Niets is wat het lijkt. Dickeya en Pectobacterium in pootgoed Dickeya en Pectobacterium in pootgoed 1 Bacterieziek in pootgoed (2008 – 2013) ~2/3 2014: 1370 ha pootgoed aangemeld 2 De gezondheid van ingevoerd basispootgoed - voorjaar 2013 - 12.2% De gezondheid van ingevoerd basispootgoed - voorjaar 2013 Insleep bacterieziek varianten met ingevoerd basispootgoed 3 De gezondheid van prebasispootgoed voorjaar 2013 score Dickeya = Erwinia chrysanthemi 16S rDNA sequentie analyse (Samson et al., 2004) 4 Nieuwe Dickeya variant in aardappel (2006 - ) Dickeya solani sp. nov., a pectinolytic plant-pathogenic bacterium isolated from potato (Solanum tuberosum). Jan M. van der Wolf, Els H. Nijhuis, Malgorzata J. Kowalewska, Gerry S. Saddler, Neil Parkinson, John G. Elphinstone, Leighton Pritchard, Ian K. Toth, Ewa Lojkowska, Marta Potrykus , Malgorzata Waleron, Paul de Vos, Ilse Cleenwerck, Minna Pirhonen, Linda Garlant, Valérie Hélias, Joël F. Pothier, Valentin Pflüger, Brion Duffy, Leah Tsror and Shula Manulis No. 1448 of 2012 2013 5 De wereld van Dickeya in aardappel Europa, Israël Zuid-Amerika Zuid- & Oost-Afrika Australië Noord-Amerika D. dianthicola D. solani D. dadantii D. dadantii D. zeae D. chrysanthemi Bacterieziek in pootgoed (2008 – 2013): D.dianthicola of D. solani 6 Dickeya dianthicola Dickeya dianthicola 7 Dickeya dianthicola Dickeya dianthicola 8 Dickeya dianthicola Dickeya dianthicola 9 Dickeya dianthicola Dickeya solani 10 Dickeya solani Dickeya solani 11 Dickeya solani Dickeya solani 12 Pectobacterium 16S rDNA sequentie analyse (Samson et al., 2004) Pectobacterium atrosepticum 13 Pectobacterium atrosepticum Pectobacterium atrosepticum 14 Pectobacterium wasabiae Pectobacterium wasabiae 15 Pectobacterium wasabiae Pectobacterium wasabiae 16 Pectobacterium wasabiae Pectobacterium wasabiae 17 Pectobacterium wasabiae Pectobacterium wasabiae 18 Pectobacterium wasabiae Pectobacterium wasabiae 19 Pectobacterium wasabiae Pectobacterium carotovorum brasiliense 20 Pectobacterium carotovorum brasiliense Pectobacterium carotovorum brasiliense 21 Pectobacterium carotovorum brasiliense Pectobacterium carotovorum brasiliense 22 Pectobacterium carotovorum carotovorum Pectobacterium carotovorum carotovorum 23 Pectobacterium carotovorum carotovorum Pectobacterium carotovorum carotovorum 24 Pectobacterium carotovorum carotovorum Pectobacterium varianten in witloof Pcc 1802 Pat 1395 Pwas 1862 Pcb 1819 25 Colletotrichum coccodes Colletotrichum coccodes 26 Colletotrichum coccodes Colletotrichum coccodes 27 Colletotrichum coccodes & Dickeya dianthicola Colletotrichum coccodes & Dickeya dianthicola 28 Colletotrichum coccodes & Pectobacterium Geotrichum 29 Geotrichum