MiSeq ® デスクトップ型の次世代シーケンサー 使ってみたらこんなに簡単。世界に挑戦する私のパートナー。 ▶ 最短 8 時間で DNA からデータ解析 ▶ 世界シェア No.1 のテクノロジー ▶ 圧倒的なコストパフォーマンス 最短 8 時間で DNA からデータ解析 MiSeq システムは革新的な一体型システムデザインにより、抜群の使いやすさを誇ります。これまでの次世代シーケンサー は DNA 増幅からシーケンス、データ解析のワークフローは別々の装置で行っていましたが、MiSeq では一連のステップの 自動化に成功しました。わずか 15 分のハンズオンでランが開始でき、データ解析まで自動で行います。 2 時間で終了する Nextera サンプル調製キットを組み合わせれば、DNA からデータ解析まで最短 8 時間（35 塩基シングルリードの場合）で 実施できます。 各ステップごとに装置とハンズオンが必要です。 これまでの次世代 シーケンサー ハンズ オン DNA 増幅 ハンズ オン DNA 増幅からシーケンス、データ解析が全自動 ハンズ オン ハンズ オン シーケンス データ解析 サンプル調製 MiSeq オプション データ保管、解析 サンプル調製 15 分のハンズオンでラン開始 ベースコール サンプル調製：断片化装置 不要の 2 時間反応 * 試薬カートリッジで ランをスタート MiSeq Reporter で 安心のデータ解析 酵 素 反 応 に よ り DNA 断 片 化 を 行 う 試薬キットはカートリッジ式になっていま シ ス テ ム に 内 蔵 さ れ た Windows コ ン Nextera テクノロジーでは、高額な断片化 す。調製したサンプルをアプライして準備 ピューターでは、 ベースコールとアライメン 装置を必要としません。断片化、 アダプター は完了。フローセルと試薬カートリッジ、 トを行います。さらに MiSeq Reporter ソ 付加反応はシングルチューブで行うため、 廃液ボトルなどをセットした後は、タッチパ フトウェアでは、ベースコール、アライメン DNA のロスも少なくわずか 50ng の DNA ネルでランを開始すると自動でデータ解析 ト、アプリケーションに応じた解析を行い からスタートできます。 まで行います。 ます。 * TruSeq サンプル調製キットの場合は断片化装置が必要 トランスポソーム ゲノムDNA です。 ～ 300bp タグメンテーション ～ 300bp P5 Index 1 Read 1 Sequencing Primer Read 2 Sequencing Primer Index 2 P7 PCR増幅 p5 Index1 Rd1 SP Rd2 SP Index2 シーケンス解析用ライブラリー p7 Nextera のワークフロー MiSeq Reporter の一例 Resequencing Small RNA de novo Assembly Amplicon 16S Metagenome QC Library 世界シェア No.1 の実績とテクノロジー これまで国内外の多くのプロジェクトで採用されてきたイルミナの 1 塩基合成反応（SBS:Sequence by Synthesis）はホモポリマー ■L社 3,865 5% ■R社 配列も高精度な読み取りが可能です。 6,000 以上の研究論文に貢 9,520 13% 献し、公的データベースにも圧倒的な登録数を誇るイルミナのテク ノロジーから、数多くの次世代シーケンサー手法が確立されました。 グラフ：国際データベースのデスクトップ型次世代シーケンサー データ登録数（2014 年 12 月現在 http://sra.dbcls.jp） ■ イルミナ MiSeq 61,083 82% 多彩なアプリケーションを迅速、高精度に解析 16S メタゲノム解析 96 サンプル同時ラン 20 株の大腸菌 de novo アセンブル FFPE 癌サンプルから KRAS 第 2 エクソンを解析 16S 超可変 V4 領域（254bp）を増幅 大腸菌 MG1665 を解析（150bp x2） 胃および直腸癌由来 FFPE サンプルか し、96 サンプルを 1 ラン（150bp x2） し、de novo アセンブル。コンティグ ら、KRAS 第２エクソンを増幅して解析 で解析。イヌ、イヌの飼主（ヒト）から 最 大 長 は 311Kb、N50 は 148Kb と （75bp x2）。直腸癌にて 27.5% の頻 のサンプルは、フリーソフトウェアパッ 良好な結果が得られました。ランあた 度で C から G へ塩基変異があること ケージの QIIME を使用して門レベル り 20 サンプルの解析が可能です。 がわかり、この変異は正常サンプルで の分類が行われました。 も 1.1% で観察されました。 リファレンスコール（総数の%） 100 90 発現の比率 （16S rRNA遺伝子配列の割合） 80 70 60 50 40 30 20 10 0 イヌ イヌの飼主（ヒト） 土壌 Crenarchaeota Nitrospirae Euryarchaeota OP3 AD3 Planctomycetes Acidobacteria Proteobacteria Actinobacteria SC3 Armatimonadetes SC4 BRC1 SM2F11 Bacteroidetes SPAM CCM11b SR1 Chlamydiae Spirochaetes Chlorobi Synergistetes Chloroflexi TM6 Cyanobacteria TM7 Elusimicrobia Tenericutes Firmicutes Thermi Fusobacteria Verrucomicrobia GAL15 WPS-2 Gemmatimonadetes WS3 Lentisphaerae 変異コール（総数の%） 100 80 60 40 変異 27.5% 20 変異 1.1% 0 NA18507 コントロール QIIME を用いた門レベルでの分類 大腸菌アセンブルの結果を Circos で表示 一足先をゆくクラウドソリューション クラウドサービスの BaseSpace はシーケンスデータの保管と解析アプリを 提供します。