MedR】第1回

東京大学医学系研究科
特任助教 倉橋一成
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「おしゃれStatistics(仮)」開催中
◦ 月1予定、次回は医学部研究棟でやるかも
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統計学の基礎なのでMedRに内容をフィードバック
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1.1. ソークワクチンのフィールドワーク
◦ ポリオに対するソークワクチンの効果を確かめたい
◦ National Foundation for Infantile Paralysisが行った研究の問題点
 学年、同意
◦ 二重盲見ランダム化試験
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ランダム化試験→効果に否定的
症例報告、非ランダム化試験→効果に肯定的
◦ 患者状態によって交絡が起きている
◦ 適格基準の重要性
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ランダム化試験→効果に否定的
既存対照→効果に肯定的
◦ 5-FU:消化器系のがんの治療薬
 実際治療に使われているけどどうなんだろ??
◦ BCG:メラノーマ(悪性黒色腫)の治療薬
◦ DES(ジエチルスチルベストール):流産防止剤(現在は非使用)
 副作用:膣腺ガンや子宮形成不全などの女性器障害が発生
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対照群が居るのか?
対照群は同時期か?
対照群は制御されているか?(次回、2章)
対照群はランダム化されているか?
エビデンス強い⇔エビデンス低い
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Seven useful designs. Steven A. Julious. 2011.
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/pst.485/abstract
1.
2.
2:1割り付け
繰り返しクロスオーバー
 AB/BA→ABBA/BAAB
3.
4.
3:1:1:3割り付け
相対効力?(relative potency)
 共分散分析のことかな
5.
6.
7.
要因試験
クラスターランダム化
重要な試験を3つ行う
 αエラーを緩くする
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2章:グラフィカル表示を用いたデータ解析
◦ Ufmelanoma
 悪性黒色腫による白人男性の死亡率
◦ CHFLS
 中国人の健康および家族生活の調査
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適切に選択されたグラフほど強力な
統計的道具はない
Chambers et al. 1983
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Ocean = yes
Ocean = no
※内陸部27地域中26地域しか示せていない Blue: mortality < 128
Green: mortality < 147
アルファベット文字で表現しているため&
Yellow: mortality < 178
少しエラー(現段階では原因不明)
Red: 178 <= mortality
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ヒトは、本当にそこに存在する微妙なパターンを
識別することが得意であるが、それらがまったく
存在しないときにそれらを想像するのも同様に
得意である。
-Carl Sagan Contact
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円周率 3. 1415926535 8979323846 2643383279 5028841971 6939937510
5820974944 5923078164 0628620899 8628034825 3421170679
(1000桁)
8214808651 3282306647 0938446095 5058223172 5359408128
4811174502 8410270193 8521105559 6446229489 5493038196
4428810975 6659334461 2847564823 3786783165 2712019091
4564856692 3460348610 4543266482 1339360726 0249141273
7245870066 0631558817 4881520920 9628292540 9171536436
7892590360 0113305305 4882046652 1384146951 9415116094
3305727036 5759591953 0921861173 8193261179 3105118548
0744623799 6274956735 1885752724 8912279381 8301194912
9833673362 4406566430 8602139494 6395224737 1907021798
6094370277 0539217176 2931767523 8467481846 7669405132
0005681271 4526356082 7785771342 7577896091 7363717872
1468440901 2249534301 4654958537 1050792279 6892589235
4201995611 2129021960 8640344181 5981362977 4771309960
11:14回
5187072113 4999999837 2978049951 0597317328 1609631859
224:2回
5024459455 3469083026 4252230825 3344685035 2619311881
7101000313 7838752886 5875332083 8142061717 7669147303
5982534904 2875546873 1159562863 8823537875 9375195778
1857780532 1712268066 1300192787 6611195909 2164201989
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アスファルトに落ちた雨の跡はどっち?(遮蔽物等は無いとする)
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ヒストグラム
◦ カーネル密度
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棒グラフ
箱ひげ図(←箱プロット)
散布図
モザイクプロット(←スピノプロット)
格子プロット(trellis plot)
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#------2変量線形回帰
LmMortality <- lm(mortality ~ latitude + ocean, data = USmelanoma)
summary(LmMortality)
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Mortality = 360 – 5.5 * 緯度 + 20.4 * ocean(yes)
Adjusted R-square: 0.7596
◦ R2乗(決定係数)→0~1の範囲、1に近いほど良く説明できている
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P値
◦ 緯度: <0.0001 (1.03e-13)
◦ Ocean(yes): 0.000109
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R+graphviz
参考:http://d.hatena.ne.jp/yokkuns/20110504/1304475910
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