理研 RSC 研修 「SPring-8 ではじめるタンパク質結晶構造解析」 プログラム

理研 RSC 研修 「SPring-8 ではじめるタンパク質結晶構造解析」 プログラム
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* 内容は諸事情により若干変更されることがあります。
2015年4月14日 更新
(火)
講義
講習
実習
見学
集 合 ・ 受 付
12:30~
13:00
1.1 X線構造解析の概要とSPring-8での測定
13:35
1.2 タンパク質の立体構造の安定性
14:10
1.3 タンパク質の結晶化ツール
14:45
15:20
1.4 膜タンパク質の調製と結晶化
15:30
上記の講義は各35分で、そのうちの最後
の5分間が質疑応答にあてられます。
休 憩
1.5 タンパク質の結晶化法
1.5.1 結晶化方法の紹介
1.5.2 結晶化 一次スクリーニング
1.5.3 ゼオライトによるタンパク質
結晶化の促進
1.5.4 結晶化に役立つタンパク質
性状分析機器 (動的光散
乱、熱分析、質量分析、N 末端分析、電気泳動など)
1.6 結晶化一次スクリーニング
1.6.1 タンパク質結晶化(操作の練習)
1.6.2 シッティングドロップ蒸気拡散法に
よる結晶化 一次スクリーニング
1.6.3 結晶化ドロップの観察
18:00
終了
各自で夕食の後、19:00~20:30 まで交流会
(水)
講義
講習
9:00
実習
見学
2.1 結晶の観察
2.1.1 結晶化ドロップの観察
10:00
2.2 結晶化二次スクリーニング
2.3 結晶化二次スクリーニング
2.3.1 結晶化条件の最適化
12:00
13:00
昼 食
2.3 (午前の続き)
2.3.2 添加剤のスクリーニング
14:00
2.3.3 ゼオライトを用いたスクリーニング
15:00
15:15
17:15
終了
休 憩
2.5 結晶の取扱い
2.5.1 SPACE system による結晶の
マウント
2.5.2 タンパク質結晶と塩結晶の違い
2.5.3 セレノメチオニン結晶
2.5.4 D-Cha
2.4 結晶化ロボット
(Phoenix, Mosquito)
(木)
講義
講習
実習
見学
9:00
3.1 SACLA 及び SPring-8 の一般
見学
10:00
3.2 ビームライン(BL26B1)への
結晶搬送
3.3 ビームラインでの実験見学
3.3.1 ビームラインの説明
3.3.2 ビームラインでの結晶の
マウント
3.3.3 タンパク質と塩による
回折点の違い
3.3.4 MOSFLM を用いた回折
イメージの評価
3.3.5 XAFS 測定
12:00
13:00
昼食
昼 食
1.5 タンパク質の結晶構造決定
13:35
3.5 回折データ処理
3.5.1 CCP4iの使い方
3.5.2 iMOSFLM/Pointless/Aimlessを
用いた回折データ処理
3.5.3 その他ソフトウェア
15:00
15:15
休 憩
3.6 構造解析(分子置換法)
3.6.1 Phaser
16:00
17:15
(金)
3.7 構造の修正と精密化
3.7.1 REFMAC
3.7.2 COOT
3.7.3 構造精密化
終了
講義
9:00
11:00
11:15:
12:00
12:15
講習
実習
3.7.4 リガンドのモデリング
4.2 α ヘリックスとβ シート(リボン図)
4.3 リガンド結合サイト(距離測定)
休 憩
総合討論:
・ ビームタイムの申請
・ 放射線業務従事者登録など
修了証書授与、集合写真撮影
解散
見学
4.1 セレノメチオニン多波長異常分散
法による自動構造決定のデモ
(講習と並行して自動運転)