網羅的タンパク質ドッキング解析プログラム「MEGADOCK

網羅的タンパク質ドッキング解析プログラム「MEGADOCK-K」 ソフト講習会のご案内
―― 2014 年 ISLiM バイオスーパーコンピューティング・ソフト講習会シリーズ ―――
次世代生命体統合シミュレーションソフトウェア研究開発プログラム(ISLiM)がスーパーコンピュータ「京」向けに開発したバ
イオスーパーコンピューティング・ソフトの中から、「MEGADOCK-K」の講習会を下記のとおり開催いたします。
ぜひご利用ください (今回、実習はありません)。
** 網羅的タンパク質ドッキング解析プログラム MEGADOCK-K **
タンパク質間相互作用予測について、タンパク質立体構造情報から、表面形状相補性と静電相互作用に基づく単純化した
評価モデルを新規に提案した。FFT を用いて計算量を大きく減じ、大規模並列計算機上で効率的な並列計算が可能。
● MEGADOCK 参考資料 URL: http://www.csrp.riken.jp/2014/2014-10-31-hpci_MEGADOCK.pdf
(2014 年 HPCI システム利用研究課題成果報告会での発表から)
- 主催: 理化学研究所 情報基盤センター
- 共催: HPCI 戦略プログラム 戦略分野 1
- 協賛: バイオスーパーコンピューティング研究会、バイオグリッドセンター関西、都市活力研究所、
産業技術総合研究所 ゲノム情報研究センター(CBRC)
講習会 URL: http://www.csrp.riken.jp/2014/islim-seminar1211.html
記
● 開催日時: 2014 年 12 月 11 日(木) (14:00-16:00) 受付開始 13:30
● 会場: 理化学研究所 東京連絡事務所 東・西会議室
地図 URL: http://www.riken.jp/access/tokyo-map/
(東京都千代田区内幸町 2-2-2 富国生命ビル 23 階 2311 号室)
TEL:03-3580-1981
● 申し込み締切り: 2014 年 12 月 9 日(火)
● 参加定員: 30 名
● 参加申し込み: 末尾の参加申込書に記入の上、
宛先 ([email protected])まで Email で送付ください。定員になりしだい締切ります。
● 参加費: 無料
● 講習会プログラム
開始: 13:30 (受付開始 13:30)
(14:00-15:00) 1. MEGADOCK-K 講義 1 および Q&A
(15:00-16:00) 2. MEGADOCK-K 講義 2 および Q&A
終了予定: 16:00
講師:
松崎 由理 (MEGADOCK-K 開発者、東京工業大学情報生命博士教育院)
内古閑 伸之 (MEGADOCK-K 開発者、中央大学 理工学部)
● 問い合わせ先: ISLiM 研究開発ソフト・アウトリーチ担当 (Email: [email protected])
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宛先: [email protected]
*** MEGADOCK-K 講習会 参加申込書 ***
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