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AFFIMER
抗体・アプタマーに代わる次世代検出試薬
試薬製品と受託サービスのご紹介
Affimer とは?
Affimer とはターゲット分子に対する親和
性と特異性を有し、抗体と同じように様々
なアプリケーションで使用することがで
きる約 13 kDa の改変小分子タンパク質で
す。ターゲット特異的な Affimer は動物
免疫ではなく、巨大な Affimer ライブラ
リーから
スクリーニングにより選
別します。また Affimer は 1 アミノ酸の
み異なるタンパク質や活性型および非活
性型の構造変化、タンパク質発現レベル
の僅かな違い等も区別して検出できます。
Affinity
Affimers
Antibodies
nM per peptide; 3peptides
pM - nM
Specificity- single aa change
Yes
Yes
Specificity- PTM
Yes
Yes
Specificity- conformation
Yes
Yes
13 kDa, 3 nm
150 kDa, > 15 nm
Yes
Difficult
Size
Expression in
Amenability to engineering
High
Low
Stability
High
Variable
ELISA, IF, IP, WB
Yes
Yes
PTM required for function
No
Glycosylation, oxidation
Internal cysteine/di-sulfides
None
Multiple
Limited by immune system
No
Yes
表 . Affimer と抗体の比較
Affimer の構造
Affimer は生物学的に不活性であり、物理的に安定な改変システ
インプロテアーゼインヒビターを基本構造としています ( 図 1)。
この基本構造にはヒトのプロテアーゼインヒビターである Stefin
A を改変した Type-I と、植物シスタチンを改変した Type-II が存
在し、両タイプの三次構造はほぼ相同です。Affimer の標的結合
部位はループ 1 および 2 であり、この領域にアミノ酸の多様性
をもたせることで Affimer ライブラリーを調製しています。N お
よび C 末端は蛍光色素や様々なタグ、酵素、リガンドを用途に
応じて容易に修飾可能です。また、Affimer 構造中からシステイ
ンを除いているため大腸菌内でジスルフィド結合が形成されず、
ロット間差なく容易に発現・精製することが可能です。さらに、
Type-I Affimer はヒト由来のタンパク質には結合しないよう改変
されているため off-target 効果を最小限に抑えられます。
図 1.Affimer Type-I および Type-II の基本構造
AFFIMER 抗体・アプタマーに代わる次世代検出試薬
Affimer 7つの利点
1.親和性と特異性
例(1)高親和性
例(2)高特異性
4 つの Affimer 候補 (Ψ で表記 ) が 酵母 SUMO のみを特異的に
抗マウス IgG2b 抗体 Affimer(14-G12)はマウス IgG2b のみを
認識し、ヒト SUMO には結合しないことを direct ELISA で確認
しました ( 図 2)。また等温滴定型熱量測定 (ITC) の結果から本
Affimer の Kd は約 30 nM でした。通常 Affimer の結合親和性は
Kd = 3-30 nM の範囲です。
特異的に認識し、その他のサブタイプにはほぼ反応性を示しま
せん(Direct ELISA)。また、本抗体を Horiba EZ-Plex SPRi
platform を用いて動態解析を行ったところ、その KD 値は 3 nM
でした。
Affimer (14-G12) to Mouse Immunoglobulin IgG2b (AVA00042)
Absorbance OD 480 nm
3.5
3
2.5
2
1.5
1
0.5
0
IgG1
IgG2a
IgG2b
IgM
IgG3
no cort
G12
図 2.Affimer の種特異性と標的親和性
図 3. 抗マウス IgG2b 抗体 Affimer (14-G12) のサブタイプ特異性
2.迅速な探索
3.品質
ターゲット特異的な Affimer は 10
10
リーを
10 の Affimer ライブラ
13
スクリーニングすることにより探索されます。
探索後に最も特異性の高い Affimer を納品するまでに要する
品質と安定供給が保証されます。納品される Affimer は配列
解析し、大腸菌発現で製造されます。また、Affimer はロット
