生物学 第7回 遺伝子DNAはATCG4文字で 書かれたタンパク質の設計図 和田 勝 DNAはATCGの4文字で、 先週の番組で見たように、細胞の核 は「図書館」に、染色体はそこに納め られている本にたとえることができま す。 この本は、ATCGのたった4文字で書 かれている本です。本のページをめ くって、必要な箇所を写し取ったもの が、前回のセントラルドグマでお話し たmRNAです。 DNAからタンパク質へ セントラルドグマ DNAは核から外 に出ないので、 DNAとタンパク合 成の間を取り持つ メッセンジャーが 必要だと予言され ました。これが mRNAです。 音楽と遺伝情報は似ている mRNAは音楽を収めたカセットテープ にたとえることができます。 カセットテープをカセットプレーヤーに かけると、テープの進行に伴って音が 再生され、音楽になります。 mRNAをリボソームにかけると、その 進行に伴ってコドンに合致するアミノ 酸が取り込まれてつなぎ合わされ、タ ンパク質になります。 音楽と遺伝情報は似ている DNAの遺伝の情報と音楽との間に共 通するものを感じ取った生物学者が います。 音楽の中の主題と変奏、繰り返し構造 などが、DNAの塩基の並び方と似て いるというのです。そこでACGTを楽譜 に直すことで音楽にしようと考えた人 がいます。 遺伝子音楽 1949年 東京農工大学 大学院獣医学研究科修了 獣医学博士 1952年 カリフォルニア大学 ロサンゼルス校研究員 1961年 理学博士 (北海道大学) City of Hope National Medical Center研究員 大野 乾(おおの すすむ、1928年2月1日 - 2000年1月13日) 遺伝子音楽 「音楽が音楽たる由縁は、主題が少 しずつ変化しならが繰り返されていく ところにありますが、同様に繰り返し を持つDNAも音楽に変換しえるわけ です」。 この大野 乾さんのアイデアに基づ きDNAの塩基配列を音楽にしたの が始まりです(1986)。電子音楽なら ぬ遺伝子音楽です。 遺伝子音楽 http://www.toshima.ne.jp/~edogiku/index.html 遺伝子音楽 以前あったGeneMusic.orgのトップペ ージには、 「すべての芸術的な創作活動は、ヒ トの脳から生まれる。もっとも基本的 なことは、情報の伝達とコミュニケー ションである。生命の情報はDNA、 RNA、タンパク質分子にある。音楽は 情報の一つの形であり、その流れや 伝達のルールは自然界の場合と似て いるに違いない。 遺伝子音楽 自然界のルールは、1)進化、2)共通 の祖先型、3)変異、4)自然選択であ る。これらのルールは音楽にもあては めることができる。」 遺伝子音楽 塩基のATCGを音符に変換するルー ルは以下の通りです。分子量の大き い順に低い音から(ただしレから)並 べています。 DNAと音楽 ここでは、広島大学両生類研究施設 の三浦郁夫さんと広島国泰寺高校 が行ったプロジェクト「オオサンショ ウウオのDNAの塩基配列を明らか にする」の一環として行われた、塩 基配列を音楽に変換した例を取り上 げます。 DNAと音楽 1.オオサンショウウオHoxA13遺伝子 作曲:三浦郁夫(広島大学大学院理学研究科両生類研究施設)と広 島国泰寺高校生物班,編曲・演奏:Trevayne Fernandez (Australian Music Examination Board) 2.ヒトのHoxA13遺伝子 作曲:三浦郁夫(広島大学大学院理学研究科両生類研究施設)と広 島国泰寺高校生物班,編曲・演奏:Trevayne Fernandez (Australian Music Examination Board) 3. ミトコンドリアのATPase8遺伝子 作曲:坪北紗綾香(エリザベト音楽大学大学院音楽研究科音楽教育 学専攻),演奏:松本愛(エリザベト音楽大学大学院音楽研究科宗教 音楽学(オルガン)専攻修了) HoxA13遺伝子の役割 この遺伝子は、ヒトの場合、「指」を 作るときにはたらく遺伝子です。番組 にも出てきましたね。 簡単に言うと遺伝子のスイッチを入 れる(「点灯」の状態にする)タンパク 質の遺伝子です。 詳しいことは、後でまたお話しま す。お楽しみに。 DNAと音楽 楽譜です。 