の
全配列VH-VLの
ペアリング
頻度の低いCDR
の検出
Illumina
プラットフォーム
による従来のNGS
+
+
+
_
+
+
サンガー法
シークエンシング
_
コスト
(米ドル)
コスト
(米ドル)
FuzeSeq™抗体の利点
ファージライブラリの数
100000000
10000000
1000000
+
ファージライブラリの数
100000000
100000
10000000
10000
1000000
1000
100000
10010000
_
+
_
10
1
1000
100
10
1
_
ファージライブラリの数
ファージライブラリの数
FuzeSeq™抗体
FuzeSeq™抗体
サンガー法シークエンシング
サンガー法シークエンシング
(1ライブラリあたり
384
のコロニーをスク
リーニング)
(1ライブラリあたり384
のコロニーをスク
リーニング)
サンガー法シークエンシング
サンガー法シークエンシング
(1ライブラリあたり96のコロニーをスクリーニング)
(1ライブラリあたり
96のコロニーをスクリーニング)
サンプルの提出
成果物
• ファージミドベクターDNA
• 重鎖可変領域および軽鎖可変
領域を含むアンプリコン
RAWデータ
バイオインフォマティクスレポート:
FASTQ
• VH/VLペア、CDR検出と豊富な分析
• VH/VLペア、CDR長の分布とクラスター分析
• カスタムレポート
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