RNAシーケンス ライブラリー調製キット製品ガイド

RNA シーケンス
ライブラリー調製キット 製品ガイド
サンプルから答えまで
RNA シーケンスにより、遺伝子発現解析は次のステップへと進み、細胞内 RNA の網羅的定量解析や、トラン
スクリプトーム全体像の情報の取得、さらには選択的スプライシング、融合遺伝子の検出も可能になりました。
イルミナではライブラリー調製からデータ解析までの一連の RNA シーケンスワークフローをサポートして
います。ここでは、さまざまな用途にご利用いただける RNA ライブラリー調製キットを紹介します。
2
RNA シーケンス
RNA シーケンスにより、細胞内の RNA の網羅的定量解析が可能で、トランスクリプトーム全体像の情報の取
得や選択的スプライシング、融合遺伝子の検出も可能です。イルミナでは、さまざまな用途にあった RNA ライ
ブラリー調製キットを提供しています。
RNA ライブラリー調製キット一覧
mRNA ライブラリー調製キット.....................................................................................................4 ページ
ストランド情報に
興味がある
No
ストランド情報に
Yes
興味がある
No
TruSeq RNA Sample Prep Kit v2
ncRNAにも
No
Yes
ncRNAにも
No
FFPEサンプルを
No
FFPEサンプルを
No
使用したい
興味がある
使用したい
Yes
Yes
興味がある
Yes
TruSeq RNA Sample Prep Kit v2
TruSeq Stranded mRNA Sample Prep Kit
TruSeq Stranded mRNA Sample Prep Kit
TruSeq RNA Access Library Prep Kit
Yes
TruSeq RNA Access Library Prep Kit
全トランスクリプトーム解析 ..........................................................................................................6 ページ
細胞質だけでなくミトコンドリアの
rRNAも除去したい
No
細胞質だけでなくミトコンドリアの
rRNA
も除去したい
Yes
No
Yes
TruSeq Stranded Total RNA Ribo-Zero H/M/R
Yes
No
Yes
血液サンプルを
Yes
使用したい
No
血液サンプルを
使用したい
Yes
植物に
興味がある
植物に
興味がある
Small RNAに
興味がある
Small RNAに
興味がある
Yes
Yes
Yes
Yes
TruSeq Stranded Total RNA Ribo-Zero H/M/R
TruSeq Stranded Total RNA Ribo-Zero Gold
TruSeq Stranded Total RNA Ribo-Zero Gold
TruSeq Stranded Total RNA Ribo-Zero Globin
TruSeq Stranded Total RNA Ribo-Zero Globin
TruSeq Stranded Total RNA Ribo-Zero Plant
TruSeq Stranded Total RNA Ribo-Zero Plant
TruSeq Small RNA Sample Prep Kit
TruSeq Small RNA Sample Prep Kit
ターゲットRNAパネル .................................................................................................................8 ページ
ターゲット RNA カスタムパネル....................................................................................................9 ページ
small RNA シーケンス ..............................................................................................................10 ページ
リボソームプロファイリング ........................................................................................................11 ページ
ライブラリー調整キットセレクター
