アジレント・テクノロジー次世代シーケンサー用ソリューション SureSelect Coding + プロモーター + エンハンサー 113.7 Mb の領域をキャプチャ V5 + Regulatory 次世代シーケンサによるエクソーム解析の世界標準、アジレント・テクノロジーの SureSelect All Exon V5 の Coding 領域にプラスして、Regulatory 領域を同時にキャプチャするデザインです。プロモーターや一部のエンハンサー領域を、Coding 領域とともに Deep シーケンスすることにより、疾患研究に新しい知見をもたらす可能性があります。また RNA-Seq や ChIP-Seq と組み合わせることで、制御領域の変異が遺伝子発現に与える影響をより詳細に調べることができます。Coding 領域をキャプチャするプローブと、 Regulatory 領域をキャプチャするプローブのブレンド比を最適化し、より均一なカバレッジを達成しています。特長 ● 定評あるエクソンシーケンスの V5 のターゲット領域に加えて、プロモーターと一部のエンハンサー領域をキャプチャするデザイン。ターゲット領域のサイズは、113.7 Mb ● イルミナシーケンサ、ライフテクノロジーズ Ion Proton 対応 ● 必要なゲノム DNA 量は 50 ng ∼ 3 µg Regulatory 領域の Deep シーケンスが可能に！ Total Target Size：113.7 Mb Selected Regulatory Regions Coding Regions Human All Exon V5 Target Size 50 Mb # Genes 21,522 # Targeted Exons 357,999 • Promoter TSS~1 kb（17.1 Mb） • Selected Enhancer（40.8 Mb） • RegulomeDB Variants Category1 デザイン監修：（5.8 Mb）東京大学大学院新領域創成科学研究科鈴木穣先生イルミナ HiSeq2500を用いて、1レーンさらに本データを Coding 領域の 50 Mb と、追加された Regulatory 領域の 63.7 4 検体で癌セルラインサンプルをランした例です。113.7 Mb の全ターゲットの98%以上が5 x、94%前後が10 x、 80% 前後が 20 x でカバーされてい Mb に分けて解析した例です。Coding 領域についてはターゲットの 90% 以上が 20 x と高いカバレッジを示しています。Regulatory 領域についても、94% 以上が 10 x、80% 前後が 20 x でカバーされています。ます。図1 全ターゲット領域（113.7 Mb）のカバレッジ図2 Coding 領域（50 Mb）のカバレッジ図3 Regulatory 領域（63.7 Mb）のカバレッジ型番プロトコル品名 931071 マニュアル用 SureSelect XT Human All Exon V5+Reg. キャプチャライブラリ, 16 反応 931072 マニュアル用 SureSelect XT Human All Exon V5+Reg. キャプチャライブラリ, 96 反応 931073 自動化用 SureSelect XT Human All Exon V5+Reg. キャプチャライブラリ, 96 反応キット以外に必要になるものについては以下のウェブページの " サポート " の項をご参照ください。 http://AgilentGenomics.jp 販売店 [ お問い合わせ窓口 ] アジレント・テクノロジー株式会社本社 / 〒 192-8510 東京都八王子市高倉町 9-1 ●カストマコンタクトセンタ 0120-477-111 mail：email_ [email protected] ※本資料に記載の情報、説明、製品資料等は予告なしに変更されることがあります。 ※本資料記載の製品は全て研究用です。その他の用途にご利用いただくことはできません。 www.agilent.com/chem/jp © Agilent Technologies, Inc. 2014 Printed in Japan. Jul. 01. 2014