Single Cell GenomiPhi Flyer

Imagination at work
illustraシリーズに新しい仲間登場
1細胞の全ゲノムDNAをわずか3時間*1で増幅!
Single Cell GenomiPhi
DNA増幅試薬
● Phi29 DNA ポリメラーゼを利用し、1 ∼ 1,000 細胞
のゲノム DNA 増幅に至適化
● 1 fg の DNA からも増幅可能
● 増幅 DNA の収量は 4 ∼ 5 µg * 2
*1 バクテリアの場合はプロトコールおよび反応時間が異なります
*2 5個のJurkat 細胞を用いて増幅反応を行った場合の収量です
※
増幅産物は、
PCR、STR解析、CGH(Comparative genomic hybridization)解析、
次世代シークエンシングなど、さまざまなアプリケーションで使用可能
Whole exome sequencing
Whole exome sequencing
The percentage of sequencing data matching the human
The
percentage
of sequencing
dataamplified
matchingusing
the human
genome
from human
cell samples
Single
genome
from
human
cell
samples
amplified
using
Cell GenomiPhi DNA Amplification Kit is equivalent Single
to the
Cell
GenomiPhi
DNA Amplification
Kit is equivalent
to the
percentage
produced
from unamplified
gDNA control
percentage
produced
from
unamplified
gDNA
control
samples (Fig 9). This indicates that no contaminants are
samples
(Figand
9). This
indicates
thatthe
noworkflow.
contaminants are
introduced
amplified
during
introduced
and
amplified
during
the
workflow.
を増幅
微量のサンプルから、速くかつ均一にゲノムDNA
12000
ヒ
ト培養細胞(5個)
Cells
ヒ
ト培養細胞(5個)
Cells
10000
Cells
ヒ
ト培養細胞(5個)
精製済みヒ
トgDNA(30 pg)
30 pg
8000
RFU
Percent
of data
matching
thethe
whole
genome
Percent
of data
matching
whole
genome
Real-time amplification kinetics of human cell samples
14000
30 pg
精製済みヒ
トgDNA(30 pg)
6000
No
NTCTemplate Control
(DNAを添加しないコントロール)
4000
2000
0
0
50
100
150
Time (min)
200
250
5個のヒト培養細胞の増幅カイネティクス
本キットを用いて、
ヒト培養細胞 5 個、精製済みヒトgDNA 30 pg(細胞約 5 個
に相当)、DNAを添加しないコントロールのDNA 増幅反応を行いました。サン
プルにSYBR Green Iを添加し蛍光プレートリーダーで増幅の過程を、継時的
にモニターしました。
ヒト培養細胞 5 個と精製済みヒトgDNA 30 pgの増幅カイネティクスは、非常
に類似していることがわかります。
本キットでは、至適化された細胞溶解条件を採用しているので、細胞の完全
な溶解と、gDNAの均一な変性が促進され精製済みgDNAを出発材料とした
場合と同様の結果を得ることができます。
www.gelifesciences.co.jp
Percent of data matching the whole genome
Percent of data matching the whole genome
Concl
Conclu
Single C
Single Cell
GenomiPhi
Single
Cell
(replicate 1)
GenomiPhi
(replicate 1)
Single Cell
GenomiPhi
Single
Cell
(replicate 2)
GenomiPhi
(replicate 2)
Unamplified Unamplified
control
control
Unamplified
Unamplified
(replicate
control 1) (replicate
control 2)
(replicate 1) (replicate 2)
percentage of on-target exome sequence coverage, as
shown in Figure 10.
shown
in Figure 10.
*
ョンのclean-up stepを行うことをおすすめします。
3 必要に応じてオプシ
取扱店
100
100
80
80
60
60
40
40
20
20
0
0
Fig 10. gD
Fig
gDN
in a10.
high
p
in
a high p
sequencin
sequencin
Fig 9. Greater than 98% of gDNA amplified from human cell samples using
増幅産物の全エクソームシークエンシング
Fig
9. Greater
than 98%
of gDNA
amplified
human cell
samples
using
Single
Cell GenomiPhi
DNA
Amplification
Kitfrom
matches
human
genome.
