クライオプロテクタント選定に関する資料

2012年1月31日
公開実験打ち合わせ
クライオプロテクタントを用いた
「結晶工学的処理」による結晶の改善の試み
高エネルギー加速器研究機構 千田美紀
14年1月31日金曜日
1
クライオプロテクタントの探索
1. 結晶化条件をもとに、標準母液を作成する。(沈殿剤濃度を1.2∼2倍とし、final pHを結晶化
溶液と合わせたものを用いることが多い。)
※標準母液:結晶にヒビが入ったり溶けたりすることなく数日間安定に保存できる溶液。
○
2. 20∼30%(w/v)になるようにクライオプロテクタントを標準母液に加えた溶液を作成する。クライ
オプロテクタントを加えるとpHが大きく変化する場合があるため、finalのpHが結晶化溶液(標準母
液)と同じになるように調製する必要がある。
3. 同じように処理した見た目が同じような結晶でも結晶の質が同じとは限らない。最低でも同じ
手順で凍結した結晶を3個以上用意して、良し悪しを判断することが望ましい。
4.まずは、クライオプロテクタント溶液に30秒ソーキングした結晶を凍結し、Uni-Puckに詰め
た結晶をスクリーニングに用いるのがよいのではないか?
14年1月31日金曜日
2
クライオプロテクタントの探索のイメージ
Option
Glycerol
Ethlene glycol
PEG200
PEG400
PEG600
PEG4000
PVP K-15
MPD
1,6-Hexanediol
1,2-Propanediol
DMSO
2-Propanol
Ethanol
Methanol
D-Sucrose
D-Raffinose
D-Glucose
Trehalose (THL)
Erythritol
Xylitol
A
screening
THL
Erythritol
Combination
B
THL + Erythritol
Hampton Research CryoPro
14年1月31日金曜日
3
標準母液とクライオプロテクタントの例
サンプル名
結晶化条件
標準母液
クライオプロテクタント
溶液
2.1 M sodium formate
0.1 M acetate buffer
pH 5.3
2.5 M sodium formate
0.1 M acetate buffer
pH 5.3
2.7 M ammonium sulfate
0.1 M sodium citrate
0.2 M K/Na tartrate
30 mM magnesium chloride
pH 5.4
2.75 M ammonium sulfate
0.1 M sodium citrate
0.2 M K/Na tartrate
30 mM magnesium chloride
pH 5.4
30%(w/v) trehalose
2.75 M ammonium sulfate
0.1 M sodium citrate
0.2 M K/Na tartrate
30 mM magnesium chloride
pH 5.4
CagA(1-876)
7-10%(v/v) ethanol
50 mM Tris-HCl
pH 7.0
20%(v/v) ethanol
50 mM Tris-HCl
pH 7.0
30%(w/v) trehalose
20%(v/v) ethanol
50 mM Tris-HCl
pH 7.0
DDO
10%(w/v) PEG8000
0.1 M acetate buffer
pH 4.7
20%(w/v) PEG8000
0.1 M acetate buffer
pH 4.7
20%(v/v) glycerol
20%(w/v) PEG8000
0.1 M acetate buffer
pH 4.7
BphA4
TAF-Ibeta
14年1月31日金曜日
27.5% Glycerol
2.5 M sodium formate
0.1 M acetate buffer
pH 5.3
4