ゲノムネットワークプロジェクト GNP Ex Search ユーザーマニュアル 1 目次 １．GNP Ex Searchの概要 ・・・・・・・・・・・ ２．Search Gene Data ・・・・・・・・・・・ ３．Search Experimental Data ・・・・・・・・ ４．FTP ・・・・・・・・・・・ ５．XML ・・・・・・・・・・・ ６．GNP Platform ・・・・・・・・・・・ ３ ４ ５ ６ ７ ８ 2 １． GNP Ex Searchの概要 GNP Ex Search（図１）は、 ゲノムネットワークプロジェク ト参加研究機関のデータを GeneID、Keywordから検索 することができ、研究機関の 実験データをXML形式でダウ ンロードすることができるシス テムです。 図１．GNP Ex Search 3 ２． Search Gene Data GNP Ex Searchでは、Searchフ レームのSearch Gene Dataタブ （図２①）を選択した状態で GeneIDによる検索ができます。 検索項目のKeyWordは、 GeneSymbol、GeneNameの他、 実験データの全項目に対して行い ます。 図２．トップ画面 ① 検索項目のKeyWord、GeneIDは スペース区切りで複数指定が可 能です。 検索項目のDataCategoryと Organizationは、Ctrlキー （Windows)を押しながら複数指定 が可能です。 4 ３． Search Experimental Data GNP Ex Searchでは、Searchフ レームのSearch Experimental Dataタブ（図３①）を選択した状態 で実験データによる検索ができま ① す。 図３．トップ画面（Search Experimantal Search タブ） 検索項目のKeyWordは、実験 データの全項目に対して行います。 検索項目のKeyWordはスペース 区切りで複数指定が可能です。 検索項目のDataCategoryと Organizationは、Ctrlキー （Windows)を押しながら複数指定 が可能です。 5 ４．FTP Search Gene Dataの検索結果（図４）の Expression Data に表示されている「CHIP」 「PPI」「EXP」をクリックすると、Experimental Dataが表示されます。 図４．ダウンロード画面へのリンク Experimental DataのRaw Dataの「FTP」（図４①）をク リックすると、FTPダウンロー ド画面（図５）が開きます。 図５．FTPダウンロード画面 ① 6 5．XML Search Gene Dataの検索結果（図６）の Expression Data に表示されている「CHIP」 「PPI」「EXP」をクリックすると、Experimental Dataが表示されます。 図６．ダウンロード画面へのリンク Experimental DataのRaw Dataの「FTP」（図６①）をク リックすると、FTPダウンロー ド画面（図7）が開きます。 図７．XML画面 ① 7 ６．GNP Platform Search Gene Dataの検索結果（図８）のGNP Platform の３つのアイコン（図８①）をク リックすると、Genome Network Platform Viewerへリンクします。 図８．GeneList ① 8
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