LC-MS 差分解析 - かずさDNA研究所

メタボローム受託解析
本解析の特徴
高分解能LC-MS(LTQ-Orbitrap-XL)による精密質量データを、
Thermo Fisher Scientific社製解析ソフトウェア「SIEVE」を用いて解析
することにより低価格化を実現しました。
シンプルなデータで多数試料間の比較解析をされたい場合や、
1試料のみの予備的な測定をされたい場合にも適したメニューです。
サンプルと共にQuality Control試料を測定し、検出された全化合物ピークについて
精密質量データから組成式演算、代謝物DB検索を行い、各サンプル群とQC群との
差分(有意差(p-value)、ピーク面積値の変化率)を算出しいたます。
基本解析
差分解析
サンプル 及び blank試料
分析試料
サンプル、blank 及び QC試料
LTQ-Orbitrap-XL
(Thermo Fisher Scientific社製)
質量分析装置
LTQ-Orbitrap-XL
(Thermo Fisher Scientific社製)
Power Get
(弊所独自開発)
解析ソフトウェア
SIEVE
(Thermo Fisher Scientific社製)
精密質量データ
精密質量データ
推定組成式リスト
データベース検索結果
化合物推定のため
の情報
推定組成式リスト
データベース検索結果
MSMSフラグメント情報
弊所標品実測データとの照合結果
主成分分析結果
主成分分析結果
t検定結果
(2群間の差分の集計結果)
統計解析結果
t検定結果
(各群とQC群の差分の検出結果)
1試料 ¥230,000~
価格
1試料 ¥161,000~
裏面に続く →
LC-MS 差分解析
フルスキャンデータからピークを抽出し、各サンプル群と基準とする群(ここではQC群)
との差分(有意差(p-value)、ピーク面積値の変化率)を検出いたします。
•マススペクトルの相関を基にしたアライメント
特徴
•溶媒ブランクデータを利用したノイズ除去
•同一化合物由来のピークをグルーピング
•同位体パターンを利用した自動組成解析
全化合物ピーク情報、差分検出結果及び主成分分析結果の何れもExcel形式にてご報告いたします。
因子負荷量(loading)
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
化合物ピーク情報
PC1
PC2
0.15
-0.83
-2.74
2.19
1.72
-0.68
-0.13
-3.16
-3.14
-1.41
-4.63
1.27
-0.43
-4.81
-3.92
-2.73
0.04
-4.96
-0.53
-1.16
PC3
-0.29
-0.28
-2.72
-1.06
-0.75
-0.24
-2.33
-1.45
-1.33
-0.61
-1.74
-0.79
-0.21
-0.47
1.26
-1.29
-0.15
-2.09
-0.39
-2.89
PC4
0.08
-0.02
-0.45
2.07
1.34
0.02
-1.35
-0.75
-0.87
0.06
0.04
1.32
-0.05
-0.09
1.34
0.63
-0.03
0.17
0.04
-0.86
PC5
PC6
PC7
PC8
PC9
0.01
-0.03
0.02
0.027299 0.0335056 1.74E-14
-0.04 8.00 -0.05
0.02 0.1017528 0.0125809 4.49E-14
0.79
-1.70
0.67 0.1617318 -1.196587 9.34E-14
6.00
-0.31
0.41
1.20 -1.771038 1.1759416 4.81E-14
-0.10 4.00 0.25
0.79 -1.196804 0.816474 7.49E-15
0.07
0.01
0.03 0.0298833 0.009822 -1.50E-15
0.19 2.00 0.96
-1.11 2.7301114 3.1163397 -3.71E-15
-0.46 0.00 -1.21
-0.54 -0.485371 1.5419368 -2.49E-14
-0.46
-1.48
-0.60 -0.563109 1.738046 8.96E-19
-0.05-2.00 -0.08
0.06 0.0256161 0.3325787 4.51E-17
-0.08
-0.03
0.07 -0.122518 -0.036808 1.37E-16
-4.00
-0.44
0.25
0.95 -1.420651 0.918254 3.66E-17
0.07-6.00 -0.09
0.00 0.0086132 -0.091642 1.24E-16
2.35
0.56
-1.19
-1.23075 0.149056 -3.65E-16
-8.00
0.99
-0.57
-1.59 0.2212029 -0.019371 -2.82E-16
-10.00
-5.00
10.00 -1.75E-16
0.89
0.79
1.29 0.00
1.42401275.000.2472207
0.03
-0.06
0.01
0.0303617 0.0345415 -4.30E-16
PC1(52.8%)
-0.13
-0.05
0.06 -0.128986 -0.015339 -1.93E-16
-0.02
-0.37
0.01 -0.045535 0.1978944 3.65E-16
-0.27
-2.22
0.28
0.120814 0.2265111 -4.55E-16
PC2(14.7%)
通し番号
多変量解析結果
(主成分分析)
差分検出結果
SIEVEを使い、解析結果を閲覧いただくことができます。
*アカウント登録(無料)後1ヶ月間は再解析も可能
追加オプションにて同測定データを用いたPowerGet(弊所開発ソフトウェア)による詳細解析も承っております。
SIEVE閲覧画面
LS-MS 差分解析
価格:1試料 ¥161,000~
納期:分析開始から1ヶ月
詳細はお問い合わせください
お問い合わせ
公益財団法人 かずさDNA研究所
バイオ産業技術支援センター
E-mail: [email protected]
Tel: 0438-52-3947
http://www.biosupport.kazusa.or.jp/index.html