非自己分子の認識 ３つの装置 構造生物学 抗体 (Antibodies) 主要組織適合性複合体 (MHC) 12．免疫系 Major Histocompatibility Complex T細胞受容体 (T-Cell Receptor) 1 2 非自己認識機構 B細胞 T細胞 抗体 TCR 抗体 MHC 抗原提示細胞 Fig. 15-1 3 4 抗体（IgGの例） 抗体の多様性部位 CDR：complementarity determining region ４量体分子 2本の重鎖＋2本の軽鎖 4つのSS結合 Igフォールド 潰れたβバレル 軽鎖に2つ，重鎖に4つ Fig. 15-2 VL Fig. 15-3 5 6 IgGの構造 Immunoglobulin Fold CL Fab VH CH1 CH2 Fc CH3 @1igt-1.txt Fig. 15-17 PDBID: 1IGT 7 Fig. 15-7 8 Constant domain CL 疎水性コアの様子 @1igt-2.txt PDBID: 1IGT A B G E D C F @1igt-6.txt Fig. 15-8(a) 9 10 Variable domain CDR1 VL G B F 多様性の実現機構 @1igt-3.txt CDR3 A PDBID: 1IGT PDBID: 1IGT CDR2 E D C C C Fig. 15-5 Fig. 15-8(b) 11 12 重鎖と軽鎖の相互作用 VHとVLの相互作用 VL Fig. 15-11(b) @1igt-4.txt Fig. 15-9(b) Fig. 15-10(b) PDBID: 1IGT VH Fig. 15-12 13 14 CH1とCLの相互作用 抗体認識法 CL 脂質や核酸などの低分子 くぼみで認識 @1igt-5.txt 蛋白質性の抗原 面で認識 PDBID: 1IGT CH1 Fig. 15-10 15 16 ( ( 抗体酵素の例 1c1e 1c1e くぼみで認識 ) PDB ) PDB 抗リゾチーム抗体の例 面で認識 PDB PDB PDB Fab (PDB 2001 1igt 1igy 1hzh ) @1c1e-1.txt @1fdl-1.txt PDB PDB Fab PDBID: 1C1E 1igt (PDB 1igy PDBID: 1FDL 1hzh ) Fig. 15-15 Fig. 15-14 http://pdbj.org/mom?id=21 17 2001 PDB 2/3 18 抗体の抗原認識の多様性 http://pdbj.org/mom?id=21 2/3 @1fdl-2.txt MHC 主要組織適合性複合体 PDBID: 1FDL pdb1yqv_lsq1 pdb3hfm_lsq1 19 20 Class I の図 MHC の働き MHC class I @1hsa-1.txt Class II: ダイマー PDBID: 1HSA 細胞内に取り込まれた外 Stryer Fig 33.25 （第6版） 来性抗原を結合して提示 Fig. 15-18 21 22 MHC class II MHC class I @1hsa-2.txt @1dlh-1.txt PDBID: 1DLH PDBID: 1HSA Fig. 15-18 23 Fig. 15-19 24 MHC class I 異なるペプチドの認識 RGYVYQGL FAPGNYPAL @1hsa-3.txt PDBID: 1HSA Fig. 15-20(a) @2vab-1.txt @2vaa-1.txt PDBID: 2VAA 25 PDBID: 2VAB 26 T細胞 TCRとMHCの相互作用 TCR T細胞受容体 MHC 抗原提示細胞 27 Fig. 15-1(b) 28 T細胞受容体の構造 MHCとTCRの結合 超可変領域 Vα Cα Vβ Cβ @1bd2-1.txt @1tcr-1.txt PDBID: 1BD2 PDBID: 1TCR Fig. 15-23 Fig. 15-22 29 30 TCRの認識の様子 課題 膜タンパク質の所で学習したように，抗 体分子ないしそのドメインは膜タンパク質 の結晶化に利用される．しかし，MHCは 利用されることが無い． なぜか？ @1bd2-2.txt PDBID: 1BD2 31 32
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