ヒトHoxA13遺伝子DNA SQ Sequence 1167 BP; atgacagcct ccgtgctcct gacaacggcg gcggcctggt gctgcagcag cggctgcagc ccggcggctg cggcggcagg gccgccgcgg ccaaccagtg gccgcgtccg cctacagcag gccgcggctg ccgctgcagc ccggcgggcc cggcggcggc cagagctcgt cggggcccgc tgcgcccgca tgggcccgcc gccgccgccg ccgccttcgc ttcagctccc gcgctaagga caccaccatc agcccatgcc cccggcgagt cgcgccacga ctgcccaacg gctggaacgg ctctggaagt ccactctgcc agggggagaa agaagcgcgt tacgccacga ataaattcat ctctctgagc ggcaggtcac atcaacaaac tgaaaaccac ccacccccgc ggccgacgag ggcggcggct gggcaacttc ccgcaacctg cgcccccggg cgccgccgcc agaggcggcc ggcgctgccc ccccaacgcc ggacaagtac gttcgcgttc tggctacctg acccttgggt ccaaatgtac cgacgtggtc gccttatacc tactaaggac aatctggttc tagttaa tggatcgagc ctcaacaaga gccggggccg tcggtggcgg atggcgcacc gaggcgcccc gccgccgcgt aagcaatgca tatggctact atcaagtcgt atggataccg taccaccagg gatatgccag cttcccatgg tgccccaaag tcccatccct aaggtgcaat aaacggaggc cagaacagga ccaccgtcat acatggaagg ggggcggggg ccgcggccgc cggcgccctt cgtcggctgc cgtcctcggg gcccctgctc tcggcagcgg gcccccagcc ccggcccagc gctacgcagc tggtgccggg aaagctacca agcaggcgca cggatgccag taaaagaact ggatatcagc gggttaaaga gtttctctac ggcggcggcg cttcccccac ggctgcggcg ggcgccagga cgccgctgct aggtcccggc ggcagcggcg ctactacccg cccctcggcc tgccgaggag cgggccttac cctcgggggc gccctgggcg gcctccccac ctcctatagg tgaacgggaa cacgacgaat gaaaaaagtc 60 120 180 240 300 360 420 480 540 600 660 720 780 840 900 960 1020 1080 1140 1167 HoxA13タンパク質 10 MTASVLLHPR 70 PAAAAAGGNF 130 AAAAAAAAAA 190 CARMGPHPNA 250 HHHQPMPGYL 310 LWKSTLPDVV 370 LSERQVTIWF 20 WIEPTVMFLY 80 SVAAAAAAAA 140 AAASSSGGPG 200 IKSCAQPASA 260 DMPVVPGLGG 320 SHPSDASSYR 380 QNRRVKEKKV 30 DNGGGLVADE 90 AAAANQCRNL 150 PAGPAGAEAA 210 AAAAAFADKY 270 PGESRHEPLG 330 RGRKKRVPYT 390 INKLKTTS 40 LNKNMEGAAA 100 MAHPAPLAPG 160 KQCSPCSAAA 220 MDTAGPAAEE 280 LPMESYQPWA 340 KVQLKELERE 50 AAAAAAAAAA 110 AASAYSSAPG 170 QSSSGPAALP 230 FSSRAKEFAF 290 LPNGWNGQMY 350 YATNKFITKD 60 AGAGGGGFPH 120 EAPPSAAAAA 180 YGYFGSGYYP 240 YHQGYAAGPY 300 CPKEQAQPPH 360 KRRRISATTN アミノ酸が388個、つながったタンパク質で す。マゼンダの部分でDNAと結合します。 下線部がメロディー。 