豊富なライブラリー調製キットの製品群から、研究のニーズに最適なキットを選択できるツールです。
www.illumina.com/library-prep-array-kit-selector.html
ライブラリー調製キットセレクター
豊富なライブラリー調製キットの製品群から、
研究のニーズにあわせて、最適なキットを選択できる便利
なツールです。ぜひご利用ください。
www.illumina.com/library-prep-array-kit-selector.html
3
mRNA ライブラリー調製キット
イルミナの TruSeq RNA v2 サンプル調製キットで
は、poly-A により Total RNA から mRNA を選択的
ストランド特異的手法
に回収することで、発現遺伝子を定量的に測定する
ことが可能です。
RNA
ストランド情報が必要な場合は、ストランド特異的手
2nd Strand cDNA合成
の際に dUTP を使用
法を用いた TruSeq Stranded mRNA サンプル調
1st Strand cDNAの合成
1st Strand cDNA
製 キットを 用 いることで、どちらの DNA 鎖 から
2nd Strand cDNA
アダプター付加
RNA が転写されたか同定できます。
DNAの
TruSeq RNA Access ライブラリー調製キットでは、
cDNA 合成後ヒトコーディング領域(37Mb)をプ
増幅
dUTPを使った2nd Strand cDNA から増幅は
されず、1st Strand cDNA側からのみ増幅
ローブでハイブリダイゼーションするため、分解した
FFPE サンプルでも少量で効率的に解析が可能です。
RNA テンプレートから 1st strand cDNA を合成。 2nd strand cDNA 合
成の際に、dTTP の代わりに dUTP を使うことで、T の代わりに U が取り
特長
込まれる。 dUTP 配列を鋳型として増幅されないので、dUTP をもたな
• ストランド情報の取得が可能
のみが合成される。
い 1st strand cDNA のみを鋳型として増幅が行われ、一方向からの断片
• 分解した FFPE サンプルでも効率的に解析が可能
• マルチプレックスアッセイに対応したインデックスを
含むオールインワンキット
製品パフォーマンス
TruSeq RNA v2
TruSeq Stranded mRNA
サンプル調製キット
ライブラリー調製キット
Strand 情報
No
Yes
Yes
FFPE サンプル
No
No
Yes
100-1000ng
100-1000ng
10ng high quality RNA
20ng FFPE RNA
サンプルキット数
48
48、96
48
アッセイ時間
2日
2日
2.5 日
推奨リード数
5000 万
5000 万
5000 万
1
1
1
中出力 **;5
高出力 ***;16
中出力 **;5
高出力 ***;16
中出力 **;5
高出力 ***;16
Rapid;12
V3;60
V4;80
Rapid;12
V3;60
V4;80
Rapid;12
V3;60
V4;80
サンプル調製キット
インプット量
1 ランあたりのサンプル数(MiSeq)*
1 ランあたりのサンプル数(NextSeq)
1 ランあたりのサンプル数(HiSeq)
* MS-102-3001(約 2500 万クラスターで 75bp × 2 に対応)を使用した場合
** FC-404-2001(約 1.3 億クラスターで 75bp × 2 に対応)を使用した場合
*** FC-404-2002(約 4 億クラスターで 75bp × 2 に対応)を使用した場合
技術情報
RNA Access ライブラリー調製キットデータシート
http://www.illuminakk.co.jp/documents/pdf/datasheet_truseq_rna_access_library.pdf
4
TruSeq RNA Access
アッセイワークフロー
TruSeq RNA サンプル調製キット v2
Total
RNA
Poly-A で
mRNA 回収
cDNA
合成
ライゲー
ション
A テール
増幅
定量
増幅
定量
TruSeq Stranded mRNA サンプル調製キット
cDNA 合成でストランド特異的手法を採用
Total
RNA
Poly-A で
mRNA 回収
cDNA
合成
ライゲー
ション
A テール
TruSeq RNA Access ライブラリー調製キット
cDNA 合成でストランド特異的手法を採用
ヒトコーディング領域に対するプローブでハイブリダイゼーションすることで、FFPE サンプルでも効率的に解析
Total
RNA
RNA
断片化
cDNA
合成
ライゲー
ション
A テール
増幅
ハイブリ
ダイゼーション
増幅
定量