Insleep van Dickeya & Pectobacterium 30 Dickeya & Pectobacterium in waterlopen in Europa • Dickeya zeae in VK, Finland, Spanje & Nederland • Dickeya solani in Schotland & Wales • nieuwe, onbenoemde Dickeya’s (ondermeer D. aquatica) Virulentie van Dickeya varianten: maceratie 64.2 37.0 Ddi Dsol Dda Dch Dzeae D. (kas) D. (water) 31 Dickeya virulentie: infectiviteit in witloofblaadjes D. sp. UDL Dch Dzeae Dda Dsol Ddi Beweging van Dickeya varianten 40.2 42.1 Gemiddelde diameter (mm) van de radiale bacteriële migratie van het centrum naar de rand van het swimming medium na 20 u 35.1 59.9 Gemiddelde diameter (mm) van de radiale bacteriële migratie van het centrum naar de rand van het swarming medium na 20 u 32 Dickeya varianten: hechting en aggregaatvorming D.dianthicola D.solani Dickeya virulentie: reactiviteit 33 Dickeya virulentie: reactiviteit Dickeya virulentie: reactiviteit Dsol D010 Ddi D042 34 Dickeya virulentie: reactiviteit Welke Dickeya varianten kunnen bacterieziek veroorzaken uit besmette poters? 35 Welke Dickeya varianten kunnen bacterieziek veroorzaken uit besmette poters? D030 A D030 B D030 C D110 A D110 B D110 C Pwas A Pwas B Pwas C Pcb A Pcb B Pcb C Pcc A Pcc B Pcc C D020 A D020 B D020 C Pat A Pat B Pat C D035 A D035 B D035C D051 A D051 B D051 C D034 A D034 B D034 C D010 A D010 B D010 C D022 A D022 B D022 C D091 A D091 B D091 C D001 A D001 B D001 C D009 A D009 B D009 C D042A D042B D042C D040 A D040 B D040 C D036 A D036 B D 036 C D109A D109B D109C D019 A D019 B D019 C D011 A D011 B D011 C D017A D017B D017C D111 A D111 B D111 C D093 A D093 B D093 C D038 A D038 B D038 C D112 A D112 B D112 C D113 A D113 B D113 C D094 A D094 B D094 C nb stems (A+B+C) 300 158.8 200 88.5 100 0 nb stems D011 D030 D042 D051 D001 D010 D035 D036 D110 D019 D040 D094 D009 D020 D017 D038 D034 D091 D093 D022 D109 D111 D112 D113 Pat Pwas Pcb 85 65 85 Pcc NOC 119 147 189 163 182 113 205 171 161 193 162 187 205 255 168 180 218 182 220 293 276 129 217 101 205 295 nb stems (C) 100 90 80 56.2 70 60 36.8 50 40 30 20 10 0 nb stems D011 D030 D042 D051 D001 D010 D035 D036 D110 D019 D040 D094 D009 D020 D017 D038 D034 D091 D093 D022 D109 D111 D112 D113 Pat Pwas Pcb 40 35 40 32 51 66 54 68 42 85 58 53 62 61 65 68 96 62 82 92 62 70 91 64 61 84 47 Pcc NOC 78 101 36 % blackleg stems (A+B+C) 100,0 90,0 63.7 45.0 80,0 70,0 60,0 50,0 40,0 30,0 20,0 10,0 0,0 D011 D030 D042 D051 D001 D010 D035 D036 D110 D019 D040 D094 D009 D020 D017 D038 D034 D091 D093 D022 D109 D111 D112 D113 Pat Pwas Pcb Pcc NOC % blackleg stems 60,0 81,5 63,5 49,6 44,9 53,4 50,3 32,4 43,4 14,6 57,3 47,8 35,2 37,0 23,0 18,5 36,9 29,8 28,3 25,7 54,9 42,7 13,0 5,4 56,6 43,3 67,3 49,8 1,0 % blackleg stems (C) 100,0 90,0 80,0 