別の例で、 DNA sequence of mouse immunoglobulin gamma variable region of the heavy chain with an anti-4hydroxy-3-nitrophenylacetyl specificity. The music was published by Susumu Ohno & Marty Jabara in 1986. 演奏はYonatan Cohen For comparison, 次は同じくYonatan Cohenの演奏 による Alexander Scriabinの Etude op. 8 no. 1 in C sharp Major. http://nsm.uh.edu/~dgraur/music_dna.html 興味があれば、 以下のサイトを訪ねてください。 http://www.whozoo.org/mac/Music/S ources.htm http://www.nslijgenetics.org/dnamusic/ 前回ビデオで見たことは 前回のビデオでイメージが膨らんだと 思います。もう少し生物学的なコアの 部分を学んでいきましょう。 「mRNAをリボソームにかけると、 その進行に伴ってコドンに合致す るアミノ酸が取り込まれてつなぎ合 わされ、タンパク質になります。」 という部分です。 もう一度、大まかな復習 タンパク質とDNAは、まったく異なる 分子です。 タンパク質 DNA 20種類のアミノ酸 4種類のヌクレオ が、鎖状につなが チドが、鎖状につ ったもので、側鎖 ながったもので の並び方に意味 塩基(ATCG)の がある(形を通し 並び方に意味が て機能を決めてい ある る) もう一度、大まかな復習 タンパク質とDNAは、まったく異なる 分子です。 タンパク質 DNA 本当はもっと長いが、、 こっちが設計図 こっちが実働部隊 ヒトHoxA13遺伝子DNA SQ Sequence 1167 BP; atgacagcct ccgtgctcct gacaacggcg gcggcctggt gctgcagcag cggctgcagc ccggcggctg cggcggcagg gccgccgcgg ccaaccagtg gccgcgtccg cctacagcag gccgcggctg ccgctgcagc ccggcgggcc cggcggcggc cagagctcgt cggggcccgc tgcgcccgca tgggcccgcc gccgccgccg ccgccttcgc ttcagctccc gcgctaagga caccaccatc agcccatgcc cccggcgagt cgcgccacga ctgcccaacg gctggaacgg ctctggaagt ccactctgcc agggggagaa agaagcgcgt tacgccacga ataaattcat ctctctgagc ggcaggtcac atcaacaaac tgaaaaccac ccacccccgc ggccgacgag ggcggcggct gggcaacttc ccgcaacctg cgcccccggg cgccgccgcc agaggcggcc ggcgctgccc ccccaacgcc ggacaagtac gttcgcgttc tggctacctg acccttgggt ccaaatgtac cgacgtggtc gccttatacc tactaaggac aatctggttc tagttaa tggatcgagc ctcaacaaga gccggggccg tcggtggcgg atggcgcacc gaggcgcccc gccgccgcgt aagcaatgca tatggctact atcaagtcgt atggataccg taccaccagg gatatgccag cttcccatgg tgccccaaag tcccatccct aaggtgcaat aaacggaggc cagaacagga ccaccgtcat acatggaagg ggggcggggg ccgcggccgc cggcgccctt cgtcggctgc cgtcctcggg gcccctgctc tcggcagcgg gcccccagcc ccggcccagc gctacgcagc tggtgccggg aaagctacca agcaggcgca cggatgccag taaaagaact ggatatcagc gggttaaaga gtttctctac ggcggcggcg