Real Time PCR

Real Time PCR
Ver.2.00
TaqManプローブ法
Taq Man プローブの構造
Taq Man プローブが単独であるとき、レポーター色素の
励起光を照射するとレポーターが蛍光を発しますが、レ
ポーター色素の蛍光波長がクエンチャー色素の励起波
長に近似しているため(約500~600nm)レポーターの
蛍光エネルギーはクエンチャーの励起エネルギーとして
使用され、クエンチャーが蛍光を発します。このためTaq
Man プローブが単独であるときには、レポーターの蛍光
が抑制されます。
励起光
R
Q
蛍光共鳴エネルギー移動現象
FRET(Fluorescence Resonance Energy Transfer)とは・・・.
D+ 励起状態
D+
A+
熱蛍
な光
ど、
光
励
起
D
基底状態
光
励
起
FRET
A
D
励起された蛍光団 (Donor : D+) は,そのエネルギーを蛍光や熱エネル
ギーとして放出しようとする.
特定の条件を満たす分子 (Acceptor : A) が存在すると,共鳴による励起エネ
ルギーの移動 (FRET) が起こる.この時,エネルギーを失った Donor は基底
状態にもどり,同時にエネルギーを受け取った Acceptor は励起状態となる.
D を励起し,FRET が起こると,励起状態の A を得ることができる.例えば
蛍光物質である場合,D を励起すると,(FRETが起こり)A が励起されるた
め,A からの蛍光を得ることが可能である.
光
励
起
95℃
R
Forward Primer
5´
5´
Q
3´
3´
5´
5´
3´
5´
Reverse Primer
95℃
Forward Primer
5´
励起光
3´
R
5´
70℃
Q
3´
5´
5´
3´
5´
Taq ManプローブはPrimerよりも先にハイブ
リダイゼーションする(68~70℃付近)
Reverse Primer
70℃
励起光
Forward Primer
5´
3´
5´
R
Q
3´
60℃
5´
3´
5´
5´
Reverse Primer
Taq Manプローブの次にPrimerがハイブリダ
イゼーションする(58~60℃付近)
60℃
励起光
Forward Primer
Q
R
5´
3´
5´
3´
5´
5´
Reverse Primer
PrimerにDNAポリメラーゼが結合して伸長
反応が進む。
励起光
Forward Primer
60℃
R
Q
5´
3´
5´
3´
5´
5´
Reverse Primer
DNAポリメラーゼの伸長方向にDNAがあると、
5´-3´エキソヌクレアーゼ活性により分解され
る。
励起光
R
60℃
Q
5´
3´
3´
5´
5´
3´
3´
5´
Taq Manプローブが分解されるとレポーターと
クエンチャーが離れ、レポーター色素の蛍光が
検出できる。
Taq Manプローブの利点
プローブが分解されることにより生じる蛍光を検出
するので、目的DNAの増幅を正確に反映する。
( SYBR Greenを使用するときには気をつけなくて
はいけない、Primerダイマーなどの非特異的反応
は検出されない。)
Taq Manプローブの欠点
Primerとアニール温度が異なるようにプローブの設計
に注意しなくてはいけない(難しい)点がある。( SYBR
Greenを使用するときはPrimerを用意するだけです
む。)プローブが高価である。
参考文献
羊土社 ここまでできるPCR最新活用マニュアル、Applied Biosystems Japan資料、
タカラバイオ株式会社 http://www.takara-bio.co.jp/index.htm