間差なく安定供給されることを保証致します。
期間は約 8-9 週間であり、モノクローナル抗体作製期間に比
べて非常に短期間です。
4.構造安定性
Affimer はシングルドメインタンパク質であ
り、約 80℃の高温下でも安定です ( 図 5)。ま
た、pH 2 12 の範囲でも抗体に比べ非常に高
い安定性を有しています ( 図 6)。更に結合能
を失うことなく金やガラス、プラスチック表
面に固定化することが可能であり、バイオ
マーカー探索のためのマイクロアレイを構築
できます ( 図 7)。
図 5.Type-II Affimer 骨格と酵母 SUMO 特異的
Affimer の熱安定性 ( 示差走査熱量計分析 )
5.スモールサイズ
図 6.Type-I Affimer 骨格と IgG の pH 安定性比較
6.機能化の容易性
Affimer はある種の膜や組織を透過できるほど小さいため、広
Affimer は蛍光色素や様々なタグ (V5, c-myc, HA, N 末端シス
範なイメージング手法に最適な検出試薬です。また様々なアッ
テイン等 )、酵素、リガンドを用途に応じて容易に修飾可能な
セイ、センサー等の固相に高密度に固定化できるため S/N 比
ため、新しいアッセイ系の構築を迅速に行うことが可能です。
を改善することが可能です。
7.ライセンス
Avacta 社は Affimer の知的所有権を保有しており、様々なアプリケーションやターゲットに対してライセンスすることが可能です。Avacta
社は 2013 年にイギリスの Blueberry Therapeutics Ltd と薬剤耐性菌感染症に対する治療薬の開発に Affimer を使用するライセンス契約を締
結した実績がございます。
Affimer 探索受託サービス
記事 ID 検索
13266
Avacta Life Sciences メーカー略号:ALS
ご希望の標的物質に対する特異的な Affimer を探索して納品致します。
Step 1.スクリーニング
Avacta 社は Typ-I および Type-II Affimer 骨格の標的認識部位であるループ領域に多様性を
持つオリゴヌクレオチドプールと M13 phagemid vector を用いて調製した 1010 のファー
ジライブラリーを所有しています。このライブラリーを用いて標的に特異的な Affimer を
4 ラウンドのファージディスプレイ法で探索します。
*標的物質に応じて 108 酵母 two-hybrid ライブラリーを使用致します。
選択された Affimer 候補の親和性と特異性をマイクロアレイ、免疫沈降、ウエスタンブロッ
Step 2.QC
トで確認します。ご希望に応じて IHC, ICC, ELISA 等も実施可能です。この過程で選択され
た トップ 3 の Affimer 候補をお客様に納品させて頂き、最適な Affimer をご選択頂きます。
Step 3.納品
ご選択頂いた Affimer のプラスミド を納品致します。
● 必要な標的タンパク質量:100 µg
● 標的タンパク質の純度:95% 以上
● 標準納期:8 ∼ 9 週間
● 実績:製薬、臨床検査、食品安全等様々な領域の企業 50 社以上のタンパク質、ペプチド、小分子に対する Affimer の
探索を行い、探索成功率は 90% 以上です。得られた Affimer の kD 値は 3-30 nM という高い親和性を有していました。
ご注意:本サービスの結果得られた Affimer は研究用用途に限りご使用頂けます。商用利用をご検討のお客様はお気軽にご相談ください。
お見積り・ご注文方法
Web からの見積のご依頼をお願い致します。
コスモ・バイオの受託サービスは、Web サイトに より詳細な情報を掲載しています。
お見積りやお問い合わせもこちらから行えます! http://www.cosmobio.co.jp/
詳細情報へは、記事 ID 検索コードを使うと便利です。
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ご質問・ご不明の点は技術サービス部 テクニカルサービスグループまでお問い合せください。
また、秘密保持契約のご希望につきましても、下記までご連絡をお願いいたします。
TEL:03-5632-9615 FAX:03-5632-9614 E-mail:[email protected]
参考文献
1. Stadler
(2011) Structure-function studies of an engineered scaffold protein derived from Stefin A. II: Development and applications of
the SQT variant.
24(9) 751-63.
