IN Cell Translator Version 2.0.92 簡易マニュアル 1 IN Cell Translator 概要 IN Cell Translatorは、各種イメージング機器により撮影した画像ファイルを、IN Cell Investigator を用いて画像解析を行うために、XDCE image stackを作成するためのソフトです。 顕微鏡 Tiff 画像 IN Cell Investigator による画像解析 Tiff ファイル の読み込み XDCE image stack の作成 IN Cell Translatorでできるようになること • 各種イメージング機器により撮影した画像から、XDCE image stackを作成 • IN Cell Analyzer1000/2000で、複数回に分けて撮影した画像を、１つのXDCE image stackに統 合 • .XDCEファイルが破損した場合に再び作成 IN Cell Translator / IN Cell Investigator 対応画像フォーマット • グレースケール.TIFF画像 • 8、12、16 bit ＊ 注意点 IN Cell Analyzer 1000/2000 以外の画像では、画像ピクセルサイズの情報は反映されません。面積、長さな どの測定値は相対値として用いてください。 2 IN Cell Translator 使用方法 - IN Cell Translator で.xdce を作成 .xdce ファイルとは IN Cell Analyzer 2000 で取得したイメージを、解析ソフトウェア Investigator で解 析するときに、それぞれのイメージがどの位置で、どの波長で撮影されたものであるかを特徴付ける ための紐付けファイルです。Investigator ではこの紐付けファイルを開くことによって、関連するイメ ージをまとめて解析することができます。 1. IN Cell Translator を起動します。 Stack Builder を選択 2. Stack Builder を選択して Build Stack ボタンをクリックします。 Build Stack を クリック 3 3. Stack Builder が起動します。 4. 解析する TIF ファイルを保存したフォルダを指定して、ファイルパターンとして“IN Cell (XDCE)2”を選択します。指定したフォルダにある TIF ファイルがリストアップ されます。 他に HTD/TIFF（Molecular Devices and MetaMorph/Discovery systems）、DIB（Cellomics and BioApplications） 、MAC/TIFF（BD PathwayTM System and Cytoprint）、TXT/TIFF （MIAS-2）ファイルに対応しています。 TIF ファイル を保存したフ ォルダをチェ ク File Pattern で IN Cell (XDCE)2 をチェック 選択したフォルダ 内にある TIF ファ イルがリストアッ プ れ 4 5. 例えば Standard Stack Parameters で Emission Filter をチェックすると、表に項目 が追加されます。 ク リ ッ ク し て 開 い た Standard Stack Parameters ウィンドウで、必要に応じ て追加項目をチェックしま す 5 6. それぞれの TIF ファイルについて、Row（行）、Column（列）、Field/Site（視野）、 Emission Filter（励起波長）を直接キーボード入力して割り当てます。 上図は核と細胞質を波長の異なる蛍光でそれぞれ撮影したスライドのイメージで す。Row、Column、Field/Site、Emission Filter は個々のイメージの位置付けがはっ きりすれば、実際とは異なっていても特に問題ありません。 例えば図では Excitation Filter は核イメージが 360 nm、細胞質イメージが 475 nm ですが、それぞれ 1 と 2 としています。 Note: 全てのイメージについて入力してください。フォルダに解析しないイメー ジが含まれる場合は、そのイメージをハイライトしてウィンドウ左下にあ る Remove Items をクリックして除いてください。 複数のイメージに同じ Row、Column、Field/Site、Emission Filter 情報を割 り当てないでください。 7. 紐付け情報を割り当てが終了したら Convert 8. 保存先を指定します。 9. 保存先のフォルダを作成します。 Note: アイコンをクリックします。 TIF 画像と同じデレクトリには保存できません。 6 10. xdce ファイルの名称を入力します。 11. ファイルの作成が終了すると下のように表示されます。 12. Close…をクリックしてダイアログを閉じます。Stack Builder ウィンドウを閉じます。 13. No をクリックしてダイアログを閉じます。 14. X をクリックして IN Cell Translator を閉じます。 7 - Developer Toolbox で作成した xdce ファイルを開く 1. Developer Toolbox を起動します。 2. ショートカットバーにある View Analyze Image Stack アイコンをクリック して、Retrieve Image Stack ダイアログで作成した xdce ファイルを指定して Open をクリックします。 8 3. Developer Toolbox ではカラーイメージは解析できません。24 ビットカラーイメー ジを開くと Convert Image or Display ダイアログが表示されるので、Convert Image をチェックして OK をクリックしてください。 TIF イメージの表示 をディスプレイの 設定に合せて変換 ます 4. 解析するイメージが開きます。 9 10 © 2011 GE ヘルスケア・ジャパン株式会社 本書の全部または一部を無断で複写複製することは、著作権法上の例外を除 き、禁じられています。本書に掲載されている製品の名称、仕様などは改良のため予告なく変更される場合があります。 掲載されている社名や製品名は、各社の商標または登録商標です。 11
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