RNA Access ハイブリダイゼーションステップワークフロー
ビオチン
プロープ
ストレプト
アビジンビーズ
A. stranded RNA-Seq ライブラリーのプール
B. ターゲット領域にビオチン化プロープをハイブリダイズ
C. ストレプトアビジンビーズを用いてキャプチャー
D. ビーズから溶出
mRNA ライブラリー調製キット製品情報
カタログ番号
製品名
サンプル数
RS-122-2001
TruSeq RNA Sample Prep Kit v2 - Set A(12 インデックス付き)
48 サンプル
RS-122-2002
TruSeq RNA Sample Prep Kit v2 - Set B(12 インデックス付き)
48 サンプル
RS-122-2101
TruSeq Stranded mRNA LT Sample Prep Kit - Set A(12 インデックス付き)
48 サンプル
RS-122-2102
TruSeq Stranded mRNA LT Sample Prep Kit - Set B(12 インデックス付き)
48 サンプル
RS-122-2103
TruSeq Stranded mRNA HT Sample Prep Kit(96 インデックス付き)
96 サンプル
RS-301-2001
TruSeq RNA Access Library Prep Kit - Set A(12 インデックス付き)
48 サンプル
RS-301-2002
TruSeq RNA Access Library Prep Kit - Set B(12 インデックス付き)
48 サンプル
5
全トランスクリプトーム解析
全ト ラ ン スクリプト ー ム 解 析 に は、TruSeq
Stranded Total RNA サンプル調製キットが最
適です。本キットでは、Ribo-Zero によりリボソー
ム RNA(rRNA)を除去した後、cDNA を合成
Ribo-Zero による rRNA の除去
Total RNA
することから、コード領域および非コード領域の
B
RNA における新規転写産物の検出が可能で、
rRNA 除去液の付加
B
B
幅広い遺伝子発現変化を捉えることができま
B
す。 Ribo-Zero が セ ット に な っ た TruSeq
B
B
B
Stranded Total RNA サンプル調製キットに加
え、
Ribo-Zero キットのみの販売も行っています。
除去ビーズの付加
特長
ビーズと結合した
rRNA の除去
• Ribo-Zero により効率的にリボソーム RNA を除去
B
B
• ストランド情報の取得が可能
• さまざまな生物種に対応
B
B
B
B
ビオチン化したキャプチャープローブを用いて、特定の生物種の rRNA に結合さ
• マルチプレックスアッセイに対応したインデックス
せ、これらをストレプトアビジンビーズでキャプチャーすることで rRNA を除去。
を含むオールインワンキット
製品パフォーマンス
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero サンプル調製キット
Strand 情報
Yes
FFPE サンプル
Yes
インプット量
100-1000 ng
ヒト・マウス・ラット(細胞質)Ribo-Zero
ヒト・マウス・ラット(細胞質、ミトコンドリア)Ribo-Zero Gold
血液 Ribo-Zero Globin
植物 Ribo-Zero Plant
対応生物種
サンプルキット数
48、96
アッセイ時間
1.5 日
推奨リード数
1億
1 ランあたりのサンプル数(MiSeq)*
0.5
中出力 **;2
高出力 ***;8
1 ランあたりのサンプル数(NextSeq)
Rapid;6
V3;30
V4;40
1 ランあたりのサンプル数(HiSeq)
* MS-102-3001(約 2500 万クラスターで 75 bp × 2 に対応)を使用した場合
** FC-404-2001(約 1.3 億クラスターで 75 bp × 2 に対応)を使用した場合
*** FC-404-2002(約 4 億クラスターで 75 bp × 2 に対応)を使用した場合
アッセイワークフロー
TruSeq Stranded Total RNA サンプル調製キット
Ribo-Zero によりリボソーム RNA を除去、cDNA 合成でストランド特異的手法を採用
Ribo-Zero
処理
6
RNA
断片化
cDNA
合成
A テール
ライゲー
ション
増幅
定量
TruSeq Stranded Total RNA サンプル調製キット製品情報
カタログ番号
製品名
サンプル数
除去 RNA
RS-122-2201
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero LT