cttcccccac ggctgcggcg ggcgccagga cgccgctgct aggtcccggc ggcagcggcg ctactacccg cccctcggcc tgccgaggag cgggccttac cctcgggggc gccctgggcg gcctccccac ctcctatagg tgaacgggaa cacgacgaat gaaaaaagtc 60 120 180 240 300 360 420 480 540 600 660 720 780 840 900 960 1020 1080 1140 1167 HoxA13タンパク質 10 MTASVLLHPR 70 PAAAAAGGNF 130 AAAAAAAAAA 190 CARMGPHPNA 250 HHHQPMPGYL 310 LWKSTLPDVV 370 LSERQVTIWF 20 WIEPTVMFLY 80 SVAAAAAAAA 140 AAASSSGGPG 200 IKSCAQPASA 260 DMPVVPGLGG 320 SHPSDASSYR 380 QNRRVKEKKV 30 DNGGGLVADE 90 AAAANQCRNL 150 PAGPAGAEAA 210 AAAAAFADKY 270 PGESRHEPLG 330 RGRKKRVPYT 390 INKLKTTS 40 LNKNMEGAAA 100 MAHPAPLAPG 160 KQCSPCSAAA 220 MDTAGPAAEE 280 LPMESYQPWA 340 KVQLKELERE 50 AAAAAAAAAA 110 AASAYSSAPG 170 QSSSGPAALP 230 FSSRAKEFAF 290 LPNGWNGQMY 350 YATNKFITKD 60 AGAGGGGFPH 120 EAPPSAAAAA 180 YGYFGSGYYP 240 YHQGYAAGPY 300 CPKEQAQPPH 360 KRRRISATTN アミノ酸が388個、つながったタンパク質で す(一つのアルファベットが一つのアミノ酸 を表しています)。 DNAとタンパク質 つまり、DNA(の塩基の配列)はアミ ノ酸の並び方を決めている指令書(だ から遺伝子)なのです。 DNA 3つの塩基(コド ン)が1つのアミノ 鎖 タンパク質 指令書に従って 20種類のアミノ酸 の配列が決まる この間を取り持つものがRNA DNAからタンパク質へ 設計図(遺伝情報、DNA) 転写(transcription) 遺伝情報とタンパク質の仲立ちとなるRNA 翻訳(translation) タンパク質が構造と機能を実現 (セントラル・ドグマ) DNAからタンパク質へ セントラルドグマ DNAは核から外 に出ないので、 DNAとタンパク合 成の間を取り持つ のがメッセンジャ ーRNA(mRNA) です。 細胞の模式図 サイトゾール DNA リボソーム 核 mRNA 細胞膜 ゴルジ装置 粗面小胞体 原料のアミノ酸 DNAからタンパク質へ 1)DNAからmRNAへ この過程は、図書室で必要な本(染 色体)を広げ、必要な箇所(遺伝子) の塩基配列をmRNAへ書き写す(コ ピーする)過程です。 この過程を転写(transcription)と呼 びます。 DNAからタンパク質へ 2)mRNAからタンパク質へ この過程は、コピーしたテープ( mRNA)を、プレーヤー(リボソーム) にかける過程です。もとの塩基配列 に従ったタンパク質が生まれます。 この過程を翻訳(translation)と呼び ます。 ここでDNAとRNAの違い DNA 1)糖はデオキシ リボース RNA 1)糖はリボース 2)塩基はATCG 3)二本鎖 2)塩基はAUCG 3)一本鎖 細胞は3種類のRNAを使っています。1つ目は すでに出てきたmRNA、2つ目はリボソームの建 築材料であるrRNA、3つ目がアミノ酸の運び屋 tRNA 転写の過程 それでは、転写の過程をお話しまし ょう。 我々は、情報を書き写すためはコピ ー機を使ったり、鉛筆で筆写したりし ますが、核の中では、酵素タンパク 質がこの役目を果たします。 酵素の名前は、RNAポリメラーゼで す。 ここでもう一度DNAの構造 DNAは、デオキシリボースという 糖(Sugar)とリン酸(Phosphate)の 骨格から、塩基(Base)が突き出た 構造でしたね。それが2本、向かい あっています。 