Bioinformatique et Analyses Mutationnelles

Module M2 BAM : “Bioinformatique et Analyses Mutationnelles” Responsables du module :Christophe Béroud [email protected]
Martin Krahn [email protected]
Année Universitaire 2014-2015
Jour 1, lundi 17 Novembre 2014 : "Identification"
Matinée
09h00-10h30
Mutations : Microlésions du génome - Nomenclature - Martin Krahn
10h45-12h15
Mutations : Macrolésions du génome - Nomenclature - Arnaud Blanchard
Après-midi
14h00-15h30
Technologies de criblage à Haut Débit (HTS) – Arnaud Blanchard et Martin Krahn
15h45-17h15
Atelier : Nomenclature et Alignement de séquences - Arnaud Blanchard, Gwenaëlle
Collod-Béroud et Martin Krahn
Jour 2, mardi 18 Novembre 2014 : "Interprétation"
Matinée
09h00-12h15
Bases de données de séquences nucléiques - Gwenaëlle Collod-Béroud
Après-midi
14h00-15h30
Bases de données protéiques - Pierre Cau et Andrée Robaglia
15h45-17h15
Atelier : Bases de données - Pierre Cau, Gwenaëlle Collod-Béroud, Elise Kaspi, Andrée
Robaglia et Patrice Roll
Jour 3, mercredi 19 Novembre 2014 : "NGS"
Matinée
09h00-12h15
Les outils informatiques d’analyse des données issues du séquençage en phase solide
(alignement, identification des mutations) - David Salgado
Après-midi
14h00-17h15
Atelier : Manipulation des données NGS –David Salgado, Gwenaëlle Collod-Béroud,
Jean-Pierre Desvignes, Ghadi Rai
Jour 4, jeudi 20 Novembre 2014 : "Prédictions"
Matinée
09h00-12h15
Outils de prédiction du caractère pathogène des mutations - Christophe Béroud
Après-midi
14h00-17h15
Atelier : De l’identification des mutations à leur interprétation - Christophe Béroud, Pierre
Cau, Gwenaëlle Collod-Béroud, Elise Kaspi, Martin Krahn, Andrée Robaglia et Patrice
Roll
Jour 5, vendredi 21 Novembre 2014 : "miRNA, séquences régulatrices, promoteurs"
Matinée
09h00-12h00
Atelier : Manipulation des données, préparation à l’examen - Christophe Béroud, David
Salgado, Gwenaëlle Collod-Béroud, Jean-Pierre Desvignes, Ghadi Rai
Après-midi
13h30-15h00
Valorisation scientifique – Pierre Cau
15h15-18h00
miRNA, séquences régulatrices et promoteurs – Patrice Bourgeois et Patrice Roll

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