PDF, 2,34 Mo - SREC

Lettre d’information de Novembre 2013 à Mars 2014
LMI Patho-Bios (2)
•
Le 1er Comité de Suivi du Laboratoire Patho-Bios a eu lieu le 30 janvier.
Compte-rendu et recommandations disponibles sur demande.
•
L’Inauguration du Laboratoire Patho-Bios a eu lieu le 31 janvier à Kamboinsé
en présence du Ministre de la Recherche et de l’Innovation Gnissa Konaté et
l’ambassadeur de France au Burkina Faso Gilles Chanson. Compte-rendu et articles
de presse également disponibles sur demande.
•
Convention LMI Patho-Bios INERA et IRD en cours d’amendement
•
Convention LMI Patho-Bios et l’Université de Ouagadougou (en cours)
•
Séminaires LMI :
16 janvier 2014 : WAONGO Antoine, doctorant a présenté son sujet de Thèse intitulé
«Etude bioécologique de Rhyzopertha dominica (Coléoptère: Bostrichidae) et son impact
dans les stocks de sorgho au Burkina Faso»
23 janvier 2014 : TRAORE Fousséni, doctorant a fait une pré-soutenance de sa Thèse
intitulé « Etude de la bioécologie de Maruca vitrata Fabricius (Lepidoptera : Crambidae),
foreuse des gousses de niébé (Vigna unguiculata (L.) WALP.) à l’ouest du Burkina Faso».
28 janvier 2014 : ZIDA W.F.M. Serge, étudiant en Master a présenté son sujet de
Mémoire intitulé : « Identification de marqueurs moléculaires liés au gène de résistance à
la race 1 de Striga gesnérioides (will.) Vatke. chez le niébé (Vigna Unguiculata(L walp.) »
18 mars 2014 : Zara Soutonnoma Nikiema, étudiant en Thèse au Labo de
Phytopathologie, a présenté son projet de recherche intitulé : « Amélioration génétique
du Sorghum bicolor (L.) Moench pour la résistance à Colletotrichum sublineolum (P.)
Henn (anthracnose du sorgho) au Burkina Faso »
25 Mars 2014 : THIO Gilles, doctorant en Génétique et Amélioration des Plantes au
Labo de Phytopathologie de Kamboinsé, a présenté son protocole de recherche intitulé :
« Amélioration génétique de la résistance du niébé (Vigna unguiculata (L.) Walp) à la
maladie des taches brunes (Colletotrichum capsici) au Burkina Faso»
1
8 Avril 2014 : TRAORE Valentin Edgar, doctorant en Génétique et Amélioration des
Plantes au Labo de Virologie et de Biotechnologies Végétales de l’INERA-Kamboinsé, à fait
une pré-soutenance de sa Thèse de Doctorat intitulée : « Marker assisted selection for
rice yellow mottle virus resistance in farmers ‘preferred rice varieties in Burkina Faso».
•
Formations
Atelier LMI Patho-Bios: Initiation au Système d’Information Géographique
Du 3 au_5 Février 2014 à l’IRD-Ouagadougou
FORMATION SIG (E. BONNET) IRD-OUAGADOUGOU-LMI PATHO_BIOS –FEV-2014
Formation initiation à ArcGIS10.1 appliquée aux problématiques du LMI Patho
Bios
La formation SIG proposée par le LMI Patho-Bios pour les chercheurs de l’INERA de
Ouagadougou (11), de Bobo-Dioulasso (5), de l’Université de Ouagadougou (5) et des
chercheurs IRD (2) permettra de débuter une cartographie de nos échantillons au Burkina
Faso. Ainsi des données (identification de pathogènes, population, isolat, race etc..)
concernant les pathogènes seront géoréférencés sur le terrain. Cette formation est une
première initiation qui permet d’ores et déjà d’utiliser le logiciel. Cependant, il apparait
clairement qu’il faudra, en fonction de nos objectifs de recherche, compléter cette formation
à un niveau supérieur pour pouvoir utiliser à plein les potentialités du logiciel et ceux de la
géomatique en général.
La formation a été assurée par Emmanuel BONNET, chercheur en accueil UMI RESILIENCES
236 à Ouagadougou. Elle s'est déroulée du 3 au 5 février 2014 à raison de deux sessions par
jour, l'une le matin, théorique, de 8h à 12h et l'autre plus appliquée l'après-midi de 15h à
17h. 23 personnes ont suivi cette formation au sein de la salle des partenaires de l'IRD sur
leur propre ordinateur. Des licences ArcGIS ont été installées par la DSI Ouagadougou au
début de la formation et supprimées à la fin.
2
Les participants étaient satisfaits de la formation. A noter une forte différence de niveau
concernant la maîtrise de base des outils informatiques (gestion des fichiers, maîtrise d'Excel
en particulier). Les besoins des chercheurs du LMI Patho-Bios devront se centrer sur : un
rappel de l'analyse spatiale réalisée le dernier jour de la formation, un approfondissement en
statistiques spatiales, et une initiation à la télédétection spatiale.
