サンプルモニター大募集 次世代シーケンサによるメタゲノミクス解析

メタゲノミクス解析をもっと簡単に、もっと迅速に!
次世代シーケンサによるメタゲノミクス解析
サンプルモニター大募集
メタゲノム解析の新たなアプローチ法
この機 会に次世代シーケンサの有用性をお試しください!
Ion 16S ™ Metagenomics Kit と Ion PGM ™シーケンサの強力な組み合わせが、メタゲノム解析に新たなアプローチ法を
提示します。Ion 16S ™ Metagenomics Kit は、
Greengenes データベースに登録されている配列の 80% 超をターゲット
とするマルチプレックス PCR プライマーを用いて、細菌の 16S rRNA 遺伝子内の 9 つの超可変領域のうち 7 つを同時
に解析できます。
ION 16S™
METAGENOMICS KIT
My Sample
Tube 1
ION PGM™
SEQUENCER
ION REPORTER™
SOFTWARE
SEQUENCE
ANALYZE
Tube 2
Tube 1: V2, V4, V8
Tube 2: V3, V6–7, V9
SAMPLE
図 1. Ion 16S ™ Metagenomics Solution ワークフロー
ライブラリー作製およびテンプレート調整後、Ion PGM ™ シーケンサを用いて、3.7 時間∼
で 400bp のシー ケンシングランが 完了します。そ の 後、Ion Reporter ™ ソフトウェア
の 16S メタゲノミクスワークフローにより、自動 解 析、アノテーション、および 分 類学
的アサインメントが行われます。
サンプルモニターの募 集はこちらから*
募 集 期間: 2015 年
3 月 2 日(月)∼
2015 年 4 月 24 日(金)
www.lifetechnologies.com/jp-ion16s-monitor
募集件数: 2 件(1 件あたり最大 4 サンプル)** * サンプルは精製 DNA 20ng / 20 µ L 以上でご提供頂き、その後の費用負担はございません。 ** 応募多数の場合は抽選とさせていただきます。
サンプル分析結果ご返却予定: 2015 年 6 月頃
Ion 16S™ Metagenomics Kit
Ion 16S Metagenomics Kit は、 マ ル チ プ レ ッ ク ス
™
PCR 技 術 を 使 用し、細 菌 の 16S rRNA 遺 伝 子 内 の
9 つの超可変領域のうち 7 つを同時に解 析できる新し
い手法です(図 1)
。サンプル量も 1ng ∼のゲノム DNA
からスタートでき、16S rDNA 遺伝子のコピー数は 10 3
図 2. E. coli の 16S rRNA 遺伝子と可変領域を(緑の四角形)と Ion 16S ™ Metagenomics Kit
∼ 10 の範囲で高感度に検出することが可能です。 Ion
のターゲット領域
6
16S Metagenomics Kit は微量のサンプルから簡便か
マル チプレックス PCR 反 応チューブ 1 はアンプリコン V2、V4、V8 を、マル チプレックス PCR
反応チューブ 2 はアンプリコン V3、V6 ∼ 7、V9 をターゲットとして、7 つの可変領域を増幅します。
つ迅速にメタゲノム解析が行えるパワフルな技術です。
PCR アンプリコン長は 209 ∼ 295bp になります。
™
Ion Reporter™ ソフトウェアにより解析も簡単・迅速
Ion Reporter ソフトウェアのメタゲノミクスワークフ
™ ローは、16S rRNA シーケンシングデータのマッピング
およびアノテーション、レポーティングを行えるバイオイ
ンフォマティクスツールです。
迅 速かつ網羅的な微 生物同定を実現するために、最初
のステップ では読み取りデータを、15,000 種 以 上の 全
長 16S rRNA 配列を有する MicroSEQ® ID ライブラリー
にアラインメントし、ここでアライメントされなかった読
み取りデータは次の 400,000 種 以 上のレコードを含む
Greengenes データベースにアラインメントされます。
Ion Reporter ソフトウェアにより、微生物同定を簡単
™
かつ迅速に実施できます。
図 3. Ion Reporter ™ ソフトウェアによる自動解析レポーティング例
Ion Reporter ソフトウェアのメタゲノミクスワークフローにより、熟練を必要とせずに、
™
メタゲノミクス解析を行うことが可能になります。
Ordering information
製品名
サイズ
Ion 16S Metagenomics Kit
100 反応
™
製品番号
価格 *
A26216
¥ 100,000
Ion Plus Fragment Library Kit
10 ライブラリ
4471252
¥ 6 5 ,000
Ion Xpress Barcode Adaptors 1-16 Kit
10 ライブラリ
4471250
¥ 192,000
™
Ion PGM システム テンプレート調整自動化システム付き
™
1式
PGM11-020S2
¥ 9,600,000
* 記載の価格は 2015 年 2 月現在の価格です。消費税は含まれておりません。価格は予告なしに変更する場合がありますので、予めご了承ください。
最新の価格および在庫数は、弊社ホームページ右上の“製品価格と在庫の検索”でご確認いただけます。
研究用にのみ使用できます。診断目的およびその手続上での使用はできません。
本サンプルモニターは日本国内のお客様のみ有効です。
記載の社名および製品名は、弊社または各社の商標または登録商標です。
標準販売条件はこちらをご覧ください。 www.lifetechnologies.com/TC
For Research Use only. Not for use in diagnostic procedures.
© 2015 Thermo Fisher Scientific Inc. All rights reserved.
All trademarks are the property of Thermo Fisher Scientific and its subsidiaries unless otherwise specified.
Printed in Japan. ION123-A1502OB
サーモフィッシャーサイエンティフィック
ライフテクノロジーズジャパン株式会社
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