70,0 50.2 52.3 60,0 50,0 40,0 30,0 20,0 10,0 0,0 D011 D030 D042 D051 D001 D010 D035 D036 D110 D019 D040 D094 D009 D020 D017 D038 D034 D091 D093 D022 D109 D111 D112 D113 Pat Pwas Pcb Pcc NOC % blackleg stems 45,0 60,0 55,0 40,6 51,0 62,1 46,3 47,1 54,8 12,9 39,7 62,3 32,3 36,1 20,0 19,1 19,8 27,4 31,7 10,9 59,7 48,6 5,5 3,1 55,7 33,3 66,0 53,8 0 Identification of 123 Pectobacterium isolates from seed potatoes and 9 Pectobacterium isolates from diagnostic samples by taxon PCR P.atrosepticum (De Boer & Ward, 1994) P.c.carotovorum (Kang et al., 2003) P.wasabiae (De Boer et al., 2012) P.c.brasiliensis (Duarte et al., 2004) P.carotovorum (Darrasse et al., 1994) 37 Pcb_GBBC_1843 Pcb_GBBC_1889 Pcb_GBBC_1819 Pcb_GBBC_1812 Pcb_GBBC_1784 Pcb_GBBC_1775 Pcb_GBBC_1773 Pcb_GBBC_1772 Pcb_GBBC_1908 Pcb_GBBC_1768 Pcb_GBBC_1758 Pcc_LMG_2429 Pcc_LMG_2407 Pcb_GBBC_1756 Pcb_GBBC_428 Pcb_GBBC_1390 Pcb_GBBC_1392 Pcb_GBBC_1888 Pcc_LMG_2416 Pcb_CFBP_6617 Pcb_PBR1692 Pcc_PCC21 Pcc_LMG_2427 Pc_LMG_6670 Pc_GBBC_1848 Pc_GBBC_1399 Pc_GBBC_1885 Pc_GBBC_1757 Pc_GBBC_1890 Pc_GBBC_1939 Pc_GBBC_1887 Pco_LMG_6688 Pc_LMG_6471 Pco_LMG_13009 Pco_LMG_17566T Pcc_GBBC_1816 Pcc_IPO_163 Pc_GBBC_1790 Pcc_WPP14 Pcc_GBBC_1398 Pcc_LMG_2401 Pcc_GBBC_1381 Pcc_GBBC_1356 Pcc_IPO_139 Pcc_GBBC_1886 Pcc_LMG_2402 Pcc_GBBC_1879 Pcc_GBBC_1785 Pcc_LMG_2410 Pcc _GBBC_1790 Pcc_LMG_6689 Pcc_LMG_2430 Pcc_GBBC_1701 Pcc_GBBC_1802 Pcc_GBBC_1393 Biologische verschillen van P.carotovorum Maceratie 38 Biologische verschillen van P.carotovorum Hoeveel bacteriecellen nodig voor maceratie? Pcb Pc* Pcc Biologische verschillen van P.carotovorum Beweging en hechting PcbT Pcb1819 Pcb1390 39 Biologische verschillen van P.carotovorum Aggregatie in SOBG PcbT Pcb1819 Pcb1390 D.dianthicola D.solani Biologische verschillen van P.carotovorum. Betekenis? cdi 49 cdi 79 cdi 71 cdi 40 cdi 46 cdi 21 cdi 90 swim 80 swim 7 swim 80 swim 76 swim 22 swim 22 swim 100 swarm 22 swarm 10 swarm 59 swarm 19 swarm 38 swarm 38 swarm 100 b PEL b PEL b bp PEL 40 Biologische verschillen van P.carotovorum brasiliense : carbapenem Welke Pectobacterium varianten kunnen bacterieziek veroorzaken uit besmette poters? 41 Welke Pectobacterium varianten kunnen bacterieziek veroorzaken uit besmette poters? 42 Niets is wat het lijkt. Dickeya en Pectobacterium in pootgoed Twee bacteriesoorten: - veel varianten - nog meer variatie op het veld afhankelijk van weer en bodem en aardappelras Specifieke variant reguleren is zinloos: - bacterieziek symptomen - van eenzelfde variant niet even schadelijk Normen in keuringsreglement - voor Dickeya/Pectobacterium - zwartbenigheid + andere vormen van aantasting - eisen bacterieziek voor uitvoer 43
© Copyright 2024 ExpyDoc