Sample Prep Kit - Set A(12 インデックス付き)
48 サンプル
細胞質 rRNA(ヒト、マウス、ラット)
RS-122-2202
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero LT
Sample Prep Kit - Set B(12 インデックス付き)
48 サンプル
細胞質 rRNA(ヒト、マウス、ラット)
RS-122-2203
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero HT
Sample Prep Kit(96 インデックス付き)
96 サンプル
細胞質 rRNA(ヒト、マウス、ラット)
RS-122-2301
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Gold LT
Sample Prep Kit - Set A(12 インデックス付き)
48 サンプル
細胞質、ミトコンドリア rRNA
(ヒト、マウス、ラット)
RS-122-2302
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Gold LT
Sample Prep Kit - Set B(12 インデックス付き)
48 サンプル
細胞質、ミトコンドリア rRNA
(ヒト、マウス、ラット)
RS-122-2303
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Gold HT
Sample Prep Kit(96 インデックス付き)
96 サンプル
細胞質、ミトコンドリア rRNA
(ヒト、マウス、ラット)
RS-122-2501
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin LT
Sample Prep Kit - Set A(12 インデックス付き)
48 サンプル
細胞質、ミトコンドリア rRNA、
グロビン mRNA
RS-122-2502
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin LT
Sample Prep Kit - Set B(12 インデックス付き)
48 サンプル
細胞質、ミトコンドリア rRNA、
グロビン mRNA
RS-122-2503
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin HT
Sample Prep Kit(96 インデックス付き)
96 サンプル
細胞質、ミトコンドリア rRNA、
グロビン mRNA
RS-122-2401
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Plant LT
Sample Prep Kit - Set A(12 インデックス付き)
48 サンプル
細胞質、ミトコンドリア、葉緑体 rRNA
RS-122-2402
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Plant LT
Sample Prep Kit - Set B(12 インデックス付き)
48 サンプル
細胞質、ミトコンドリア、葉緑体 rRNA
RS-122-2403
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Plant HT
Sample Prep Kit(96 インデックス付き)
96 サンプル
細胞質、ミトコンドリア、葉緑体 rRNA
サンプル数
除去 RNA
Ribo-Zero キット製品情報
カタログ番号
製品名
MRZH116
Ribo-Zero H/M/R Kit
6 サンプル
細胞質 rRNA(ヒト、マウス、ラット)
MRZH11124
Ribo-Zero H/M/R Kit
24 サンプル
細胞質 rRNA(ヒト、マウス、ラット)
MRZG126
Ribo-Zero Gold H/M/R Kit
6 サンプル
細胞質、ミトコンドリア rRNA
(ヒト、マウス、ラット)
MRZG12324
Ribo-Zero Gold H/M/R Kit
24 サンプル
細胞質、ミトコンドリア rRNA
(ヒト、マウス、ラット)
GZG1206
Globin-Zero Gold Kit
6 サンプル
細胞質、ミトコンドリア rRNA、
グロビン mRNA
GZG1224
Globin-Zero Gold Kit
24 サンプル
細胞質、ミトコンドリア rRNA、
グロビン mRNA
MRZPL116
Ribo-Zero Plant Leaf Kit
6 サンプル
細胞質、ミトコンドリア、葉緑体 rRNA
MRZPL1224
Ribo-Zero Plant Leaf Kit
24 サンプル