2. Tiede
(2014) Adhiron: a stable and versatile peptide display scaffold for molecular recognition applications.
27(5) 145-155.
AFFIMER 抗体・アプタマーに代わる次世代検出試薬
Affimer 試薬製品
包装:100 µg 希望販売価格:¥65,000
Immunology
品名
記事 ID 検索
14177
Avacta Life Sciences メーカー略号:ALS
品番
品名
品番
Anti-GM-CSF Affimer, Human
AVA00006
Anti-IL-1a Affimer, Human
AVA00061
Anti-CXCL13/BCA1 Affimer, Human
AVA00009
Anti-IL-1b Affimer, Human
AVA00062
Anti-MCP-1 Affimer, Human
AVA00052
Anti-IL-1b Affimer, Human
AVA00063
Anti-MCP-1 Affimer, Human
AVA00053
Cell Signalling / UPS
Avacta Life Sciences メーカー略号:ALS
品名
品番
Anti-diUbiquitin K6-linkage Affimer, Human
AVA00015
Anti-diUbiquitin K33-linkage Affimer, Human
AVA00016
Anti-diUbiquitin K48-linkage Affimer, Human
AVA00017
Anti-diUbiquitin K48-linkage Affimer, Human
AVA00018
Anti-diUbiquitin K48-linkage Affimer, Human
AVA00019
Anti-Ubiquitin Affimer, Human
AVA00020
Anti-SUMO Affimer, Yeast
AVA00022
Anti-SUMO Affimer, Yeast, Biotin
AVA00022-BIOTIN
Anti-SUMO1 Affimer, Human
AVA00024
Anti-SUMO1 Affimer, Human, Biotin
AVA00024-BIOTIN
Anti-Immunoglobulin
Avacta Life Sciences メーカー略号:ALS
品名
品番
品名
品番
Anti-IgG Affimer, Rabbit
AVA00034
Anti-IgG3 Affimer, Mouse
AVA00044
Anti-IgG Affimer, Rabbit
AVA00035
Anti-IgG3 Affimer, Mouse, Biotin
AVA00044-BIOTIN
Anti-IgG Affimer, Rabbit, Biotin
AVA00035-BIOTIN
Anti-IgM Affimer, Mouse
AVA00045
Anti-IgG Affimer, Rabbit
AVA00036
Anti-IgM Affimer, Mouse, Biotin
AVA00045-BIOTIN
Anti-IgG Affimer, Rabbit, Biotin
AVA00036-BIOTIN
Anti-IgY Affimer, Chicken
AVA00046
Anti-IgG1 Affimer, Mouse
AVA00038
Anti-IgY Affimer, Chicken, Biotin
AVA00046-BIOTIN
Anti-IgG1 Affimer, Mouse, Biotin
AVA00038-BIOTIN
Anti-IgG Affimer, Human
AVA00048
Anti-IgG2a Affimer, Mouse
AVA00039
Anti-IgG2b Affimer, Mouse
AVA00055
Anti-IgG2a Affimer, Mouse, Biotin
AVA00039-BIOTIN
Anti-IgG2b Affimer, Mouse, Biotin
AVA00055-BIOTIN
Anti-IgG2a Affimer, Mouse
AVA00040
Anti-IgG2b Affimer, Mouse
AVA00056
Anti-IgG2a Affimer, Mouse, Biotin
AVA00040-BIOTIN
Anti-IgM Affimer, Mouse
AVA00058
Anti-IgG2b Affimer, Mouse
AVA00041
Anti-IgM Affimer, Mouse, Biotin
AVA00058-BIOTIN
Anti-IgG2b Affimer, Mouse, Biotin
AVA00041-BIOTIN
Anti-IgM Affimer, Mouse
AVA00059
Anti-IgG2b Affimer, Mouse
AVA00042
Anti-IgG2b Affimer, Mouse, Biotin
AVA00042-BIOTIN
● 使 用 範 囲 ・・・ 記載の商品は全て、「研究用」です。
人や動物の医療用・臨床診断用・食品用等としては使用しないよう、十分ご注意ください。
技術サービス部
2015. 1
(12173)