ショートリード次世代シーケンサーの新展開

第 39 回日本分子生物学会年会
共催バイオテクノロジー(ランチョン)セミナー
ショートリード次世代シーケンサーの新展開
日時:2016 年 12 月 2 日(金)11 : 55 ~ 12 : 45
会場:第 4 会場(パシフィコ横浜 会議センター 3F 302) 招待講演
長鎖 DNA 解読:"synthetic", "physical" long read 技術の動向
東京大学 新領域創成科学研究所 メディカルゲノム情報生命専攻
鈴木 穣 先生
昨年、長鎖 DNA 解読技術について技術革新が相次いで報告された、10X Genomics 社が上市した GemCode
では、数十万個の油滴中に個別に封入した長鎖 DNA 分子を個別のオリゴでバーコーディング、イルミナシークエン
サーでのシークエンス読み取り後に、バーコード配列を指標に計算機的に長鎖 DNA 配列を再構成する、いわゆる
"synthetic long read" 法を実現した。一方で、物理的に長鎖 DNA を読み取る "physical long read" においても、
ナノポアシークエンサーがそのシークエンス精度、シークエンス数について性能を飛躍的に向上させている。本講
"synthetic"、"physical" long read のそれぞれの性能を , ヒト疾患遺伝子探索におけるハプロタイプのフェー
演では、
ジング、がんゲノムにおけるコピー数異常、また非モデル生物のゲノムアセンブルの目的に応じて評価し、その有効
性について議論したい。
企業講演
戦略的コラボレーションから生まれる次世代ソリューション
イルミナ株式会社 プロダクトマーケティング部
藤原 鈴子
※本発表後にイルミナ株式会社より製品のご紹介をいたします。
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イルミナ株式会社
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