DNA分子を簡単に書くと 5’ PSPSPSPSPSPSPSPSPSPSPSPSPSPS 3’ A T C G A T C G A T C G A T T A G C T A G C T A G C T A 3’ SPSPSPSPSPSPSPSPSPSPSPSPSPSP 5’ この間が水素結合 転写の過程 (5') ATGGAATTCTCGCTC(3')(コード鎖、sense strand) (3') TACCTTAAGAGCGAG(5')(鋳型鎖、antisense strand) (5‘) AUGGAAUUCUCGCUC(3’)(転写された一本鎖RNA) RNAの鎖の伸長は必ず5’→3’の方 向(酵素の性質による) 転写の過程 転写の過程を示す動画を見てみましょ う。 RNAポリメラーゼ 転写は酵素であるRNAポリメラーゼ によって触媒 RNAポリメラーゼ RNAポリメラーゼは、DNAの二重ラ センをほどきながら、二本鎖のうち鋳 型となる鎖の塩基の配列を読んで、こ れと相補的な塩基をもったヌクレオチ ドを取り込み結合していきます。 RNAの鎖の伸長は必ず5’→3’の方 向 転写(頭だし)の過程 DNAの塩基配列にはアミノ酸配列を コードしている領域と、転写の調節に 関与する領域があります。 開始コドン(ATG)のすぐ上流には、プ ロモーターという領域があります。 真核生物では、プロモーター領域に TATAAAという配列が共通して存在し ます(開始コドン上流30塩基を中心)。 転写(頭だし)の過程 この領域をTATA boxとか ホグネス配列とか呼ぶ。 TATA boxに転写因子(タ ンパク質)が結合。 これを目印にRNAポリメ ラーゼ(やその他の転写 因子)が結合。 転写の方向 プロモーターはRNAポリメラーゼの着 地点であるとともに、この酵素がDNA 上を滑っていく方向も規定します。 したがって、二本鎖のうちのどちらが 鋳型鎖になるかは、プロモーターの配 置によって決まることになります。 翻訳の過程 それでは、翻訳の過程をお話しまし ょう。 すでにお話したように、翻訳とは mRNAをリボソームという塩基語→ アミノ酸語変換機にかけて、タンパク 質をつくる過程です。 材料であるアミノ酸はどのように調 達するのでしょうか。 材料の調達 アミノ酸をリボソームに運ぶ、運び屋 が必要です。 それがRNAの一つであるtRNA( transfer RNA、転移RNAとか運搬 RNA)です。 tRNAの構造 tRNAが塩基語とアミノ酸語のアダプタ ーとして機能するためには、コドン認 識部位とアミノ酸連結部位が必要。 クローバ型モデル tRNAの構造 特定のアミノ酸を3’に結合 一本鎖内に水素結合 アミノ酸に対応したアンチコドン tRNAの構造 実際の形は、下の図のようなL字型 をしていて、右端にアミノ酸を結合、 下端にアンチコドンがあります。 tRNAの構造 3‘末端は CCAで、A にアミノ 酸が結合 アンチコド ン部は規 則的な3 段構造。 tRNAにアミノ酸を付加 アミノアシ ルtRNA 合成酵素 が、特定 のアミノ 酸を対応 するtRNA に付加し て、サイト ゾール中 に用意し ておく リボソームの構造 翻訳の場であるリボソーム リボソームはRNAの一つである rRNA(ribosomal RNA、リボソーム RNA)とタンパク質の複合体です。 細胞のなかで働いている、マイクロ マシーンの一つといえるでしょう。 リボソームの構造 リボソーム形成には、、、 1)核小体 で転写さ れた rRNA 3)タンパ ク質とr RNAが一 緒になっ て 2)サイト ゾールで 合成され たタンパ ク質が核 へ リボソームの模式図 翻訳の過程 翻訳の過程を示す動画を見てみましょ う。 翻訳の開始 mRNA + リボソーム小顆粒 リボソーム大顆粒 メチオニンtRNA (P部位に座る) 隣席のA部位に対応するアミノアシル tRNAが座り、翻訳開始 翻訳の開始 ペプチド鎖の伸長 翻訳の終了 翻訳の終了 mRNA・リボソーム複合体 リボソーム大顆粒 リボソーム小顆粒 大小顆粒はリサイクルされる 完成したタンパク質 サイトゾール DNA リボソーム 核 mRNA 細胞膜 ゴルジ装置 粗面小胞体 原料のアミノ酸 二つの合成経路 サイトゾールでは リボソーム がmRNAで つながって いる。左の 方のリボ ソームから はペプチド 鎖が延びて いるのが見 える。 粗面小胞体では バーは 50μm 分泌性タンパク質の合成 先頭にシグナルペプチドが付加している。 膜タンパク質の場合も同じ。 