バイオインフォマティクス演習シラバス 2015 授業科目と単位バイオ

バイオインフォマティクス演習シラバス 2015
授業科目と単位
バイオインフォマティクス演習（講義と演習）
1 単位
配当年次
D1 から D5
授業担当教員
重信秀治（基礎生物学専攻）
E-mail: [email protected]
電話 0564-55-7670
授業の概要
ゲノムインフォマティックスの基礎と応用を、講義と演習を交えながら解説し、プロテオミク
スやトランスクリプトームについても学ぶ。
1) 配列情報の解析法の基本原理と実戦的なスキルを身に付ける。
2) トランスクリプトームやプロテオームデータの解析法の基本原理と実戦的なスキルを身付
ける。
3) ゲノムインフォマティクス研究の最新動向と展望を知る。
授業計画
場所：基礎生物学研究所 1 階
第 4 セミナー室
スケジュール：2015 年度後期 9:00-10:30 10:40-12:10
（午前 2 コマ、講義 6、演習 2
第1回 Introduction to Genomics
第2回 Biological sequence analysis 1
計 8 回）
第3回 Biological sequence analysis 2
第4回 Lab tutorial 1 *演習のため配信なし
第5回 Gene expression and transcriptome
第6回 Proteomics and functional genomics
第7回 Lab tutorial 2 (Biological database) *演習のため配信なし
第8回 Current topics on genome
履修のための要件
予備知識は必要としない。
単位取得の条件と成績評価基準
合否判定は出席率とレポート課題（期末に 1 回）から総合的に判断する。
その他
演習では、授業用のラップトップ PC を用いる。
Syllabus 2015
1．Course Title, style, and credit
“Bioinformatics Practical Course”
Lecture and tutorial
One credit
2．Appropriate grade level and Eligible Departments
All Departments
3．Organizer
Shuji Shigenobu
E-mail: [email protected]
TEL: 0564-55-7670
4．Time Schedule
9:00-10:30 and 11:00-12:30 on Thursday
5．Place
Seminar room 4 1st Floor, NIBB (Myodaiji Area)
6．Prerequisites and Styles
No particular background knowledge is required.
7．Contents
Basic knowledge and skills in analyses of genome, proteome, and transcriptome will be
introduced in lectures and tutorials.
8．Course objectives
The following objectives are attained through letures and hands-on tutorials.
1. To understand basic principles in biological sequence analyses and learn the
practical skills.
2. To understand the theoretical background of transcriptome and proteome data
analysis, and learn the practical skills to analyse these data.
3. To learn current topics and future directions of genomics.
9．Schedule
(1) Introduction to Genomics
(2) Biological sequence analysis 1
(3) Biological sequence analysis 2
(4) Lab tutorial 1
*This is NOT delivered by the remote lecture system
(5) Gene expression and transcriptome
(6) Proteomics and functional genomics
(7) Lab tutorial 2 (Biological database)
*This is NOT delivered by the remote lecture system
(8) Current topics on genome
10．Lecture materials and readings
Laptop computers will be ready and useful database will be introduced on site for the
tutorial.
11．Grades
In addition to sufficient attendance to the lecture, students must complete an
assignment to get credit for the course.

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