Atelier LMI Patho-Bios: Atelier Protéomique
Du 31 mars au_3 avril 2014 à l’INERA de Kamboinsé
Formation « Initiation à la protéomique appliquée aux problématiques du LMI
Patho-Bios »
Formateurs : Jean-Paul Brizard et Martine Bangratz
Du 31 mars au 3 avril 2014, s’est tenu le premier Atelier Protéomique à l’ INERA de
Kamboinsé, site principal du LMI Patho-Bios. 8 personnes (master 2, doctorants, thésards)
ont été sélectionnées pour participer à cet atelier. Durant ces 4 jours, se sont succédés des
cours théoriques et pratiques. Les participants ont ainsi pu approfondir leurs connaissances
sur les protéines, les interactions Anticorps/Antigènes et se familiariser avec la technique du
Western Blot. Lors de cet atelier, une sensibilisation à l’Hygiène et à la Sécurité au
laboratoire a été dispensée, ainsi qu’un certain nombre de rappels sur le fonctionnement et
l’utilisation des appareils de laboratoire. Le bilan de cet atelier a été très positif. D’ores et
déjà une autre cession est prévue d’ici la fin de l’année pour pouvoir satisfaire la demande.
•
Demandes de financement
Actions Structurantes SREC
Pilier « Renforcement des capacités et de la formation »
3
Koala MOUSTAPHA : Le virus de la panachure jaune du chiendent (IYMV) :
caractérisation pathogénique, moléculaire et aspects épidémiologiques.
(demande: 4950 euros).
Abalo Itolou KASSANKOGNO: Diversité des isolats de Magnaporthe grisea du Burkina
Faso et du Togo: identification des sources de résistances adaptés et des
biopesticides efficaces
(demande:5000 euros).
•
Actions Structurantes SREC
Pilier « Programme de Recherche »
Drissa SEREME : Sustainable improvement of rice production in West Africa by
integrated viruses management using innovating technology in climate change
context
(demande: 7000 euros).
•
Agropolis-Open Science: “Training and Higher Education”: Regional
Bioinformatics and Systems Administration Training Courses for Applications in the
Agronomical Sciences in Southern Universities.
•
Ambassade du Burkina Faso: Ecole thématique régionale en
Bioinformatique Appliquée à la Génomique - Demande d’une subvention SCAC
par les LMI Patho-Bios et Lamivect-
•
Site WEB IRD sur le LMI Patho-Bios:
http://www.ird.fr/la-recherche/laboratoires-mixtes-internationaux-lmi/lmi-patho-biosobservatoire-des-agents-phytopathogenes-en-afrique-de-l-ouest
•
Site WEB SREC sur le LMI Patho-Bios:
http://www.ppr-srec.ird.fr/des-outils-en-reseaux/laboratoires-internationaux/patho-biosobservatoire-des-agents-phytopathogenes-en-afrique-de-l-ouest-biodiversite-et-biosecurite
•
Rayonnement du LMI
C. Brugidou-Présentation du LMI Patho-Bios, Journées du LAPSE (18-19 Février) Dakar.
C. Brugidou-Réunion SREC LMI Patho-Bios, IEOSOL, LAPSE (20 Février) à Dakar (compte
rendu sur demande).
Conférence dispensée par Christophe Brugidou à l’Université de Ouagadougou
« Application des biotechnologies dans la gestion des pathogènes de plantes et
production de protéines d'intérêts » organisé par l’OFAB-Burkina Faso (Institut de
l'Environnement et de Recherches Agricoles (INERA) et la Fondation Africaine pour les
Technologies Agricoles (AATF)).
Interview de Christophe Brugidou : Radio Pulsar 94.8 FM Ouagadougou : le LMI Patho-Bios
et son rôle pour le développement du Burkina Faso.
Campus Mag LR : Présentation du LMI Patho-Bios (Moustapha Koala, Doctorant)
4
http://plus.franceculture.fr/partenaires/pres-sud-de-france/campus-mag-lr-presentation-dulaboratoire-mixte-international-
From 25 to 26 fev. 2014, the United Nations Economic Commission for Africa invites Dr
SEREME Drissa to attend an Expert Workshop on Agricultural Biotechnology for Africa,
organized in collaboration with the Network of African Science Academies (NASAC), the
African Union Commission, the European Academies Science Advisory Council and the
German National Academy of Sciences Leopoldina, with funding from the Germany Ministry
of Education and Research.
At this expert workshop Dr. SEREME has presented a contribution with the title of “Issues for
regulation of agricultural biotechnology in Burkina Faso” with a focus on how his institute’s
work has been enabled/influenced by the Biotechnology framework. At this occasion, he has
also presented the International Joint Laboratory “Phato-Bios” as an examples of
collaboration between Europe and Africa in agricultural R&D. This presentation was one of
the
panel
discussion
topics
during
the
session
about
“Sharing experiences
in research and implications for policy development”.
From 18-21 March 2014, Dr. Drissa SEREME has been invited by FAO to attend the 1st Africa
Congress on Conservation Agriculture organized by the African Conservation Tillage Network
(ACT) in close liaison with partners in Lusaka, Zambia. This congress was held under the
theme “Conservation Agriculture (CA): Building entrepreneurship and resilient farming
systems” and brought together 414 delegates from 42 African and other countries of the
world to share experiences and lessons and facilitate alliances to unblock hindrances to
expanded and scaled-up adoption of CA, especially among the smallholder farming systems
and related industry in Africa. In the Biotechnology and Conservation Agriculture plenary
session, Dr. SEREME has make a presentation about Adoption and Production of Bt
technology in Burkina Faso: Experiences and lessons learned.
5

Download Report