特集 MBL キャンペーン第 1 弾 MBL キャンペーン第 1 弾次世代シーケンスデータ解析初回依頼者限定特典プレゼントキャンペーン（容量：500GB、フォーマットはアメリエフで行います。）期間：2015 年 3月 31日ご依頼分までお問い合わせ・ご依頼はこちら mRNA-seq データ解析 Exome、mRNA-seq をお申込みいただいた方に HDD をプレゼント！ ¥ 80,000 / サンプル連！疾患関の探索に子伝遺 ■ 価格 ■ 解析フロー Group2 シーケンシング ¥ 16,000 グループ間比較シーケンシング FASTQ ¥ 20,000 合計　p value が 0.05 を下回る遺伝子をリストアップ家系図 ¥ 116,000 発症者の総変異数 11,095 既知の変異（dbSNP131）を除外 ■ ご納品物とフォーマット 8,788 アレル頻度が高い変異を除外 2,053 低クオリティの変異を除外 508 クオリティのレポート：HTML 転写産物の検出結果：EXCEL 17 発現量比較の結果：EXCEL ■ ご用意いただくデータ Case/Control情報両親がヘテロ、発症者はホモの変異報告書：PDF ファイルフォーマットアメリエフが実施 ■ ご納品物とフォーマットクオリティのレポート：HTML マッピング結果：BAM 変異情報：VCF 絞り込み結果：EXCEL 報告書：PDF ※ H D D の空き容量が、サンプル数 × 1 5 G バイトに満たない場合は、納品用のHDDをご用意ください。 ※ 融合遺伝子検出は、別途お見積りとなります。 ※ データの保存期間は2か月となります。 ※ お客様とご相談の上、必要なデータをご用意いただく場合もございます。 ※ 多検体でご依頼いただける場合にはボリュームディスカウントがございます。 8 ¥ 140,000 Exomeキャプチャのターゲット領域：BED インパクトが小さい変異を除外アメリエフが実施 3サンプル以上お申込みいただいた場合の価格となります。表示価格はサンプル当たりの希望納入価格で、すべて税別表記となっています。総塩基数は、1サンプル 3 G bまでとなります。イルミナの次世代シーケンサを使用したデータに限ります。納期につきましては、 8 サンプルを超える場合はご相談ください。お預かりしたHDDに解析データをコピーしてお送りしますので、データのバックアップを必ずご用意ください。 ¥ 60,000 シーケンスデータ：FASTQ 発現量の比較グループ情報ファイルフォーマット合計　81,420 ¥ 80,000 変異の絞り込み変異の絞り込みシーケンスデータ：FASTQ 発現量に差があった遺伝子の数をレポート ● VCF ■ ご用意いただくデータグループ間比較 FASTQからマッピング、 SNP/Indel検出クオリティコントロール、マッピング、変異検出マウス 2 グループ間の比較スプライスジャンクション検出、FPKM 算出 ○ FASTQ (組み合わせ1通りにつき) ◎ Case特異的な変異の絞り込みを実施 ◎ データお預かりから2週間のスピード納品 ■ 価格ヒアリングスプライスジャンクション検出 Group1 ¥ 60,000 / サンプル解析例）Exome sequence データ 3 サンプル ¥ 80,000 ヒアリング ◎ 変異の絞り込み ■ 解析フロー FASTQからFPKM算出解析例）mRNA sequence データ 6 サンプル ※ ※ ※ ※ ※ ※ [email protected] Human Exome-seq データ解析 ◎ FASTQ ファイルから FPKM 算出まで ◎ データお預かりから 2 週間のスピード納品クオリティコントロール、マッピング特集 ※ ※ ※ ※ ※ ※ 3 サンプル以上お申込みいただいた場合の価格となります。表示価格はサンプル当たりの希望納入価格で、すべて税別表記となっています。総塩基数は、1サンプル 8 G bまでとなります。イルミナの次世代シーケンサを使用して、ペアドエンドでシーケンスしたデータに限ります。納期につきましては、8 サンプルを超える場合はご相談ください。お預かりしたHDDに解析データをコピーしてお送りしますので、データのバックアップを必ずご用意ください。 ※ HDDの空き容量が、サンプル数×15Gバイトに満たない場合は、納品用のHDDをご用意ください。 ※ 遺伝モデルを用いた検出やコンパウンドヘテロの検出は、別途お見積りとなります。 ※ データの保存期間は2か月となります。 ※ お客様とご相談の上、必要なデータをご用意いただく場合もございます。 ※ 多検体でご依頼いただける場合にはボリュームディスカウントがございます。 ● NGS データ解析サーバ ● バイオインフォマティクストレーニング 1,000 Genomes Project や UK10K 等の国際プロジェクトで実績のあるソフトウェアを組み合わせたパイプラインを構築し、サーバの使い方および NGS 解析の基礎となる Linux 操作のトレーニングを行います。プリインストールして提供しています。研究の目的に合った解析環境をカスタマイズすることも可能です。お客様のニーズに合わせた内容で実施するので、実践的！ご好評いただいているスクールの内容を出張で提供可能！対象項目：Linux 入門、Perl 入門、R 入門等 9