1TB まで無償で利用可能なため、 MiSeq データも約 200 ラン 分 * の保管が可能です。また、BaseSpace ではサードパーティが開発した 解析アプリを自由に組み合わせデータの解析と可視化を行え、共同研究者 とのデータ共有も安全かつ効率的に行うことができます。 * 150bp x2, PhiX サンプルのランの場合を想定しています。 直腸癌 直腸正常 3 サンプルにおける変異の割合 ブレイクスルーのパフォーマンスと価格 製品仕様 サイズ ： 幅 × 奥行き × 高さ：68.6cm × 52.3cm × 56.5cm、重量：54.5kg 所要電源 ： 100V AC、50/60Hz、10A、400W 内蔵コンピューター ： Windows 7 標準、750GB ハードドライブ、16GB RAM コンピューターの仕様は定期的に更新されます。最新の構成についてはお問い合わせください。 動作環境 ： 温度 22℃ ± 3℃、湿度 20-80%（結露なきこと） 、高度 2,000m 未満、汚染度評価 2 検出 ： 発光ダイオード 530nm、660nm パフォーマンス * MiSeq v2 試薬キット MiSeq v3 試薬キット リード長 リード数 データ量 36bp x1 150bp x2 250bp x2 75bp x2 300bp x2 1200 ∼ 1500 万 2400 ∼ 3000 万 2400 ∼ 3000 万 4400 ∼ 5000 万 4400 ∼ 5000 万 540 ∼ 610Mb 4.5 ∼ 5.1Gb 7.5 ∼ 8.5Gb 3.3 ∼ 3.8Gb 13.2 ∼ 15Gb DNA 増幅からシーケンス までの時間 ** ∼ 4 時間 ∼ 24 時間 ∼ 39 時間 ∼ 20 時間 ∼ 55 時間 Q30 以上の塩基 90％以上 80％以上 70％以上 85％以上 70％以上 * イルミナ PhiX ライブラリーを使用し、サポート内のパスフィルターのクラスター密度（MiSeq v2 試薬キットの場合は 467-583k/mm2、MiSeq v3 試薬キットの場合は 727-827k/mm2）で 実施します。実際の数値はサンプルに依存することがあります。 Q30 以上の塩基の割合は、そのラン全体の平均値です。 ** 調製済みライブラリーからシーケンスまでの合計時間です。 システム価格 カタログ番号 MS-J-001 SV-420-1002 製品名 希望販売価格（円） MiSeq システム（DNA 増幅、シーケンサー、データ解析コンピューター内蔵） MiSeq 年間保守契約 Basic 16,500,000 2,150,000 試薬消耗品価格 カタログ番号 製品名 シーケンスラン試薬キット（ランに必要なフローセル、試薬カートリッジ、ボトルを含みます） サンプルあたり 希望販売価格（円） 毒物 約 2500 万クラスター（3.75Gb） MiSeq Reagent Kit v3 (150 Cycles) 毒物 約 2500 万クラスター（15Gb） MiSeq Reagent Kit v3 (600 Cycles) 毒物 約 1500 万クラスター（750Mb） MiSeq Reagent Kit v2 (50 Cycles) 毒物 約 1500 万クラスター（4.5Gb） MiSeq Reagent Kit v2 (300 Cycles) 毒物 約 1500 万クラスター（7.5Gb） MiSeq Reagent Kit v2 (500 Cycles) 毒物 約 400 万クラスター（1.2Gb） MiSeq Reagent Micro Kit v2 (300 Cycle) 毒物 約 100 万クラスター（300Mb） MiSeq Reagent Nano Kit v2 (300 Cycle) 毒物 約 100 万クラスター（500Mb） MiSeq Reagent Nano Kit v2 (500 Cycle) サンプル調製キット（その他、Small RNA、RNA-Seq、ChIP-Seq キットもご用意しています） FC-121-1030 Nextera DNA Sample Prep Kit (24 Samples) 15,250 FC-121-1011 Nextera Index Kit (24 Indices, 96 Samples) 488 毒物 FC-131-1024 Nextera XT DNA Sample Prep Kit (24 Samples) 6,083 FC-131-1001 Nextera XT Index Kit (24 Indices, 96 Samples) 488 MS-102-3001 MS-102-3003 MS-102-2001 MS-102-2002 MS-102-2003 MS-103-1002 MS-103-1001 MS-103-1003 Nextera シリーズはそれぞれ対応する Index Kit とあわせてお使いください。 代理店 〒108-0014 東京都港区芝 5-36-7 三田ベルジュ 22 階 Tel (03) 4578-2800 Fax (03) 4578-2810 www.illuminakk.co.jp www.facebook.com/illuminakk 本製品の使用目的は研究に限定されます。 販売条件：www.illuminakk.co.jp/tc © 2015 Illumina, Inc. 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