細胞内のソーティング リボソーム →サイトゾール →粗面小胞体 →顆粒 →細胞膜 核 ミトコンドリア 葉緑体 ペルオキシゾーム 細胞内のソーティング リボソーム →サイトゾール →粗面小胞体 →顆粒 →細胞膜 核 ミトコンドリア 葉緑体 ペルオキシゾーム 分泌タンパク質の一次構造 翻訳直後の、卵白リゾチームの一次 構造は次のとおり 1 16 31 46 61 76 91 106 121 136 1 Met Ala Lys Trp Thr Ile Arg Ile Asn Thr 2 Arg Leu Arg Val Asn Asn Asn Thr Gly Asp 3 Ser Gly His Cys Arg Ser Leu Ala Met Val 4 Leu Lys Gly Ala Asn Arg Cys Ser Asn Gln 5 Leu Val Leu Ala Thr Trp Asn Val Ala Ala 6 Ile Phe Asp Lys Asp Trp Ile Asn Trp Trp 7 Leu Gly Asn Phe Gly Cys Pro Cys Val Ile 8 9 10 11 12 13 14 15 Val Leu Cys Phe Leu Pro Leu Ala 15 Arg Cys Glu Leu Ala Ala Ala Met 30 Tyr Arg Gly Tyr Ser Leu Gly Asn 45 Glu Ser Asn Phe Asn Thr Gln Ala 60 Ser Thr Asp Tyr Gly Ile Leu Gln 75 Asn Asp Gly Arg Thr Pro Gly Ser 90 Cys Ser Ala Leu Leu Ser Ser Asp 105 Ala Lys Lys Ile Val Ser Asp Gly 120 Ala Trp Arg Asn Arg Cys Lys Gly 135 Arg Gly Cys Arg Leu マゼンダ色がシグナルペプチド 卵白リゾチーム 1 16 31 46 61 76 91 106 121 1 Lys Gly Ala Asn Arg Cys Ser Asn Gln 2 Val Leu Ala Thr Trp Asn Val Ala Ala 3 Phe Asp Lys Asp Trp Ile Asn Trp Trp 4 Gly Asn Phe Gly Cys Pro Cys Val Ile 5 Arg Tyr Glu Ser Asn Cys Ala Ala Arg 6 Cys Arg Ser Thr Asp Ser Lys Trp Gly 7 Glu Gly Asn Asp Gly Ala Lys Arg Cys 8 Leu Tyr Phe Tyr Arg Leu Ile Asn Arg 9 Ala Ser Asn Gly Thr Leu Val Arg Leu 10 11 12 Ala Ala Met Leu Gly Asn Thr Gln Ala Ile Leu Gln Pro Gly Ser Ser Ser Asp Ser Asp Gly Cys Lys Gly 13 Lys Trp Thr Ile Arg Ile Asn Thr 14 15 Arg His 15 Val Cys 30 Asn Arg 45 Asn Ser 60 Asn Leu 75 Thr Ala 90 Gly Met 105 Asp Val 120 リゾチーム(lysozyme)は、細菌の細胞 壁を構成するN-アセチルムラミン酸と N-アセチルグルコサミン間の結合を切 断する。 リゾチームの比較 eggwhite human 1 11 21 31 41 MRSLLILVLC FLPLAALGKV FGRCELAAAM KRHGLDNYRG YSLGNWVCAA MKALIVLGLV LLSVTVQGKV FERCELARTL KRLGMDGYRG ISLANWMCLA eggwhite Human 51 61 71 81 91 KFESNFNTQA TNRN-TDGST DYGILQINSR WWCNDGRTPG SRNLCNIPCS KWESGYNTRA TNYNAGDRST DYGIFQINSR YWCNDGKTPG AVNACHLSCS eggwhite human 101 111 121 131 141 ALLSSDITAS VNCAKKIVSD GNGMNAWVAW RNRCKGTDVQ AWIRGCRL ALLQDNIADA VACAKRVVRD PQGIRAWVAW RNRCQNRDVR QYVQGCGV □部分はシグナル、赤字のアミノ酸が異なる 