細胞質、ミトコンドリア、葉緑体 rRNA
MRZSR116
Ribo-Zero Plant Seed/Root Kit
6 サンプル
細胞質、ミトコンドリア、葉緑体 rRNA
MRZMB126
Ribo-Zero Bacteria Kit
6 サンプル
グラム陰性菌および陽性菌 rRNA
MRZB12424
Ribo-Zero Bacteria Kit
24 サンプル
グラム陰性菌および陽性菌 rRNA
MRZGN126
Ribo-Zero GramNegative Bacteria Kit
6 サンプル
グラム陰性菌 rRNA
MRZGP126
Ribo-Zero GramPositive Bacteria Kit
6 サンプル
グラム陽性菌 rRNA
MRZE706
Ribo-Zero Gold Epidemiology Kit
6 サンプル
細胞質、ミトコンドリア、細菌 rRNA
MRZE724
Ribo-Zero Gold Epidemiology Kit
24 サンプル
細胞質、ミトコンドリア、細菌 rRNA
MRZY1306
Ribo-Zero Gold Yeast Kit
6 サンプル
細胞質、ミトコンドリア rRNA
MRZY1324
Ribo-Zero Gold Yeast Kit
24 サンプル
細胞質、ミトコンドリア rRNA
* Ribo-Zero 処理後、TruSeq RNA サンプル調製キットや TruSeq Stranded mRNA サンプル調製キットを用いてライブラリー調製が可能です。
7
ターゲット RNA パネル
疾患特異的な遺伝子をターゲットとしたバリデー
ション済みの 10 種類の固定パネルと最大 1000 遺
伝子の同時解析が可能なカスタムパネルがありま
す。わずか 50ng のトータル RNA からスタートする
各パネルは、48 サンプルと 96 サンプルの 2 種類の
キットがあり、インデックスキットとあわせて利用する
ことで、最大 384 サンプルを同時に解析できます。
TruSeq ターゲット RNA アッセイワークフロー
トータルRNA
cDNA
ハイブリダイゼーション
伸長 ・ライゲーション反応
PCR増幅
特長
• 疾患特異的な遺伝子にフォーカスして、発現差解析
シーケンス用ライブラリー
などが可能
• 低品質サンプルや FFPE サンプルにも対応
精製したトータル RNA から cDNA を逆転写。アダプター配列のついた
カスタムオリゴヌクレオチドプローブがターゲット領域の上流と下流にハイ
ブリダイズし、伸長・ライゲーション反応を行い、その後 PCR 増幅により
シーケンス可能なライブラリーが構築される。
ターゲット RNA 固定パネル製品情報
カタログ番号
製品名
対象遺伝子数
サンプル数
77
77
76
76
63
63
93
93
100
100
28
28
52
52
105
105
76
76
177
177
48 サンプル
96 サンプル
48 サンプル
96 サンプル
48 サンプル
96 サンプル
48 サンプル
96 サンプル
48 サンプル
96 サンプル
48 サンプル
96 サンプル
48 サンプル
96 サンプル
48 サンプル
96 サンプル
48 サンプル
96 サンプル
48 サンプル
96 サンプル
固定パネル
RT-201-1001
RT-202-1001
RT-201-1002
RT-202-1002
RT-201-1003
RT-202-1003
RT-201-1004
RT-202-1004
RT-201-1005
RT-202-1005
RT-201-1006
RT-202-1006
RT-201-1007
RT-202-1007
RT-201-1008
RT-202-1008
RT-201-1009
RT-202-1009
RT-201-1010
RT-202-1010
TruSeq Targeted RNA Neuro Panel Kit
TruSeq Targeted RNA Neuro Panel Kit
TruSeq Targeted RNA Hedgehog Panel Kit
TruSeq Targeted RNA Hedgehog Panel Kit
TruSeq Targeted RNA Cell Cycle Panel Kit
TruSeq Targeted RNA Cell Cycle Panel Kit
TruSeq Targeted RNA Wnt Panel Kit
TruSeq Targeted RNA Wnt Panel Kit
TruSeq Targeted RNA Stem Cell Panel Kit
TruSeq Targeted RNA Stem Cell Panel Kit
TruSeq Targeted RNA P450 Panel Kit
TruSeq Targeted RNA P450 Panel Kit