本キッ
トを用いて
ト培養細胞から増幅した
と、精製済みヒ
トgDNA
5個のヒ
gDNAthe
Single
GenomiPhi
DNA Amplification
Kit matches the human genome.
This isCell
equivalent
to unamplified
control samples.
(非増幅コントロール)の全エクソームシークエンシングを行いヒトゲノムのタン
This is equivalent to unamplified control samples.
パク質コーディング領域を調べました。
いずれも、
ヒトゲノムの配列データと98%以上一致しています。本キットで増幅
Single Cell
GenomiPhi amplified gDNA produces a high
は、
非増幅コントロールと同等の結果を示しており、
した
gDNA
Single
Cell
GenomiPhi
amplified
gDNA produces a増幅の過程で
high
percentage
of ョンが生じていない
on-target
exome
*3 sequence coverage, as
ことがわかります。
DNAコンタミネーシ
RFU = Relative Fluorescence Units
※ この増幅反応では、4∼5 µgのgDNAが得られました。
100
100
80
80
60
60
40
40
20
20
0
0
% of
bases
withwith
> 10×
coverage
%target
of target
bases
> 10×
coverage
● 3 時間* 1 で増幅が完了
Single
Ce
and rob
and
robu
sensitive
sensitive
which is
which
is
effective
effective
coverag
coverag
DNA wa
DNA
wa
Generat
Generat
Order
Order
Product
Product
illustra Si
illustra
Sin
25 reac
25 reac
illustra Si
illustra
Sin
100 rea
100 rea
コンポーネント
Colour of cap
Code No.
25 reactions
100 reactions
29-1081-07
29-1080-39
1 × 100 µl
1 × 200 µl
-20℃
-20℃
保存温度
Lysis Buffer
Black
Neutralization Buffer
White
1 × 100 µl
1 × 200 µl
Blue
1 × 25 µl
1 × 100 µl
-20℃
Green
1 × 275 µl
1 × 1.1 ml
-20℃
Red
1 × 100 µl
1 × 100 µl
-20℃
Yellow
1 × 25 µl
1 × 100 µl
-70℃
Amplification Mix
Reaction Buffer
DTT
Enzyme Mix
※ 保存温度:Enzyme Mixは-70℃で、他のコンポーネントは-20℃で保存してください
プロトコールの流れ
Cell sample
in PBS
Lysis Buffer
Neutralization
Bufferを添加
を添加
Reaction
Master Mixを添加
65°Cで
10分間
増幅された
全ゲノムDNA
30°Cで2時間
インキュベート
(バクテリアの場合は4時間)
インキュベート
■ご注文情報
製品名
Single Cell GenomiPhi 25rxn kit NEW
Single Cell GenomiPhi 100rxn kit NEW
包装
コード番号
25 反応
100 反応
29-1081-07
29-1080-39
価格(円)
59,600
214,400
■関連製品
製品名
illustra GenomiPhi V2 Kit, 100rxns
illustra GenomiPhi V2 Kit, 500rxns
illustra Ready-To-Go GenomiPhi V3 DNA Amplification Kit, 24rxns
illustra GenomiPhi HY Kit, 100rxns
illustra GenomiPhi HY Kit, 1000rxns
illustra Ready-To-Go GenomiPhi HY DNA Amplification Kit, 24rxns
包装
コード番号
価格(円)
100 反応
500 反応
24 反応
100 反応
1,000 反応
24 反応
25-6600-31
25-6600-32
25-6601-24
25-6600-20
25-6600-25
25-6603-24
67,600
297,000
33,000
245,000
2,300,000
104,000
ゲノムDNA増幅についてのさらに詳しい情報はこちら
▲▲▲
www.gelifesciences.co.jp/genomic_amp
www.gelifesciences.co.jp
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おりません)
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8
71-3712-23