活性部位:E:グルタミン酸、D:アスパラギン酸 SS結合:24-145(146), 48-133(134), 82(83)-98(99), 94(95)-112(113) ヒトリゾチーム 1 1 Lys 16 Gly 31 Leu 46 Asn 61 Ser 76 Ala 91 Asp 106 Ile 121 Val 2 Val Met Ala Ala Arg Cys Ala Arg Arg 3 Phe Asp Lys Gly Tyr His Val Ala Gln 4 Glu Gly Trp Asp Trp Leu Ala Trp Tyr 5 Arg Tyr Glu Arg Cys Ser Cys Val Val 6 Cys Arg Ser Ser Asn Cys Ala Ala Gln 7 Glu Gly Gly Thr Asp Ser Lys Trp Gly 8 Leu Ile Tyr Asp Gly Ala Arg Arg Cys 9 Ala Ser Asn Tyr Lys Leu Val Asn Gly 10 11 12 Arg Thr Leu Leu Ala Asn Thr Arg Ala Gly Ile Phe Thr Pro Gly Leu Gln Asp Val Arg Asp Arg Cys Gln Val 13 Lys Trp Thr Gln Ala Asn Pro Asn 14 15 Arg Leu 15 Met Cys 30 Asn Tyr 45 Ile Asn 60 Val Asn 75 Ile Ala 90 Gln Gly 105 Arg Asp 120 ヒトでは、涙のなかに含まれていて殺 菌に寄与する。他に免疫にも関与する ヒトリゾチーム 黄色い棒 がSS結合 ヒトリゾチーム 活性部位: E:グルタミ ン酸とD:ア スパラギン 酸が向かい 合う位置関 係になりま す。鋏の上 の刃と下の 刃になるの です。 ヒトリゾチーム 1 1 Lys 16 Gly 31 Leu 46 Asn 61 Ser 76 Ala 91 Asp 106 Ile 121 Val 2 Val Met Ala Ala Arg Cys Ala Arg Arg 3 Phe Asp Lys Gly Tyr His Val Ala Gln 4 Glu Gly Trp Asp Trp Leu Ala Trp Tyr 5 Arg Tyr Glu Arg Cys Ser Cys Val Val 6 Cys Arg Ser Ser Asn Cys Ala Ala Gln 7 Glu Gly Gly Thr Asp Ser Lys Trp Gly 8 Leu Ile Tyr Asp Gly Ala Arg Arg Cys 9 Ala Ser Asn Tyr Lys Leu Val Asn Gly 10 11 12 Arg Thr Leu Leu Ala Asn Thr Arg Ala Gly Ile Phe Thr Pro Gly Leu Gln Asp Val Arg Asp Arg Cys Gln Val 13 Lys Trp Thr Gln Ala Asn Pro Asn 14 15 Arg Leu Met Cys Asn Tyr Ile Asn Val Asn Ile Ala Gln Gly Arg Asp 15 30 45 60 75 90 105 120 SS結合が4本あって、三次構造に寄与 している。SS結合というのは、2つのシ ステインの側鎖-CH2SHのSHが、 ーS-S-という形になること。 膜タンパク質 糖鎖 タンパク質 脂質の二重膜(lipid bilayer)である。 細胞内のソーティング リボソーム →サイトゾール →粗面小胞体 →顆粒 →細胞膜 核 ミトコンドリア 葉緑体 ペルオキシゾーム 膜タンパク質の場合 膜タンパク質の場合 タンパク質の形が重要 タンパク質の立体構造がいかに大切か ということが、よくわかりますよね。 熱を加えたり、pHが偏ったりすると、こ の形が崩れて、酵素としての働きが失 われてしまいます。 酵素に活性を表すための、最適温度や 最適pHが存在するのはこのためです。 きょうはちょっと難しかった? かもしれませんが、皆が知りたいと思っ ている突然変異や生物の形作りを知る ためには、避けて通れないところなので 、ついてきてくださいね。 次回は、細胞が数を増やす、について 話しましょう。お楽しみに。
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