TruSeq Targeted RNA P53 Panel Kit
TruSeq Targeted RNA P53 Panel Kit
TruSeq Targeted RNA NFkB Panel Kit
TruSeq Targeted RNA NFkB Panel Kit
TruSeq Targeted RNA Cardiotox Panel Kit
TruSeq Targeted RNA Cardiotox Panel Kit
TruSeq Targeted RNA Apoptosis Panel Kit
TruSeq Targeted RNA Apoptosis Panel Kit
インデックスキット
RT-401-1001
RT-402-1001
RT-402-1002
RT-402-1003
RT-402-1004
TruSeq Targeted RNA Index Kit(48 Indices, 48 Samples)
TruSeq Targeted RNA Index Kit A(96 Indices, 384 Samples)*
TruSeq Targeted RNA Index Kit B(96 Indices, 384 Samples)*
TruSeq Targeted RNA Index Kit C(96 Indices, 384 Samples)*
TruSeq Targeted RNA Index Kit D(96 Indices, 384 Samples)*
* それぞれ異なる 96 種類のインデックスで構成されているので、同時に使用すると最大 384 種類のインデックスに対応します。
技術情報
TruSeq ターゲット RNA 発現解析データシート
http://www.illuminakk.co.jp/documents/pdf/datasheet_target_rna_j.pdf
8
ターゲット RNA カスタムパネル
カスタムパネルでは、遺伝子全体、エクソン、ジャン
クション領域、非ジャンクション領域、cSNP、融合
遺伝子よりターゲット遺伝子を選択可能です。固定
化パネルや既存のカスタムパネルにターゲットを追
加することもできます。パネルの設計には無料のウェ
ブツール DesignStudio をご利用いただけます。
ターゲット RNA カスタムパネル製品情報
カタログ番号
製品名
サンプル数
RT-101-1001
TruSeq Targeted RNA
Custom Panel Kit
48 サンプル
RT-102-1001
TruSeq Targeted RNA
Custom Panel Kit
96 サンプル
TruSeq Targeted RNA Index Kit(8 ページ)と併せてご利用ください。
特長
• 最大 1000 遺伝子を同時に解析可能
• 既存パネルへのターゲット遺伝子の追加も可能
• 使いやすいインターフェースのツールで簡単にカスタ
ムデザインが可能
ターゲット RNA カスタムパネルのデザイン方法
1
DesignStudio* ( http://designstudio.illumina.
com/Home)にアクセスし、Start Design をクリッ
クし、RNA、 対 象 生 物 種 を 選 択した 後、Design
name にパネルの名前を入力して、Next をクリック
します。
* DesignStudio のご利用には、MyIllumina への登録が必要です。 MyIllumina は、
弊社ホームページより、無償で登録いただけます。
2
Configure Design で、プロジェクトタイプを選択し、
Create Project をクリックします。
Full Custom;搭載遺伝子の中から目的遺伝子を選択
Add-on;既存の固定パネルに、目的遺伝子を追加
Fixed;既存の固定パネルから、希望の遺伝子のみを選択
3
Search で目的遺伝子を検索、もしくは Free Text
で複数の遺伝子を同時入力し、Add Target をクリッ
クすると、
ターゲットが追加されます。File で専用ファ
イルをアップロードすることも可能です。
Review Design をクリックすると、デザインしたパ
ネルが確認できます。ご注文時には、
パネルデザイン
完了後に、弊社担当営業までご連絡ください。
9
small RNA シーケンス
miRNA のような small RNA は、発生、分化、腫
TruSeq Small RNA アッセイワークフロー
瘍進展、神経発生、ウィルス防御などといったさま
ざまな調節機能で重要な役割を果たしており、その
機能が注目されています。TruSeq Small RNA サン
プル調製キットは、Total RNA をスタート材料として、
RNA 5’アダプター
small RNA のライブラリーを調製できます。
RNA 3’アダプター
A. RNA 末端にアダプターをライゲーション
