トランスクリプトーム シーケンシング

Premier Scientific Partner
トランスクリプトーム
シーケンシング
トランスクリプトームシーケンシングは特定の状況下において細胞中のmRNAやmiRNA
の配列を解読し、発現量の定量、新規転写配列の発見ができます。
特長
高感度
高再現性
広い検出幅
高網羅性
サービス内容
ワークフロー
新規トランスクリプトームアセンブル
Unigene機能のアノテーション
UnigeneのGOアノテーション
Unigeneの発現差異の解析
タンパク質コード配列(CDS)の予測
GOアノテーション
発現経路の解析
トランスクリプトームのリシーケンシング
遺伝子発現差異の解析
遺伝子融合の検出
遺伝子構造の解明
選択的スプライシングの同定
新しい転写産物の予測
SNP解析
Total RNA
Enriched mRNA by
Oligo (dT)
(Eukaryote)
Remove rRNA
(Prokaryote)
Fragmentation
Non-coding RNA
Fragmentation
Random Hexamer
Primed
cDNA Synthesis
Add the Adaptor
Paired-end 91 Base
Pair Sequencing
Bioinformatics
Analysis
Figure 1 トランスクリプトーム解析のワークフロー
Premier Scientific Partner
バイオインフォマティクス解析
選択的スプライシングの同定
融合遺伝子の同定
SNP検出
受け入れサンプル
サンプル
DNase処理後のRNA、タンパク質の混入無し
植物
動物
サンプル量
ヒト、マウス その他
≥20μg
≥5μg
サンプル濃度 ≥400ng/μL
サンプル純度
原核生物
≥80ng/μL
≥10μg
≥10μg
≥200ng/μL
≥500ng/μL
OD260/280=1.8~2.2
OD260/280=1.8~2.2
OD260/230≥2.0
OD260/230≥2.0
28S:18S>1.0
23S:16S=1.2~2.2
RIN≥7.0
RIN≥6.0
※ライブラリー作製が困難と判断された場合がございますので、予備のサンプルを同
封していただくことをご推奨いたします。
注意事項
1. ご依頼の内容により、サンプルの必要量が異なりますので、お問合せください。
2. サンプルはなるべくドライアイスを同梱してご送付下さい。
3. 香港までの送料はお客様のご負担となります。また、輸送時のトラブルに関して、 弊社はその責任を負いかねます。
4. 土・日・祝日のサンプル受け入れは行っておりません。
5. 再度品質検査の結果によっては、再度サンプルのご提供をいただく場合がございます。
6. サンプルはライブラリー作製・納品後、破棄させていただきます。返送、保管についてはご相談下さい。
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