メタゲノミクス解析をもっと簡単に、もっと迅速に! 次世代シーケンサによるメタゲノミクス解析 サンプルモニター大募集 メタゲノム解析の新たなアプローチ法 この機 会に次世代シーケンサの有用性をお試しください! Ion 16S ™ Metagenomics Kit と Ion PGM ™シーケンサの強力な組み合わせが、メタゲノム解析に新たなアプローチ法を 提示します。Ion 16S ™ Metagenomics Kit は、 Greengenes データベースに登録されている配列の 80% 超をターゲット とするマルチプレックス PCR プライマーを用いて、細菌の 16S rRNA 遺伝子内の 9 つの超可変領域のうち 7 つを同時 に解析できます。 ION 16S™ METAGENOMICS KIT My Sample Tube 1 ION PGM™ SEQUENCER ION REPORTER™ SOFTWARE SEQUENCE ANALYZE Tube 2 Tube 1: V2, V4, V8 Tube 2: V3, V6–7, V9 SAMPLE 図 1. Ion 16S ™ Metagenomics Solution ワークフロー ライブラリー作製およびテンプレート調整後、Ion PGM ™ シーケンサを用いて、3.7 時間∼ で 400bp のシー ケンシングランが 完了します。そ の 後、Ion Reporter ™ ソフトウェア の 16S メタゲノミクスワークフローにより、自動 解 析、アノテーション、および 分 類学 的アサインメントが行われます。 サンプルモニターの募 集はこちらから* 募 集 期間: 2015 年 3 月 2 日(月)∼ 2015 年 4 月 24 日(金) www.lifetechnologies.com/jp-ion16s-monitor 募集件数: 2 件(1 件あたり最大 4 サンプル)** * サンプルは精製 DNA 20ng / 20 µ L 以上でご提供頂き、その後の費用負担はございません。 ** 応募多数の場合は抽選とさせていただきます。 サンプル分析結果ご返却予定: 2015 年 6 月頃 Ion 16S™ Metagenomics Kit Ion 16S Metagenomics Kit は、 マ ル チ プ レ ッ ク ス ™ PCR 技 術 を 使 用し、細 菌 の 16S rRNA 遺 伝 子 内 の 9 つの超可変領域のうち 7 つを同時に解 析できる新し い手法です(図 1) 。サンプル量も 1ng ∼のゲノム DNA からスタートでき、16S rDNA 遺伝子のコピー数は 10 3 図 2. E. coli の 16S rRNA 遺伝子と可変領域を(緑の四角形)と Ion 16S ™ Metagenomics Kit ∼ 10 の範囲で高感度に検出することが可能です。 Ion のターゲット領域 6 16S Metagenomics Kit は微量のサンプルから簡便か マル チプレックス PCR 反 応チューブ 1 はアンプリコン V2、V4、V8 を、マル チプレックス PCR 反応チューブ 2 はアンプリコン V3、V6 ∼ 7、V9 をターゲットとして、7 つの可変領域を増幅します。 つ迅速にメタゲノム解析が行えるパワフルな技術です。 PCR アンプリコン長は 209 ∼ 295bp になります。 ™ Ion Reporter™ ソフトウェアにより解析も簡単・迅速 Ion Reporter ソフトウェアのメタゲノミクスワークフ ™ ローは、16S rRNA シーケンシングデータのマッピング およびアノテーション、レポーティングを行えるバイオイ ンフォマティクスツールです。 迅 速かつ網羅的な微 生物同定を実現するために、最初 のステップ では読み取りデータを、15,000 種 以 上の 全 長 16S rRNA 配列を有する MicroSEQ® ID ライブラリー にアラインメントし、ここでアライメントされなかった読 み取りデータは次の 400,000 種 以 上のレコードを含む Greengenes データベースにアラインメントされます。 Ion Reporter ソフトウェアにより、微生物同定を簡単 ™ かつ迅速に実施できます。 図 3. Ion Reporter ™ ソフトウェアによる自動解析レポーティング例 Ion Reporter ソフトウェアのメタゲノミクスワークフローにより、熟練を必要とせずに、 ™ メタゲノミクス解析を行うことが可能になります。 Ordering information 製品名 サイズ Ion 16S Metagenomics Kit 100 反応 ™ 製品番号 価格 * A26216 ¥ 100,000 Ion Plus Fragment Library Kit 10 ライブラリ 4471252 ¥ 6 5 ,000 Ion Xpress Barcode Adaptors 1-16 Kit 10 ライブラリ 4471250 ¥ 192,000 ™ Ion PGM システム テンプレート調整自動化システム付き ™ 1式 PGM11-020S2 ¥ 9,600,000 * 記載の価格は 2015 年 2 月現在の価格です。消費税は含まれておりません。価格は予告なしに変更する場合がありますので、予めご了承ください。 最新の価格および在庫数は、弊社ホームページ右上の“製品価格と在庫の検索”でご確認いただけます。 研究用にのみ使用できます。診断目的およびその手続上での使用はできません。 本サンプルモニターは日本国内のお客様のみ有効です。 記載の社名および製品名は、弊社または各社の商標または登録商標です。 標準販売条件はこちらをご覧ください。 www.lifetechnologies.com/TC For Research Use only. Not for use in diagnostic procedures. © 2015 Thermo Fisher Scientific Inc. All rights reserved. All trademarks are the property of Thermo Fisher Scientific and its subsidiaries unless otherwise specified. Printed in Japan. ION123-A1502OB サーモフィッシャーサイエンティフィック ライフテクノロジーズジャパン株式会社 本社:〒108-0023 東京都港区芝浦 4-2-8 テクニカルサポート オーダーサポート 営 業 部 0120-477-392 [email protected] TEL:03-6832-6980 FAX:03-6832-9584 TEL:03-6832-9300 FAX:03-6832-9580 facebook.com/LifeTechnologiesJapan www.lifetechnologies.com @LifetechJPN 販売店
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