、5’末端
ワークフローは、ライゲース反応により 3’
にアダプターを付加した後、逆転写 PCR で cDNA
を合成し、PCR 増幅により、ライブラリーを調製し
ます。
B. 逆転写反応
特長
インデックス
• 発現プロファイルや新規 miRNA 探索などを目的とし
て、高感度で small RNA 解析が可能
• small RNA のヒドロキシル基をターゲットとした特異的
なアダプターを利用することで、small RNA ライブラ
リーを効率的に作製
C. PCR増幅
製品パフォーマンス
TruSeq Small RNA サンプル調製キット
スタート量
Total RNA 1000 ng
推奨リード長
50bp × 1
推奨リード数
1 ランあたりのサンプル数
(MiSeq:MS-102-2001)
1 ランあたりのサンプル数
(NextSeq:FC-404-2005)
発現プロファイル
探索
200 万リード
2000 万リード
7 サンプル
1 サンプル
200 サンプル
20 サンプル
TruSeq Small RNA サンプル調製キット製品情報
カタログ番号
製品名
サンプル数
RS-200-0012
TruSeq Small RNA Sample Prep Kit - Set A
24 サンプル
RS-200-0024
TruSeq Small RNA Sample Prep Kit - Set B
24 サンプル
RS-200-0036
TruSeq Small RNA Sample Prep Kit - Set C
24 サンプル
RS-200-0048
TruSeq Small RNA Sample Prep Kit - Set D
24 サンプル
* Set A~D は、異なる 12 種類のインデックスがそれぞれ含まれます。同時に使用すると、最大 48 種類のインデックスに対応します。
10
リボソームプロファイリング
リボソームプロファイリングでは、リボソームが付加
された mRNA 断片をシーケンスすることで、ある特
アッセイワークフロー
定の時点での細胞内のリボソーム活性を捉えること
ができます。これにより、細胞内でどのタンパク質
シクロヘキシミド
による細胞溶解
が活性化されているかを同定することができます。
TruSeq Ribo Profile キットには、細胞溶解からライ
ブラリー調製までバリデーション済みの試薬が含ま
ヌクレアーゼ
による消化
れるので、様々なバッファーや試薬類を準備する必
SEC もしくは超遠心
による RPF の回収
要がありません。
RPF の精製
特長
ライブラリー調製
• どの領域の mRNA が翻訳されているか翻訳制御を
解明
シーケンス
• タンパク質合成率やタンパク質量の予測が可能
シクロヘキシミドで処理をした細胞を溶解した後、ヌクレアーゼで細胞溶
• 哺乳類および酵母細胞に対応
解物を消化し、超遠心またはサイズ排除クロマトグラフィ(SEC)で回収
後、リボソームプロテクト mRNA 断片(RPF)を精製。アダプターを付
加させてライブラリーを調製。
製品パフォーマンス
MiSeq
NextSeq 500
̶
高出力モード
Rapid モード
高出力モード v3
カタログ番号
MS-102-3001
FC-404-2005
FC-402-4022
FC-401-3002
対応シーケンス試薬
MiSeq
Reagent Kit v3
(150 Cycle)
NextSeq 500
High Output v2 Kit
(75 Cycle)
HiSeq
Rapid SBS Kit v2 - HS
(50 Cycle)
TruSeq
SBS Kit v3 - HS
(50 Cycle)
1 サンプル
20 サンプル
15 サンプル
75 サンプル
対応モード
サンプル数
HiSeq 2500
リボソームプロファイリング製品情報
カタログ番号
製品名
サンプル数
RPHMR12126
TruSeq Ribo Profile Mammalian Kit
12 サンプル
RPYSC12116
TruSeq Ribo Profile Yeast Kit
12 サンプル
11
イルミナ株式会社
代理店
〒108-0014 東京都港区芝 5-36-7 三田ベルジュビル 22 階
Tel (03) 4578-2800 Fax (03) 4578-2810
www.illuminakk.co.jp
www.facebook.com/illuminakk
本製品の使用目的は研究に限定されます。 販売条件:www.illuminakk.co.jp/tc
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その他の会社名や商品名は、各社の商標または登録商標です。予告なしに仕様および希望販売価格を変更する場合があります。
Pub. No. RNA シーケンス製品ガイド 07AUG2015